官网地址：https://vcftools.github.io/examples.html

vcftools的软件下载：https://vcftools.github.io/examples.html

安装

第一种情况的：

  1. tar -xvf vcfools.0.X.XX.tar.gz
  2. export PERL5LIB=/path/to/your/vcftools-directory/src/perl/
  3. cd vcftools/
  4. ./configure
  5. make
  6. make install

第二种情况：

  1. cd vcftools/
  2. ./autogen.sh
  3. ./configure
  4. make
  5. make install

　

使用

  1. # 用vcftools软件将vcf格式围成genotype252.map和genotype252.ped两个文件
  2. vcftools --vcf genotype_252_填补.hmp.vcf --plink --out genotype252

　　

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