cuffquant 定量的过程中，当所有基因或者转录本的表达量都为0时，定量的结果就回全部是-nan  , 而不是0；

出现这种情况有两种原因:

1) 参考基因组搞错了，比对和定量的不是同一个参考基因组，或者gtf 文件和fasta 文件中染色体标识符对应不上，最常见的情况就是，一个以chr开头，一个不带chr;

2) 确实是0，就是说比对灭有问题，就是没有比对上基因区间；当然这种概率非常小，如果遇到，只能说是小确幸；

值得高兴的是，今天我就遇到了这种情况，同一批样本，其中一个样本基因的表达量全部为-nan, 找了好久的原因，以为自己哪里搞错了，原来就是这么的巧合，这种极端情况都会遇见

真是屋漏偏逢连夜雨，还是梅雨！！！

cuffquant 定量的结果全部为-nan的更多相关文章

  1. 为什么 NaN 不等于自身？

    NaN 即Not a Number , 不是一个数字, 那么NaN到底是什么呢? 话说在JavaScript中,有6大数据类型,分别包括string,number,boolean,undefined, ...

  2. Python NaN

    NaN, Not a Number, 非数. 它即不是无穷大, 也不是无穷小, 而是python/numpy/... 觉得无法计算时返回的一个符号(自己的推测, 未考证(TODO)). import ...

  3. javascript系列：NaN类型

    NaN,即非数值是一个特殊的数值,这个数值用于表示一个本来要返回数值的操作数未返回数值的情况下. ECMAScript中任何数值除以0会返回NaN,因此不影响其他代码运行.   NaN特点:     ...

  4. JS中判断null、undefined与NaN的方法

    写了个 str ="s"++; 然后出现Nan,找了一会. 收集资料如下判断: 1.判断undefined: 代码如下: <span style="font-siz ...

  5. 你可能不知道的 NaN 以及 underscore 1.8.3 _.isNaN 的一个 BUG

    这篇文章并不在我的 underscore 源码解读计划中,直到 @pod4g 同学回复了我的 issue(详见 https://github.com/hanzichi/underscore-analy ...

  6. Yocto开发笔记之《Tip-stdlib库函数strtod返回nan错误》（QQ交流群：519230208）

    2015.04-imx_v2015.04_3.14.38_6ul_ga+g5d63276 (Jan 04 2016 - 18:07:08) FSL Community BSP : https://co ...

  7. js倒计时，显示NaN天NaN时NaN分（或显示天时分）

    最近在开发跨平台的应用,在做秒杀功能时,倒计时出现了问题.默认在Chrome浏览器中运行,倒计时没出现问题.而在IE浏览器,火狐浏览器,safari浏览器上运行时,则显示NaN天NaN时NaN分(或显 ...

  8. 对属性NaN的理解纠正和对Number.isNaN() 、isNaN()方法的辨析

    1.属性NaN的误解纠正 NaN (Not a Number)在w3c 中定义的是非数字的特殊值 ,它的对象是Number ,所以并不是任何非数字类型的值都会等于NaN,只有在算术运算或数据类型转换出 ...

  9. js的倒计时在ie下显示NAN的最佳解决办法

    写了一个倒计时,原代码如下: var times = new Date(); var timesout = new Date("2016-6-7"); var timesg = t ...

随机推荐

  1. 【Git】Git与GitHub 入门

    GitHub GitHub是一个基于git的代码托管平台,付费用户可以建私人仓库,我们一般的免费用户只能使用公共仓库,也就是代码要公开. 对于一般人来说公共仓库就已经足够了,而且我们也没多少代码来管理 ...

  2. 【Windows】windows核心编程整理（下）

    windows核心编程整理(上) windows核心编程整理(下) 线程的堆栈 每当创建一个线程时,系统就会为线程的堆栈(每个线程有他自己的堆栈)保留一个堆栈空间区域,并将一些物理存储器提交给这个以保 ...

  3. s3c2440——按键中断

    s3c2440的异常向量表: IRQ中断地址是0x18.所以,根据之前的异常处理方式,我们编写启动文件: 为什么需要lr减4,可以参考这篇文章:http://blog.csdn.net/zzsfqiu ...

  4. poj1988（判断一个结点下面有多少个结点，推荐）

    题意:有n个元素,开始每个元素自己一栈,有两种操作,将含有元素x的栈放在含有y的栈的顶端,合并为一个栈.第二种操作是询问含有x元素下面有多少个元素. 6 M 1 6 C 1 M 2 4 M 2 6 C ...

  5. Android——软键盘操作+fragment之间传递参数+TextView限制字数，显示"..."

    原文地址: Android 手动显示和隐藏软键盘 Android隐藏输入法键盘(hideSoftInputFromInputMethod没有效果) Android Fragment传递参数_Fragm ...

  6. 由于无法验证发布者 所以windows阻止此软件

    打开Internet Explorer---菜单栏点“工具”---Internet选项--安全---自定义级别---安全设置---“ActiveX控件和插件下”的第5个“下载未签名的ActiveX控件 ...

  7. 【嵌入式】——ads1.2的安装注意事项

    安装完ads的时候会出现错误,因为还要安装License Installation Wizard. 下一步会出现这个 然后点击Browse... 找到ads1.2下的CRACK(crack)文件夹的L ...

  8. 编译和运行java文件 找不到或无法加载主类

    这边提供一个关于程序中含有package关键字,使用“终端”运行程序时出现“找不到或无法加载主类”,而使用Eclipse软件可以正常运行程序的可能解决办法. 例如程序名为HelloWorldTest. ...

  9. java - 分页类

    pager.java package com.jspnews.util; import java.io.Serializable; import java.util.List; /** * * < ...

  10. Publishing to IIS 发布到IIS

    原文:https://docs.asp.net/en/latest/publishing/iis.html 发布到IIS Publishing to IIS By Rick Anderson and  ...