出现这种问题说明bam/cram文件没有进行index.

Samtool能解决这个问题，以bam文件为例，输入以下命令行即可解决问题：

/path/to/your/samtools index file.bam

　　

外显子分析弹错解决方案：Invalid command line: Cannot process the provided BAM/CRAM file(s) because they were not indexed.的更多相关文章

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