test.pyx文件:

from cython.parallel cimport parallel
from openmp cimport omp_get_thread_num cpdef void long_running_task1() noexcept nogil:
while True:
pass cpdef void long_running_task2() noexcept nogil:
while True:
pass def do_two_tasks():
cdef int thread_num
with nogil, parallel(num_threads=2):
thread_num = omp_get_thread_num()
if thread_num == 0:
long_running_task1()
elif thread_num == 1:
long_running_task2() do_two_tasks()

cython的编译文件:

test_setup.py

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize ext_modules = [
Extension(
"test",
["test.pyx"],
extra_compile_args=['-fopenmp'],
extra_link_args=['-fopenmp'],
)
] setup(
name = 'test v1',
ext_modules = cythonize(ext_modules,
#compiler_directives={'language_level' : "3"}
# or "2" or "3str"
),
)

编译test.pyx:

python test_setup.py build_ext --inplace

报错:

undefined symbol: omp_get_thread_num

修改代码:添加一行内容:cimport openmp

cimport openmp
from cython.parallel cimport parallel
from openmp cimport omp_get_thread_num cpdef void long_running_task1() noexcept nogil:
while True:
pass cpdef void long_running_task2() noexcept nogil:
while True:
pass def do_two_tasks():
cdef int thread_num
with nogil, parallel(num_threads=2):
thread_num = omp_get_thread_num()
if thread_num == 0:
long_running_task1()
elif thread_num == 1:
long_running_task2() do_two_tasks()

问题解决:

运行效果:

成功达到200%的进程CPU使用率。

python高性能计算:cython使用openmp并行 —— 报错:undefined symbol: omp_get_thread_num的更多相关文章

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