HMM(隐马尔科夫模型)基本原理及其实现


HMM基本原理

Markov链:如果一个过程的“将来”仅依赖“现在”而不依赖“过去”,则此过程具有马尔可夫性,或称此过程为马尔可夫过程。马尔可夫链是时间和状态参数都离散的马尔可夫过程。HMM是在Markov链的基础上发展起来的,由于实际问题比Markov链模型所描述的更为复杂,观察到的时间并不是与状态一一对应的,而是通过一组概率分布相联系,这样的模型称为HMM。HMM是双重随机过程:其中之一是Markov链,这是基本随机过程,它描述状态的转移,是隐含的。另一个随机过程描述状态和观察值之间的统计对应关系,是可被观测的。

HMM的定义:

HMM实际上是分为两个部分的,一是马尔可夫链,由参数,A描述,它利用一组与概率分布相联系的状态转移的统计对应关系,来描述每个短时平稳段是如何转变到下一个短时平稳段的,这个过程产生的输出为状态序列;二是一个随机过程,描述状态与观察值之间的统计关系,用观察到的序列来描述隐含的状态,由B描述,其产生的输出为观察值序列。

HMM根据其结构的不同可以分为多种类型。根据状态转移概率矩阵的不同,HMM可分为各态遍历模型、从左到右模型、并行路径从左到右模型和无跳转从左到右模型等。根据观察值概率不同,HMM可分为离散HMM、半连续HMM、连续HMM等。

下图是一个典型的HMM:

HMM有三个典型的问题:

  • 已知模型参数,计算某一特定输出序列的概率,通常使用forward算法解决。
  • 已知模型参数,寻找最可能的能产生某一特定输出序列的隐含状态的序列,通常使用Viterbi算法解决。
  • 已知输出序列,寻找最可能的状态转移以及输出概率,通常使用Baum-Welch算法以及Reversed Viterbi算法解决。

HMM的实现

C语言版:

  1、 HTK(Hidden Markov Model Toolkit)

  HTK是英国剑桥大学开发的一套基于C语言的隐马尔科夫模型工具箱,主要应用于语音识别、语音合成的研究,也被用在其他领域,如字符识别和DNA排序等。HTK是重量级的HMM版本。

  HTK主页:http://htk.eng.cam.ac.uk/

  2、 GHMM Library

  The General Hidden Markov Model library (GHMM) is a freely available LGPL-ed C library implementing efficient data structures and algorithms for basic and extended HMMs.

  GHMM主页:http://www.ghmm.org/

  3、 UMDHMM(Hidden Markov Model Toolkit)

  Hidden Markov Model (HMM) Software: Implementation of Forward-Backward, Viterbi, and Baum-Welch algorithms.

  这款属于轻量级的C语言HMM版本。

  UMDHMM主页:http://www.kanungo.com/software/software.html

C++版:

  1、http://www.cs.ualberta.ca/~lindek/hmm.htm

  2、http://www.shokhirev.com/nikolai/abc/alg/hmm/hmm.html

  以上两个是C++版本的,但是实现的是离散型的HMM。

Java版:

  Jahmm Java Library (general-purpose Java library):

  Jahmm (pronounced “jam”), is a Java implementation of Hidden Markov Model (HMM) related algorithms. It’s been designed to be easy to use (e.g. simple things are simple to program) and general purpose.

  Jahmm主页:http://code.google.com/p/jahmm/

Python版:

  http://www.biocomp.unibo.it/piero/PHMM/

Malab版:

  Hidden Markov Model (HMM) Toolbox for Matlab:This toolbox supports inference and learning for HMMs with discrete outputs (dhmm’s),

Gaussian outputs (ghmm’s), or mixtures of Gaussians output (mhmm’s).

  Matlab-HMM主页:http://www.cs.ubc.ca/~murphyk/Software/HMM/hmm.html

Common Lisp版:

  CL-HMM Library (HMM Library for Common Lisp):

  Simple Hidden Markov Model library for ANSI Common Lisp. Main structures and basic algorithms implemented. Performance speed comparable to C code. It’s licensed under LGPL.

  CL-HMM主页:http://www.ashrentum.net/jmcejuela/programs/cl-hmm/

Haskell版:

  The hmm package (A Haskell library for working with Hidden Markov Models):A simple library for working with Hidden Markov Models. Should be usable even by people who are not familiar with HMMs. Includes implementations of Viterbi’s algorithm and the forward algorithm.

  Haskell-HMM主页:http://hackage.haskell.org/cgi-bin/hackage-scripts/package/hmm

CDHMM C++版:

  连续HMM的C++实现:CHMM.rar

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