P1140 相似基因 这个和之前有一个题目特别像 dp
题目背景
大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。
在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。
题目描述
两个基因的相似度的计算方法如下:
对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,例如:
这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:
那么相似度就是:(−3)+5+5+(−2)+(−3)+5+(−3)+5=9(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9(−3)+5+5+(−2)+(−3)+5+(−3)+5=9。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:
相似度为:(−3)+5+5+(−2)+5+(−1)+5=14(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14(−3)+5+5+(−2)+5+(−1)+5=14。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。
输入输出格式
输入格式:
共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T四个字母。1≤1 \le 1≤序列的长度≤100 \le 100≤100。
输出格式:
仅一行,即输入基因的相似度。
输入输出样例
7 AGTGATG
5 GTTAG
14 这个题目和之前写的比较像,不过预处理有点不一样,就是把ATGC-换成了1 2 3 4 0,我觉得这样子比较好,我不是很会举一反三,做完这个题目之后,对这种类型的题目有了一定的思考。
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <algorithm>
#include <iostream>
#define inf 0x3f3f3f3f
using namespace std;
typedef long long ll;
int sum[5][5]={{5,-1,-2,-1,-3},
{-1,5,-3,-2,-4},
{-2,-3,5,-2,-2},
{-1,-2,-2,5,-1},
{-3,-4,-2,-1,0}
};
int dp[110][110];
int tras(char s)
{
if (s == 'A') return 0;
if (s == 'C') return 1;
if (s == 'G') return 2;
if (s == 'T') return 3;
if (s == '-') return 4;
}
int min_(int x, int y, int z)
{
int exa = max(x, y);
int ans = max(exa, z);
return ans;
} int main()
{
int lena, lenb;
char a[110], b[110];
cin >> lena >>(a+1) >> lenb >> (b+1);
for (int i = 1; i <= lena; i++)
{
int x = tras(a[i]);
dp[i][0] = sum[x][4] + dp[i - 1][0];
}
for (int i = 1; i <= lenb; i++)
{
int x = tras(b[i]);
dp[0][i] = sum[4][x] + dp[0][i - 1];
}
for (int i = 1; i <= lena; i++)
{
for (int j = 1; j <= lenb; j++)
{
int p = tras(a[i]);
int q = tras(b[j]);
dp[i][j] = min_(dp[i-1][j]+sum[4][p],dp[i][j-1]+sum[4][q],dp[i-1][j-1]+sum[p][q]);//这里要注意是加sum[4][i]这个i要注意是什么
}
}
printf("%d\n", dp[lena][lenb]);
return 0;
}
P1140 相似基因 这个和之前有一个题目特别像 dp的更多相关文章
- 洛谷P1140 相似基因 (DP)
洛谷P1140 相似基因 题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. ...
- P1140 相似基因(字符串距离,递推)
题目链接: https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140 题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C, ...
- P1140 相似基因 (dp)
题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务 ...
- P1140 相似基因
题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究 ...
- luogu P1140 相似基因
题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究 ...
- P1140 相似基因 (动态规划)
题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究 ...
- 洛谷P1140 相似基因(线性DP)
题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类 ...
- 【洛谷4657】[CEOI2017] Chase(一个玄学的树形DP)
点此看题面 大致题意: 有一棵树,树上编号为\(i\)的节点上有\(F_i\)个铁球,逃亡者有\(V\)个磁铁,当他在某个节点放下磁铁时,与这个节点相邻的所有节点上的铁球都会被吸引到这个节点.然后一个 ...
- 洛谷P1140 相似基因【线性dp】
题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140 题意: 给定两串基因串(只包含ATCG),在其中插入任意个‘-’使得他们匹配.(所以一共是5种字符) 这5 ...
随机推荐
- JQuery ajax的使用
JQuery 真的是好东西 $.ajax({ type: "post", url: "/DataCheck", ...
- 在SoapUI中模拟用户操作
SoapUI作为一款接口测试工具,具有极大的灵活性和拓展性.它可以通过安装插件,拓展其功能.Selenium作为一款Web自动化测试插件可以很好的与SoapUI进行集成.如果要在SoapUI中模拟用户 ...
- [angularjs] angularjs系列笔记(七)HTML DOM
AngularJs为HTML DOM元素的属性提供了绑定数据的指令 ng-disabled指令 ng-disabled指令直接绑定数据到HTML元素的disabled属性 ng-show指令 ng-s ...
- 26.QT-模型视图之自定义委托
在上一章学习 25.QT-模型视图 后,本章接着学习视图委托 视图委托(Delegate)简介 由于模型负责组织数据,而视图负责显示数据,所以当用户想修改显示的数据时,就要通过视图中的委托来完成 视图 ...
- 【转】消除代码中的 if-else/switch-case
在很多时候,我们代码中会有很多分支,而且分支下面的代码又有一些复杂的逻辑,相信很多人都喜欢用 if-else/switch-case 去实现.做的不好的会直接把实现的代码放在 if-else/swit ...
- element-ui 时间日期选择器格式化后台需要的格式
<el-date-picker v-model="startTime" type="datetime" format="yyyy-MM-dd H ...
- css 表单标签两端对齐
来自:http://demo.doyoe.com/css3/justify/justify-form.htm 侵删 <!DOCTYPE html> <html lang=" ...
- 小tips:JS之break,continue和return这三个语句的用法
break语句 break语句会使运行的程序立刻退出包含在最内层的循环或者退出一个switch语句.由于它是用来退出循环或者switch语句,所以只有当它出现在这些语句时,这种形式的break语句才是 ...
- POJ1509 Glass Beads(最小表示法 后缀自动机)
Time Limit: 3000MS Memory Limit: 10000K Total Submissions: 4901 Accepted: 2765 Description Once ...
- 广州地区.net相关活动的文章
此文正在更新中... 复活广州.net俱乐部 office365的开发者训练营,免费,在微软广州举办 被低估的.net(上) - 微软MonkeyFest 2018广州分享会活动回顾