python3 lcs 最大公共子序列
抛出问题:
假定字符串 s1 = 'BDCABA', s2 = 'ABCBDAB',求s1和s2的最大公共子序列。
问题分析:
我们想要求出s1和s2的最大公共子序列,我们可以用c(i,j)表示s1(i)和s2(j)最大公共子序列的长度,
假定c(i,j) = m,
如果:s1[ i ]和s2[ j ]相等,那么推出c(i,j) = c(i-1,j-1) + 1,
如果:s1[ i ] 和 s2[ j ]不相等,那么得到c(i,j) = max(c(i,j-1),c(i-1,j))
总结为公式就是:

画成表格更清楚,也就是如下图,表格的数即为当前的最大公共子序列的值,箭头即为该结果是怎么得来的
例如第5行,第5列,因为第5列的c和第5行c相等,所以就等于,第4行,第4列的值+1等到2

得到了这个值列表,就可以通过回溯的方法,从最后一个值,倒着按照箭头的方向,依次记录每个相等的值(也就是方向是左上的值),得到的结果就是我们要求的最终结果
代码实现:
# -*- coding:utf-8 -*-
# 日期:2018/6/9 15:44
# Author:小鼠标
# 求最长公共子序列
from numpy import *
s1 = 'BDCABA'
s2 = 'ABCBDAB' def val_list(s1,s2):
# 两个字符串的长度
len_s1 = len(s1) + 1
len_s2 = len(s2) + 1
# 方向列表
direction_list = []
# 生成len_s2+1行len_s1+1列的全0列表
res = zeros((len_s2,len_s1))
direction = zeros((len_s2,len_s1))
# print(res_list)
for i in range(0, len_s2-1):
for j in range(0, len_s1-1):
#判断是否相等
if s1[j] == s2[i]:
res[i + 1, j + 1] = res[i, j] + 1
# 1左上 2 上 3左
direction[i + 1, j + 1] = 1
else:
if res[i + 1, j] > res[i, j + 1]:
res[i + 1, j + 1] = res[i + 1, j]
direction[i + 1, j + 1] = 3
else:
res[i + 1, j + 1] = res[i, j + 1]
direction[i + 1, j + 1] = 2
return res,direction
res ,direction= val_list(s1,s2)
#方向列表 1左上 2 上 3左
# [[0. 0. 0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 2. 2. 2. 1. 3. 1.]
# [0. 1. 3. 3. 2. 1. 3.]
# [0. 2. 2. 1. 3. 2. 2.]
# [0. 1. 2. 2. 2. 1. 3.]
# [0. 2. 1. 2. 2. 2. 2.]
# [0. 2. 2. 2. 1. 2. 1.]
# [0. 1. 2. 2. 2. 1. 2.]] #最大子序列的值列表
# [[0. 0. 0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 0. 0. 0. 1. 1. 1.]
# [0. 1. 1. 1. 1. 2. 2.]
# [0. 1. 1. 2. 2. 2. 2.]
# [0. 1. 1. 2. 2. 3. 3.]
# [0. 1. 2. 2. 2. 3. 3.]
# [0. 1. 2. 2. 3. 3. 4.]
# [0. 1. 2. 2. 3. 4. 4.]] #回溯 递归求出结果
global s_res
s_res = ''
def Lcs_fun(s,res_list,i,j):
if res_list[i,j] == 3:
Lcs_fun(s,res_list,i,j-1) elif res_list[i,j] == 2:
Lcs_fun(s,res_list,i-1,j) elif res_list[i,j] == 1:
Lcs_fun(s,res_list,i-1,j-1)
global s_res
s_res += s[i-1]
else:
return
Lcs_fun(s2,direction,len(s2),len(s1))
print(s_res)
这块很容易就看晕了,仔细看,应该能看懂
python3 lcs 最大公共子序列的更多相关文章
- LCS最大公共子序列问题
在生物应用中,经常需要比较两个(或多个)不同生物体的DNA, 例如:某种生物的DNA可能为S1=ACCGGTCGAGTGCGCGGAAGCCGGCCGAA, 另一种生物的DNA可能为S2=GTCGTT ...
- LCS最大公共子序列【转载】
在两个字符串中,有些字符会一样,可以形成的子序列也有可能相等,因此,长度最长的相等子序列便是两者间的最长公共字序列,其长度可以使用动态规划来求. 以s1={1,3,4,5,6,7,7,8},s2={3 ...
- 动态规划之LCS(最大公共子序列)
#include <stdio.h> #include <string.h> int b[50][50]; int c[50][50]; int length = 0; voi ...
- Poj1159 Palindrome(动态规划DP求最大公共子序列LCS)
一.Description A palindrome is a symmetrical string, that is, a string read identically from left to ...
- Advanced Fruits (最大公共子序列的路径打印)
The company "21st Century Fruits" has specialized in creating new sorts of fruits by trans ...
- hdu 1243 反恐训练营(dp 最大公共子序列变形)
题目:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1243 d[i][j] 代表第i 个字符与第 j 个字符的最大的得分.,, 最大公共子序列变形 #inclu ...
- spoj Longest Common Substring (多串求最大公共子序列)
题目链接: https://vjudge.net/problem/SPOJ-LCS 题意: 最多10行字符串 求最大公共子序列 数据范围: $1\leq |S| \leq100000$ 分析: 让他们 ...
- 最大公共子序列(Runtime faster than 92.73% of Python3)
其中的算法思想只是较为简单的动态规划,过去各种各样的考试写过很多次C/C++版本的,最近开始用Python做leetcode中的题目时遇到了该题目,很常规的做法竟然得到了意想不到的速度,但内存占用较差 ...
- POJ - 2250 Compromise (LCS打印序列)
题意:给你两个单词序列,求出他们的最长公共子序列. 多组数据输入,单词序列长度<=100,单词长度<=30 因为所有组成LCS的单词都是通过 a[i] == b[j] 更新的. 打印序列的 ...
随机推荐
- UVa10129(还没ac)各种re,o(╥﹏╥)o
这是一道欧拉回路题 欧拉回路:就是一个路径包括每条边恰好一次. 判断是否满足欧拉回路.首先是图是联通的.其次图中每个点的入度等于出度.如果是欧拉路径的话,满足奇点只能等于2或0,并且对于有向图,奇点的 ...
- Map<String,Integer>acount字符串出现的次数
- for和for in区别
for ... in 循环中的代买每执行一次,就会对数组的元素或者对象的属性进行一次循环操作. eg:应该用在非数组对象的遍历上,使用for-in进行循环也被称为“枚举”. for (变量 in 对象 ...
- react安装
1. npm install -g create-react-app 2. create-react-app my-app 3. cd my-app npm start 4.浏览器打开 http:/ ...
- XSS学习(三)挖掘思路
HTML标签之间 <div id="body"> [输出点] </div> payload:<script>alert(1)</scrip ...
- robot framework类型强制转换
在测试过程中需要比较两个数值是否存在一定的关系 1.若新增一个数据,删除一个数据,判断他是否新增成功或者删除成功,除了判断本身数据成功显示与不显示之外,可以通过总数间接去判断是否成功 A)新增删除前获 ...
- scipy 的K-means
#导入相应的包 import scipy import scipy.cluster.hierarchy as sch from scipy.cluster.vq import vq,kmeans,wh ...
- D# 语法
这篇文章 随意 的 记录 关于 D# 语法的想法 . template 和 interface 同时作为一等公民 D# 是程序员的语言,不需要太多包装和修饰, D# 是 简单的, 编译器 和 ID ...
- A*搜索详解(2)——再战觐天宝匣
书接上文.在坦克寻径的,tank_way中,A*算法每一步搜索都是选择F值最小的节点,步步为营,使得寻径的结果是最优解.在这个过程中,查找最小F值的算法复杂度是O(n),这对于小地图没什么问题,但是对 ...
- .net core2.0获取host的方法
Example there's an given url: http://localhost:4800/account/login 获取整个url地址: 在页面(cstml)中 Microsoft.A ...