Python3 kmeans 聚类算法
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed Jan 10 19:18:56 2018 @author: markli
"""
import numpy as np;
'''
kmeans 算法实现
算法原理
1、随机选择k个点作为聚类中心点,进行聚类
2、求出聚类后的各类的 中心点
3、由中心点作为新的聚类中心点,再次进行聚类
4、比较前后两次的聚类中心点是否发生变化,若没有变化则停止,否则重复2,3,4
''' def Kmeans(X,k,maxiter):
'''
使用Kmeans均值聚类对数据集Data进行聚类
X 数据集
k 聚类中心个数
maxiter 最大迭代次数
'''
m,n = X.shape;
#向数据集中添加一列,用来存放类别号
Dataset = np.zeros((m,n+1));
Dataset[:,:-1] = X; #随机选取k 个聚类中心
randomCenterIndex = np.random.randint(m,size=k);
center = Dataset[randomCenterIndex];
center[:,-1] = range(1,k+1); #初始聚类
oldCenter = np.copy(center);
DataClass(Dataset,center);
center = getCenter(Dataset,k); itertor = 1;
while not isStop(oldCenter,center,itertor,maxiter):
oldCenter = np.copy(center);
DataClass(Dataset,center);
center = getCenter(Dataset,k);
itertor = itertor + 1;
print("数据集聚类结果",Dataset);
print("聚类中心点",center); def DataClass(Dataset,center):
'''
对数据集进行聚类或者类标签更新
Dataset 数据集
center 聚类中心点 最后一列为聚类中心点的分类号
'''
n = Dataset.shape[0];
k = center.shape[0];
for i in range(n):
lable = center[0,-1];
mindistance = np.linalg.norm(Dataset[i,:-1]-center[0,:-1],ord=2);
for j in range(1,k):
distance = np.linalg.norm(Dataset[i,:-1]-center[j,:-1],ord=2);
if(distance < mindistance):
mindistance = distance;
lable = center[j,-1];
Dataset[i,-1] = lable; def getCenter(Dataset,k):
'''
获得数据集的k个聚类中心,数据集的最后一列是当前的分类号
Dataset 数据集
k 聚类中心点个数
'''
center = np.ones((k,Dataset.shape[1]));
for i in range(1,k+1):
DataSubset = Dataset[Dataset[:,-1] == i,:];
center[i-1] = np.mean(DataSubset,axis=0);
return center; def isStop(oldCenter,newCenter,itertor,maxiter):
'''
判断是否停止
oldCenter 前一次聚类的聚类中心
newCenter 新产生的聚类中心
itertor 当前迭代次数
maxitor 最大迭代次数
''' if(itertor >= maxiter):
return True; return np.array_equal(oldCenter,newCenter); X = np.array([[1,1],[2,1],[4,3],[5,4]]);
print(X.shape);
Kmeans(X,2,10);
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