cuffquant 定量的过程中，当所有基因或者转录本的表达量都为0时，定量的结果就回全部是-nan  , 而不是0；

出现这种情况有两种原因:

1) 参考基因组搞错了，比对和定量的不是同一个参考基因组，或者gtf 文件和fasta 文件中染色体标识符对应不上，最常见的情况就是，一个以chr开头，一个不带chr;

2) 确实是0，就是说比对灭有问题，就是没有比对上基因区间；当然这种概率非常小，如果遇到，只能说是小确幸；

值得高兴的是，今天我就遇到了这种情况，同一批样本，其中一个样本基因的表达量全部为-nan, 找了好久的原因，以为自己哪里搞错了，原来就是这么的巧合，这种极端情况都会遇见

真是屋漏偏逢连夜雨，还是梅雨！！！

cuffquant 定量的结果全部为-nan的更多相关文章

  1. 为什么 NaN 不等于自身？

    NaN 即Not a Number , 不是一个数字, 那么NaN到底是什么呢? 话说在JavaScript中,有6大数据类型,分别包括string,number,boolean,undefined, ...

  2. Python NaN

    NaN, Not a Number, 非数. 它即不是无穷大, 也不是无穷小, 而是python/numpy/... 觉得无法计算时返回的一个符号(自己的推测, 未考证(TODO)). import ...

  3. javascript系列：NaN类型

    NaN,即非数值是一个特殊的数值,这个数值用于表示一个本来要返回数值的操作数未返回数值的情况下. ECMAScript中任何数值除以0会返回NaN,因此不影响其他代码运行.   NaN特点:     ...

  4. JS中判断null、undefined与NaN的方法

    写了个 str ="s"++; 然后出现Nan,找了一会. 收集资料如下判断: 1.判断undefined: 代码如下: <span style="font-siz ...

  5. 你可能不知道的 NaN 以及 underscore 1.8.3 _.isNaN 的一个 BUG

    这篇文章并不在我的 underscore 源码解读计划中,直到 @pod4g 同学回复了我的 issue(详见 https://github.com/hanzichi/underscore-analy ...

  6. Yocto开发笔记之《Tip-stdlib库函数strtod返回nan错误》（QQ交流群：519230208）

    2015.04-imx_v2015.04_3.14.38_6ul_ga+g5d63276 (Jan 04 2016 - 18:07:08) FSL Community BSP : https://co ...

  7. js倒计时，显示NaN天NaN时NaN分（或显示天时分）

    最近在开发跨平台的应用,在做秒杀功能时,倒计时出现了问题.默认在Chrome浏览器中运行,倒计时没出现问题.而在IE浏览器,火狐浏览器,safari浏览器上运行时,则显示NaN天NaN时NaN分(或显 ...

  8. 对属性NaN的理解纠正和对Number.isNaN() 、isNaN()方法的辨析

    1.属性NaN的误解纠正 NaN (Not a Number)在w3c 中定义的是非数字的特殊值 ,它的对象是Number ,所以并不是任何非数字类型的值都会等于NaN,只有在算术运算或数据类型转换出 ...

  9. js的倒计时在ie下显示NAN的最佳解决办法

    写了一个倒计时,原代码如下: var times = new Date(); var timesout = new Date("2016-6-7"); var timesg = t ...

随机推荐

  1. Docker 入门（Mac环境）- part 4 swarms

    part-4 Swarms 简介 这一节主要是介绍一下如何在集群模式下部署docker应用:集群的概念很好理解了,多台机器共同完成一项任务:和Hadoop那些集群一样,docker也相当于有一个管理机 ...

  2. 【论文笔记】Social Role-Aware Emotion Contagion in Image Social Networks

    Social Role-Aware Emotion Contagion in Image Social Networks 社会角色意识情绪在形象社交网络中的传染 1.摘要: 心理学理论认为,情绪代表了 ...

  3. Docker考前突击

    dockerfile 介绍 镜像(Image)     容器(Container)     仓库(Repository)

  4. Eigen教程(4)

    整理下Eigen库的教程,参考:http://eigen.tuxfamily.org/dox/index.html Array类和元素级操作 为什么使用Array 相对于Matrix提供的线性代数运算 ...

  5. Javascript eval()函数 基础回顾

    如果您想详细了解ev al和JSON请参考以下链接: eval  :https://developer.mozilla.org/En/Core_JavaScript_1.5_Reference/Glo ...

  6. iOS import导入时没有提示的解决办法

    我认为是工程中在import时检测不到第三方类库的原因,从而import不会自动补全.在网上搜了很多,终于在stackoverflow找到了解决方法:只要把pods目录添加到用户头文件检索的路径即可. ...

  7. sql分割字符串

    DECLARE @str NVARCHAR(MAX); SET @str = 'aa|bb|cc|dd'; ) SET @str += '|' BEGIN SET @n = LEFT(@str, CH ...

  8. Android 面试知识集1

    今晚在复习Android基础的时候,找到了一些很有价值的基础知识,分享给给位Android的开发者.这些是基础知识,同时也可以当做面试准备.面试题其实是很好的基础知识学习,有空会好好整理相关基础知识. ...

  9. 关于C3P0容错和自动重连特性的研究

    转载: http://blog.csdn.net/cutesource/article/details/5422093 最近常有数据库和网络设备升级和搬迁等事情,而各个应用都是基于数据库连接池做的,大 ...

  10. 华为路由器GRE配置

    1. 协议简介 gre(generic routing encapsulation,通用路由封装)协议是对某些网络层协议(如ip 和ipx)的数据报进行封装,使这些被封装的数据报能够在另一个网络层协议 ...