转载：http://www.plob.org/2012/12/02/4927.html

一、序列文本的准备

构树之前先将目标基因序列都分别保存为txt文本文件中（或者把所有序列保存在同一个txt文本中,可以用“>基因名称”作为第一行，然后重起一行 编辑基因序列），序列只包含序列字母（ATCG或氨基酸简写字母）。文件名名称可以已经您的想法随意编辑。

二、序列导入到Mega 5软件

（1）打开Mega 5软件，界面如下

（2）导入需要构建系统发育树的目的序列

OK

选择分析序列类型（如果是DNA序列，点击DNA，如果是蛋白序列，点击Protein）

出现新的对话框，创建新的数据文件

选择序列类型

导入序列

导入序列成功。

（3）序列比对分析

点击工具栏中“W”工具，进行比对分析，比对结束后删除两端不能够完全对齐碱基

（4）系统发育分析

关闭窗口，选择保存文件路径，自定义文件名称

三、系统发育树构建

根据不同分析目的，选择相应的分析算法，本例子以N—J算法为例

Bootstrap 选择1000，点击Compute，开始计算

计算完毕后，生成系统发育树。

根据不同目的，导出分析结果，进行简单的修饰，保存

MEGA软件——系统发育树构建方法（图文讲解） 转载的更多相关文章

  1. CentOS 6.3下Samba服务器的安装与配置方法(图文详解)

    这篇文章主要介绍了CentOS 6.3下Samba服务器的安装与配置方法(图文详解),需要的朋友可以参考下   一.简介  Samba是一个能让Linux系统应用Microsoft网络通讯协议的软件, ...

  2. AVL树(一)之 图文解析 和 C语言的实现

    概要 本章介绍AVL树.和前面介绍"二叉查找树"的流程一样,本章先对AVL树的理论知识进行简单介绍,然后给出C语言的实现.本篇实现的二叉查找树是C语言版的,后面章节再分别给出C++ ...

  3. 伸展树(一)之 图文解析 和 C语言的实现

    概要 本章介绍伸展树.它和"二叉查找树"和"AVL树"一样,都是特殊的二叉树.在了解了"二叉查找树"和"AVL树"之后, ...

  4. 【浏览器渲染原理】渲染树构建之渲染树和DOM树的关系（转载 学习中。。。）

    在DOM树构建的同时,浏览器会构建渲染树(render tree).渲染树的节点(渲染器),在Gecko中称为frame,而在webkit中称为renderer.渲染器是在文档解析和创建DOM节点后创 ...

  5. windows Sever 2012下Oracle 12c安装配置方法图文教程

    windows Sever 2012下Oracle 12c安装配置方法图文教程 Oracle 12c安装配置方法图文教程,具体内容如下 1.我们开启虚拟机 2.Windows Sever 2012启动 ...

  6. 在VS2017上使用C#调用非托管C++生成的DLL文件（图文讲解）

    原文:在VS2010上使用C#调用非托管C++生成的DLL文件(图文讲解) 背景 在项目过程中,有时候你需要调用非C#编写的DLL文件,尤其在使用一些第三方通讯组件的时候,通过C#来开发应用软件时,就 ...

  7. 《敏捷软件开发-原则、方法与实践》-Robert C. Martin读书笔记（转）

    Review of Agile Software Development: Principles, Patterns, and Practices 本书主要包含4部分内容,这些内容对于今天的软件工程师 ...

  8. SpringBoot树获取方法总结

    最近项目中有需要获取全国行政区划省-市-区县-乡镇.街道办的树状结构数据,现将自己获取树的方法总结如下,有不到之处,敬请批评指正! 一.全国行政区划数据的整理以及获取 获取地址:https://pan ...

  9. 原生js获取鼠标坐标方法全面讲解-zmq

    原生js获取鼠标坐标方法全面讲解:clientX/Y,pageX/Y,offsetX/Y,layerX/Y,screenX/Y 一.关于js鼠标事件综合各大浏览器能获取到坐标的属性总共以下五种:eve ...

随机推荐

  1. [对对子队]会议记录4.12(Scrum Meeting 3)

    今天已完成的工作 朱骏豪 ​ 工作内容:找到了游戏的背景场景,用PS扣了按钮的图 ​ 相关issue:实现UI的美术需求 实现游戏场景中的必要模型 梁河览 ​ 工作内容:将关卡选择界面和欢迎界面导入项 ...

  2. [no code][scrum meeting] Alpha 15

    项目 内容 会议时间 2020-04-23 会议主题 OCR紧急会议 会议时长 45min 参会人员 PM + OCR组(赵涛,黎正宇) 项目 内容 会议时间 2020-04-24 会议主题 全体测试 ...

  3. 攻防世界 杂项14.Erik-Baleog-and-Olaf

    下载解压后用notepad++打开 发现是一个PNG的图片文件,该后缀,再用Stegsolve打开看一下, 发现一个残缺二维码,果断在线PS补全 扫码得到flag flag{#justdiffit}

  4. ASP.NET Core 学习笔记 第四篇 ASP.NET Core 中的配置

    前言 说道配置文件,基本大多数软件为了扩展性.灵活性都会涉及到配置文件,比如之前常见的app.config和web.config.然后再说.NET Core,很多都发生了变化.总体的来说技术在进步,新 ...

  5. 旋转数组的最小数字 牛客网 剑指Offer

    旋转数组的最小数字 牛客网 剑指Offer 题目描述 把一个数组最开始的若干个元素搬到数组的末尾,我们称之为数组的旋转. 输入一个非减排序的数组的一个旋转,输出旋转数组的最小元素. 例如数组{3,4, ...

  6. JAVA笔记1__基本数据类型/输入输出/随机数/数组

    /**八种基本数据类型 boolean byte short int long char float double */ public class test1{ public static void ...

  7. linux下测试读写

    1.测/目录所在磁盘的纯写速度: time dd if=/dev/zero bs=1024 count=1000000 of=/1Gb.file 2.测/目录所在磁盘的纯读速度: time dd if ...

  8. Laravel/Lumen 分组求和问题 where groupBy sum

    在Laravel中使用分组求和,如果直接使用Laravel各数据库操作方法,应该会得出来如下代码式: DB::table('table_a') ->where('a','=',1) ->g ...

  9. 组件通过props属性传值

    组件之间的传值 组件是一个单独功能模块的封装,有属于自己的data和methods,一个组件的 data 选项必须是一个函数 为什么必须是函数:因为只有当data是函数时,不同实例调用同一个组件时才会 ...

  10. 一看就懂的IdentityServer4认证授权设计方案

    查阅了大多数相关资料,总结设计一个IdentityServer4认证授权方案,我们先看理论,后设计方案. 1.快速理解认证授权 我们先看一下网站发起QQ认证授权,授权通过后获取用户头像,昵称的流程. ...