题面

题解

对字符串一脸懵的我肯定只能用$FFT$这种暴力方法水过啊。。。

将后面那个字符串翻转一下,对$\text{AGCT}$分别统计,用$FFT$就可以啦

代码

#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<cctype>
#include<cmath>
#include<algorithm>
#define RG register const int maxn(200010);
const double pi(acos(-1));
const char DNA[] = "AGCT";
struct complex { double x, y; } A[maxn], B[maxn];
inline complex operator + (const complex &lhs, const complex &rhs)
{ return (complex) {lhs.x + rhs.x, lhs.y + rhs.y}; }
inline complex operator - (const complex &lhs, const complex &rhs)
{ return (complex) {lhs.x - rhs.x, lhs.y - rhs.y}; }
inline complex operator * (const complex &lhs, const complex &rhs)
{
return (complex) {lhs.x * rhs.x - lhs.y * rhs.y,
lhs.y * rhs.x + lhs.x * rhs.y};
} char C[maxn], S[maxn];
int n, m, ans[maxn], N, r[maxn], P, T;
template<int opt> void FFT(complex *p)
{
for(RG int i = 1; i < N; i++) if(i < r[i]) std::swap(p[i], p[r[i]]);
for(RG int i = 1; i < N; i <<= 1)
{
complex rot = (complex) {cos(pi / i), opt * sin(pi / i)};
for(RG int j = 0; j < N; j += i << 1)
{
complex w = (complex) {1, 0};
for(RG int k = 0; k < i; ++k, w = w * rot)
{
complex x = p[j + k], y = w * p[i + j + k];
p[j + k] = x + y, p[i + j + k] = x - y;
}
}
}
} int main()
{
scanf("%d", &T);
while(T--)
{
scanf("%s%s", C, S);
n = strlen(C), m = strlen(S); std::reverse(S, S + m);
for(N = 1, P = 0; N < n + m; N <<= 1, ++P);
std::fill(ans, ans + n, 0);
for(RG int i = 1; i < N; i++)
r[i] = (r[i >> 1] >> 1) | ((i & 1) << (P - 1));
for(RG int p = 0; p < 4; ++p)
{
for(RG int i = 0; i < N; i++) A[i] = B[i] = (complex) {0, 0};
for(RG int i = 0; i < n; i++)
A[i] = (complex) {(C[i] == DNA[p]) ? 1. : 0., 0};
for(RG int i = 0; i < m; i++)
B[i] = (complex) {(S[i] == DNA[p]) ? 1. : 0., 0};
FFT<1>(A); FFT<1>(B);
for(RG int i = 0; i < N; i++) A[i] = A[i] * B[i];
FFT<-1>(A);
for(RG int i = m - 1; i < n; i++) ans[i] += (int) (A[i].x / N + .5);
}
int cnt = 0;
for(RG int i = m - 1; i < n; i++) if(ans[i] + 3 >= m) ++cnt;
printf("%d\n", cnt);
}
return 0;
}

【TJOI2017】DNA的更多相关文章

  1. 【BZOJ4892】DNA(后缀数组)

    [BZOJ4892]DNA(后缀数组) 题面 BZOJ 洛谷 题解 看到这道题目,我第一反应是\(FFT\)??? 然后大力码出了一个\(FFT\) 就像这样 #include<iostream ...

  2. 【POJ3691】 DNA repair (AC自动机+DP)

    DNA repair Time Limit: 2000MS Memory Limit: 65536KB 64bit IO Format: %I64d & %I64u Description B ...

  3. 【POJ3691】DNA repair(AC自动机,DP)

    题意: 生物课上我们学到,DNA序列中只有A, C, T和G四种片段. 经科学发现,DNA序列中,包含某些片段会产生不好的基因,如片段"ATC"是不好片段,则"AGATC ...

  4. 【POJ2778】DNA Sequence(AC自动机,DP)

    题意: 生物课上我们学到,DNA序列中只有A, C, T和G四种片段. 经科学发现,DNA序列中,包含某些片段会产生不好的基因,如片段"ATC"是不好片段,则"AGATC ...

  5. 【poj1007】 DNA Sorting

    http://poj.org/problem?id=1007 (题目链接) 题意 给出m个字符串,将其按照逆序对个数递增输出. Solution 树状数组经典应用. 代码 // poj1007 #in ...

  6. 【POJ2778】DNA Sequence 【AC自动机,dp,矩阵快速幂】

    题意 题目给出m(m<=10)个仅仅由A,T,C,G组成的单词(单词长度不超过10),然后给出一个整数n(n<=2000000000),问你用这四个字母组成一个长度为n的长文本,有多少种组 ...

  7. 【xsy1154】 DNA配对 FFT

    题目大意:给你一个字符串$s$和字符串$w$,字符集为${A,T,C,G}$,你要在字符串$s$中选出一个与$w$长度相同的子串,使得这两个串的差异度最小. 两个字符$c1$,$c2$的差异度为给定的 ...

  8. 【TJOI2017】异或和

    题目描述 在加里敦中学的小明最近爱上了数学竞赛,很多数学竞赛的题目都是与序列的连续和相关的.所以对于一个序列,求出它们所有的连续和来说,小明觉得十分的简单.但今天小明遇到了一个序列和的难题,这个题目不 ...

  9. 【距离GDOI:128天】【POJ2778】DNA Sequence(AC自动机+矩阵加速)

    已经128天了?怎么觉得上次倒计时150天的日子还很近啊 ....好吧为了把AC自动机搞透我也是蛮拼的..把1030和这道题对比了无数遍...最终结论是...无视时间复杂度,1030可以用这种写法解. ...

随机推荐

  1. js过滤HTML标签以及&nbsp;

    function removeHTMLTag(str) { str = str.replace(/<\/?[^>]*>/g,''); //去除HTML tag str = str.r ...

  2. Oracle诊断工具 - ORA-2730x Troubleshooting Tool

    通常情况下,ORA-27300 ORA-27301 ORA-27302错误的原因是操作系统的系统调用错误或者操作系统配置问题,错误格式:ORA-27300: OS system dependent o ...

  3. mysql-sql-standard

    https://github.com/zhishutech/mysql-sql-standard

  4. 关于解决sql2012编辑器对象名无效问题

    出现以下情况: 解决办法: 选择“编辑”——“Intellisense”——“刷新本地缓存” 或者按Ctrl+Shift+R组合键

  5. 设计多选按钮ListChooseView

    设计多选按钮ListChooseView 答应某位女屌丝而写的控件,效果还不错,开源给大家^_^! 效果图: 源码: // // ListChooseView.h // ScrollChooseBut ...

  6. 铁乐学python_Day44_IO多路复用

    目录 IO模型介绍 阻塞IO(blocking IO) 非阻塞IO(non-blocking IO) 多路复用IO(IO multiplexing) 异步IO(Asynchronous I/O) IO ...

  7. __iter__的有无

    迭代器和生成器 1.迭代器 我们之前⼀直在⽤可迭代对象进⾏迭代操作. 那么到底什么是可迭代对象.⾸先我们先回顾⼀下⽬前我们所熟知的可迭代对象有哪些: str, list, tuple, dict, s ...

  8. September 30th 2017 Week 39th Saturday

    The simplest answer is often the correct one. 最简单的答案通常是最正确的答案. Simplest is always best. Sometimes yo ...

  9. 数据结构&堆&heap&priority_queue&实现

    目录 什么是堆? 大根堆 小根堆 堆的操作 STL queue 什么是堆? 堆是一种数据结构,可以用来实现优先队列 大根堆 大根堆,顾名思义就是根节点最大.我们先用小根堆的建堆过程学习堆的思想. 小根 ...

  10. Programming Assignment 5: Burrows–Wheeler Data Compression

    编程作业五 作业链接:Burrows-Wheeler Data Compression & Checklist 我的代码:MoveToFront.java & CircularSuff ...