I.8 Sex linkage

单倍体:性别决定基因(S\s)和与性别决定基因连锁的等位基因(A\a)存在于同一套遗传物质上,其配子结合和减数分裂图示如下:

如果性别是由染色体区域决定的,自然选择会避免在该性染色体区域发生重组(因为重组后会形成以前并不存在的性别),因此自然选择会让该区域的形式本质上与单个等位基因一样(在分离时仅能选择可选的等位基因)。

二倍体:

亲代情况:

Pm为男性x染色体上A的频率,则(1-Pm)为男性x染色体上a的频率;Pf为x女性x染色体上A的频率,(1-Pf)为x女性x染色体上a的频率;

子代情况:

有男有女

女性情况:

男性情况:

所以已知第一代基因型,则第一代的配子概率与亲代配子概率的关系(亲代基因概率和第一代基因概率)为:

如果设定Pm=1,Pf=0,则(通过描点作图,得到)第一代到第八代情况如下:

由图可知,来自父方和母方的A基因频率不会下降,而是趋于一个值。

列出第一代基因差值和亲代基因的差值的关系可知:

第一代基因频率差异小于亲代,即经过一代基因频率差异逐渐变小。

假设随机定义一个p的概率值,它等于Pm和Pf取权重值相加,(基于母方贡献两个x染色体,父方贡献一个x染色体),当检查第一代与亲代时,发现该自定义概率值保持不变(即为收敛值)。

若将Pf构造为函数表达式,则:Pf(0)=0,Pm(0)=1;则该自定义概率值可以计算数值,为:

最后发现该概率值不随时间发生改变。

当决定基因的概率值趋于一致时,此时Pf=Pm,则此时子代的基因型情况如下:

雄性纯合子概率更大,因为雌性纯合需要两个相同等位基因在同一个二倍体中,而雄性只需要一个。

基于以上思路我们可以研究别的性别决定系统:

  1. XX-XO同XX-XY
  2. ZW-ZZ同XY-XX(区别在于性别逆转,雌性XY,雄性XX)eg鸟

3.A haplo-diploid sex determination system, as in Hymenoptera (males coming from unfertilized haploids and females from fertilized eggs)只有单倍体和二倍体之分,所以所有分离位点都可看作是性别连锁的。

Sex linkage的更多相关文章

  1. prototype linkage can reduce object initialization time and memory consumption

    //对象是可变的键控集合, //"numbers, strings, booleans (true and false), null, and undefined" 不是对象的解释 ...

  2. word linkage 选择合适的聚类个数matlab code

    clear load fisheriris X = meas; m = size(X,2); % load machine % load census % % X = meas; % X=X(1:20 ...

  3. externkeyword放到函数体内而导致的linkage问题

    不少人都知道,C/C++语言编程时,假设要引用在别的C/C++文件里定义的变量或函数,必须extern一下,才干使用 另一些人知道,这个extern事实上能够放在函数体内声明,这么做的理由是不想让其它 ...

  4. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

  5. 凝聚法层次聚类之ward linkage method

    凝聚法分层聚类中有一堆方法可以用来算两点(pair)之间的距离:欧式,欧式平方,manhattan等,还有一堆方法可以算类(cluster)与类之间的距离,什么single-linkage.compl ...

  6. RyuBook1.0案例三:REST Linkage

    REST Linkage 该小结主要介绍如何添加一个REST Link 函数 RYU本身提供了一个类似WSGI的web服务器功能.借助这个功能,我们可以创建一个REST API. 基于创建的REST ...

  7. matlab中的linkage和cluster函数

    Linkage: Agglomerative hierarchical cluster tree(凝聚成层次聚类树) 语法: 解释: Z=linkage(x),返回Z,是一个X矩阵中行的分层聚类树(用 ...

  8. chromosome interaction mapping|cis- and trans-regulation|de novo|SRS|LRS|Haplotype blocks|linkage disequilibrium

    Dissecting evolution and disease using comparative vertebrate genomics-The sequencing revolution   s ...

  9. Linkage Disequilibrium|D‘|r2

    I.10 Other Measures of Linkage Disequilibrium 因为D的取值强烈地依赖于人为制定的等位基因频率(PA及PB),所以它不利于LD程度的比较.标准化的不平衡系数 ...

  10. linkage disequilibrium|linkage equilibrium

    I.9 Linkage INDEPENDENCE OF GENOTYPES AT TWO LOCI:若A,B是两个独立位点:PA是基因A的概率,PB是基因B的概率.因为基因A与基因B是相互独立的位点, ...

随机推荐

  1. HDU_2255 二分图最佳完美匹配 KM匈牙利算法

    一开始还没看懂这个算法,后来看了陶叔去年的PPT的实例演示才弄懂 用一个lx[]和ly[]来记录X和Y集合中点的权值,有个定理是 lx[i]+ly[j]==w[i][j](边权值) 则该点是最佳匹配, ...

  2. spring boot 环境配置(profile)切换

    Spring Boot 集成教程 Spring Boot 介绍 Spring Boot 开发环境搭建(Eclipse) Spring Boot Hello World (restful接口)例子 sp ...

  3. 读写锁ReentrantReadWriteLock源代码浅析

    1.简介 并发中常用的ReentrantLock,是一种典型的排他锁,这类锁在同一时刻只允许一个线程进行访问,实际上将并行操作变成了串行操作.在并发量大的业务中,其整体效率.吞吐量不能满足实现的需要. ...

  4. 基于python的小波阈值去噪算法

    https://blog.csdn.net/alwaystry/article/details/52756051 发表于 2018-01-10 16:32:17 嵌入式设计应用 +关注 小波图像去噪原 ...

  5. 理解String的intern()方法

    API文档中的介绍: intern public String intern() Returns a canonical representation for the string object. A ...

  6. 文献阅读报告 - Social LSTM:Human Trajectory Prediction in Crowded Spaces

    概览 简述 文献所提出的模型旨在解决交通中行人的轨迹预测(pedestrian trajectory prediction)问题,特别是在拥挤环境中--人与人交互(interaction)行为常有发生 ...

  7. 【数据结构】单链表介绍及leetcode206题反转单链表python实现

    题目传送门:https://leetcode-cn.com/problems/reverse-linked-list/ 文章目录 单链表介绍 链表 概念 种类 优缺点 单链表(slist) leetc ...

  8. 【每日Scrum】第七天冲刺

    一.计划会议内容 界面ui制作,主界面进度 二.任务看板 三.scrum讨论照片 四.产品的状态 无 五.任务燃尽图  

  9. POJ 2828 线段树活用

    题目大意:依次描述了一个N个人的队伍,每个人所站的序号以及他的价值,依次描述每个人的过程中,存在序号相同的人,表示该人插入到了前一个序号相同的人的前面.最后输出整个队伍的值排列情况. 这个题目确实难以 ...

  10. Go-方法-接口-异常处理-错误处理

    方法 什么是方法? 方法其实就是一个函数,在 func 这个关键字和方法名中间加入了一个特殊的接收器类型.接收器可以是结构体类型或者是非结构体类型.接收器是可以在方法的内部访问的. package m ...