Matlab之数据处理
写在前面的,软件不太强大,每次保存都需要生成rec和dark的文件,在处理是只需要一个就行了,所有网上查看了下运用批处理的命令去掉多余的文件:
解决办法:windows命令模式下CMD进入文件的目录,输入命令:del /q *rec*.csv(*rec*就是需要删除的包含rec的文件)
昨天下午搞了一个下午的数据提取,想过了用多种方法包括java,delphi等,最后还是想到用Matlab比较方便,选对工具真的很重要啊
我的数据格式:有多个csv文件,对我有用的只有B15:B270的数据,如何提取,看下面代码:
wave = csvread('.\dark\dark.csv',,,[,,,]);%看参数,具体参数的功能参考相应的Matlab书籍
dark =csvread('.\dark\dark.csv',,,[,,,]);%获取背景参数,当前目录的下级目录
ref = csvread('.\ref\ref.csv',,,[,,,]);%获取参比
B = ref-dark;
files = dir('*.csv');%获取当前目录的文件数,注意读取的是csv文件
l = length(files);
C = [];
for i = :l
filename = files(i).name;%获得文件名
A=csvread(filename,,,[,,,]);%读入指定列的数据,详细参数功能参考对应的代码
D = B./(A-dark);%矩阵对应的数相除
C = [C D];%矩阵列合并
end
E = [wave log10(C)];
%dlmwrite('result.txt',C,'delimiter','\t');%以文本的形式输出,注意指定精确度'precision','%f32'
xlswrite('result.xlsx',E,'Sheet1');%xls的形式输出
msgbox(['complete! ' num2str(l) ' xls files.']);
后来跑数据不好,分析原因是没有去三次的平均值,我是每一个位置光谱扫了三次,但是对应的化学只有一个值(一开始我的办法是三次都是取同一个化学值,但是这样的做法是不对的),所有在原有的基础上,每隔3列取一次平均值,算法如下(代码比较简单):
A = xlsread('result.xlsx','Sheet1','B3:PE258');
[m,n]=size(A);
B=[];
for i=::n%第二个参数是步长
temp = A(:,i-:i);
C = mean(temp,);
B=[B C];
end
xlswrite('mean_3.xlsx',B,'Sheet1');%xls的形式输出
msgbox(['complete! ']);
以上就提取完成了,但是化学值是必须自己手动写的,那个真叫一个辛苦,420个数据还好吗,真的还好吗?
方法是通用的,以后读取xls的文件可以对应的用xlsread和xlswrite方法来写,类似能读的文本还有txt、dat......
关于常见的光谱数据的处理,对于同一个点的三次的取平均值的matlab的算法:
B=[];%产生一个空矩阵,
for i=:
data=zeros(,);%生成一个行*列为396*1的零矩阵
for j=:
s=strcat(num2str(i),'-',num2str(j),'.txt');%'-'是取得i和j之间的链接符。如果是1.2那就是'.'。
k=importdata(s);
t=k(:,);%如果原数据的第一列是光的波数,第二列才是吸光度,那么这里写2
data=data+t;%注意矩阵的相加
end
data=data/;%举证的除法运算,其中每个点都除以3
B=[B,data];
end
关于近红外光谱的吸光度的算法,偶然在一个java程序中看见的计算方法:
result[i] = Math.abs(Math.round(((resultQ[i] - resultDark[i]) / (double)(resultLight[i] - resultDark[i])) * 10000) / 10000.0);//此处得到的是透射率T%
result[i] = -Math.log10(result[i]);//得到吸光度abs
Matlab实现曲线拟合
function string = curveFitting(a,x,y)
%spfit 拟合两组数据的线性关系
%a 拟合的次数
%x x轴数据
%y y轴数据
fx=polyfit(x,y,a)%结果返回a次拟合多项式系数,从高次到低次依次存放到变量fx中;
yvalue=polyval(fx,x);%求得多项式在x0处的值y0;
ymean=mean(y);
Rsquare=(norm(yvalue-ymean)/norm(y-ymean))^ %求得相关系数R的平方进行输出
SC=[];
Temp=[];
for i =:a
if fx(i) >
if i >
string = ['+',num2str(fx(i))];
else
string = num2str(fx(i));
end
else
string = num2str(fx(i));
end
Temp = [string,['x^',num2str(a+-i)]];
SC = [SC,Temp];
end
if fx(a+) >
lastString = ['+',num2str(fx(a+))];
SC =[SC,lastString];
else
SC = [SC,num2str(fx(a+))];
end
%画图程序(x,y)对应的点,x1y1对应的是带入拟合后的点
x1=x():0.2:x(length(x));%.2是步长,不是特别要求
y1=polyval(fx,x1);
plot(x,y,'b*',x1,y1,'g');
xlabel(strcat('拟合方程:y=',SC));
Matlab批量到数据(二维荧光数据处理)
B=[];%产生一个空矩阵
for i=:
data=zeros(,);%生成一个行*列为396*1的零矩阵
for j=:
s=strcat(num2str(i),'-',num2str(j),'.txt');%'-'是取得i和j之间的链接符。如果是1.2那就是'.'。
k=importdata(s);
t=k(:,);%如果原数据的第一列是光的波数,第二列才是吸光度,那么这里写2
data=data+t;
end
data=data/;
B=[B,data];
end
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