BSA(Bulked Segregant Analysis)又称混合群体分离分析法,是利用极端性状进行功能基因挖掘的一种方法。主要思想是将两个具有极端性状的群体进行混池测序,比较两个群体在多态位点(SNP)的Allele Frequency(AF)是否具有显著差异。以植物株高性状为例,收集株高处于两个极端的样本分别混池测序,通过全基因组扫描,找到AF具有显著差异的位点,然后通过相关研究结果,对这些位点进行筛选,找到影响株高的功能位点。​

BSA在1991年就被提出(Giovannoni et al., 1991; Michelmore et al., 1991),只不过当时使用的标记不是SNP而是RAPD和RFLPs等传统标记。随着二代测序的发展,SNP标记的开发和测序成本的下降,使BSA技术成为QTL定位的有力工具。​

最近在BSA技术上的出色工作,主要为日本Iwate Biotechnology Research Center的一个团队。他们开发出了MutMap(Abe, A. et al., 2012)、QTL-seq(Takagi, H. et al., 2013)、MutMap+(R Fekih et al., 2013)、MutMap-Gap(Takagi, H. et al., 2013)等。​​​

。。。。。。

文章来源:http://blog.sina.com.cn/s/blog_14cce7aed0102vq2p.html

BSA混合分离分析法的更多相关文章

  1. .NET平台开源项目速览(11)KwCombinatorics排列组合使用案例(1)

    今年上半年,我在KwCombinatorics系列文章中,重点介绍了KwCombinatorics组件的使用情况,其实这个组件我5年前就开始用了,非常方便,麻雀虽小五脏俱全.所以一直非常喜欢,才写了几 ...

  2. atitit.基于http json api 接口设计 最佳实践 总结o7

    atitit.基于http  json  api 接口设计 最佳实践 总结o7 1. 需求:::服务器and android 端接口通讯 2 2. 接口开发的要点 2 2.1. 普通参数 meth,p ...

  3. PL-SQL 存储函数和存储过程

     PL-SQL 存储函数和存储过程 ORACLE 提供能够把PL/SQL 程序存储在数据库中,并能够在不论什么地方来执行它.这样就叫存储过程或函数. 过程和函数统称为PL/SQL子程序.他们是被命 ...

  4. oracle 函数的创建和调用

    以下已经测试通过 创建函数: create or replace function get_annual_sal(in_name varchar2) return number is annual_s ...

  5. oracle函数创建及调用

    创建函数的语法如下: CREATE [OR REPLACE] FUNCTION function_name[ (argment [ { IN | OUT | IN OUT } ] Type , arg ...

  6. SQL记录-PLSQL过程

    PL/SQL过程   子程序是一个程序单元/模块执行特定的任务.这些子程序被组合以形成更大的程序.这基本上是被称为“模块化设计”.子程序可以调用由另一个子程序或程序被称为调用程序. 子程序可以创建: ...

  7. Oracle 11g调用函数几种常用方法

    1. 该函数接受3个可选参数,返回3个数字的和 CREATE OR REPLACE FUNCTION add_three_numbers ( a NUMBER:=0, b NUMBER:=0, c N ...

  8. CAD&CG GDC 2018大会论文录用名单

    Section 1 增强现实与图形学: 报告时间:2018-8-25 14:00-15:30 报告地点:会议室1 P000009 基于增强现实的产品质量信息传递方法 P000104 重彩画的风格转移 ...

  9. oracle数据库之存储函数和过程

    一.引言     ORACLE 提供可以把 PL/SQL 程序存储在数据库中,并可以在任何地方来运行它.这样就叫存储过程或函数.过程和函数统称为 PL/SQL 子程序,他们是被命名的 PL/SQL 块 ...

随机推荐

  1. [iOS dispatch_once创建单例]

    自苹果引入了Grand Central Dispatch (GCD)(Mac OS 10.6和iOS4.0)后,创建单例又有了新的方法,那就是使用dispatch_once函数,当然,随着演进的进行, ...

  2. lbs(查看附近的人),看看社交软件如何实现查看附近的人

    最近在做一款移动端棋牌游戏,为了进一步提高用户体验.拉近玩家的距离,我们决定在游戏中加入好友功能,而对于体验好友功能的玩家来说,要是玩牌的时候可以看看附近都有谁在玩牌,跟他们交流交流玩牌心得什么的无疑 ...

  3. OC冒泡排序

    NSMutableArray *p = [[NSMutableArray alloc] initWithObjects:@"3",@"5",@"4&q ...

  4. System.IO.Directory.Delete目录删除

    在程序运行的时候,如果直接获取一个目录路径,然后执行删除(包括子目录及文件): System.IO.Directory.Delete(path,true); 或者 System.IO.Director ...

  5. 【项目】Http请求在NSMutableURLRequest添加HttpBody的字典params属性

    在请求头中加入字典集合的Body,首先把字典转换成json,然后json转换成NSData,然后加入到HTTPBody中,我有已下写法 // 参数paramsNSDictionary * params ...

  6. 一个叫<NameValuePair>的东西~~~

    public String getInviteRelation(String phone){ String url = PropertiesUtil.getPropertyValue("HH ...

  7. struts2文件目录结构

    apps 文件夹包含了多个 example 示例应用的压缩包. docs 文件夹包含了 struts 官方的帮助文档. lib 文件夹包含了 struts 提供的类库 jar 包. src 文件夹包含 ...

  8. JS-DOM2级事件对象跨浏览器处理(已封装)

    var eventUill = { //添加事件 addHander: function(element, type, handler) { if(element.addEventListener) ...

  9. wpf comboBox取值问题

    这是获取值后台代码 private void button1_Click(object sender, RoutedEventArgs e)        {            combBox = ...

  10. 在C#中使用官方驱动操作MongoDB

    MongoDB的官方驱动下载地址:https://github.com/mongodb/mongo-csharp-driver/releases 目前最新的版本是2.10,支持.NET 4.5以上.由 ...