首先查看系统设置->外观->主题。

不同的主题需要更改的文件不同

sudo vim /usr/share/themes/主题(就是刚才主题的名字,ubuntu14.04默认是Ambiance)/gtk-3.0/gtk-main.css

将 tooltip_bg_color #000000; 改为 tooltip_bg_color #f2edbc;   tooltip_fg_color #ffffff; 改为 tooltip_fg_color #000000;

重启eclipse,应该提示框颜色就可以看了。

当然你可以使用其他的背景色,可以到这来挑一种颜色:http://www.sioe.cn/yingyong/yanse-rgb-16/?rgb2=%23f2ed00

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