介绍

参考:https://www.rosettacommons.org/docs/latest/rosetta_basics/file_types/resfiles

resfile包含输入到PackerTask并控制Packer的信息。简单来说,就是指定了程序运行时对特定氨基酸进行特定设计。

ALLAA: 设计为包含半胱氨酸的20种氨基酸,与ALLAAwc相同

ALLAAwc: 默认情况,设计为所有20种氨基酸

ALLAAxc: 设计为除半胱氨酸以外的其他氨基酸

POLAR: 设计为典型极性氨基酸

APOLAR: 设计为非极性氨基酸

PIKAA <list of AAs> : 设计为特定氨基酸,如PIKAA DNTP,表示将氨基酸设计为DNTP

NOTAA <list of AAs>: 不设计为指定氨基酸,如NOTAA DNTP

rosetta Resfile语法和约束的更多相关文章

  1. Xml一(基本语法和约束)、

    XML:eXtensible Markup Language 可扩展标记语言 version="1.0" * 可扩展:所有的标签都是自定义的. * 功能:数据存储 * 配置文件 * ...

  2. MySQL基础(三)——约束

    MySQL基础(三)--约束 约束是在表上强制执行的数据校验规则,主要用于维护表中数据的完整性以及当数据之间有以来关系时,保护相关的数据不会被删除. 根据约束对列的限制,可以划分为:单列约束(只约束一 ...

  3. [读书笔记]SQL约束

    目的:通过在列级或表级设置约束,确保数据符合某种数据完整性规则 实现:数据库主动地检查维护数据的完整性 手段:约束,数据类型,触发器 --------------------------------- ...

  4. 【MySQL】MySQL的约束

    在开始之前,笔者介绍一下笔者使用的数据库版本为5.7.所有的关系型数据库都支持对数据表使用约束,通过约束可以更好的保证数据表里数据的完整性.约束是在表上强制执行的数据校验,约束主要用于保证数据库里数据 ...

  5. UCF约束介绍

    约束 (一)约束的分类: 利用FPGA进行系统设计常用的约束主要分为3类. (1)时序约束:主要用于规范设计的时序行为,表达设计者期望满足的时序条件,知道综合和布局布线阶段的优化算法等. (2)布局布 ...

  6. FPGA---ucf文件语法

    1.约束文件的概念 FPGA设计中的约束文件有3类:用户设计文件(.UCF文件).网表约束文件(.NCF文件)以及物理约束文件(.PCF文件),可以完成时序约束.管脚约束以及区域约束.3类约束文件的关 ...

  7. swift 泛型的类型约束

    总结: 1.类型约束只能添加到泛型参量上面 2.关联类型是泛型参量: 3.关联类型可以通过 协议.关联类型名称的形式引用: func allItemsMatch<C1: Container, C ...

  8. 怎么对ZYNQ的FCLK做时钟组约束

    前言 对于包含PS和PL的设计,两者的数据交互PL必然会用到PS端的时钟. 对于FCLK(PS端时钟输入到PL端)的约束,此时钟的基础约束已在IP中产生.以下想约束其异步时钟的时钟组特性. 注意事项: ...

  9. MySQL进阶13--常见六大约束: 非空/默认/主键/唯一约束/检查约束/外键约束--表级约束 / 列级约束

    /* MySQL进阶13 常见六大约束: 1.not null 非空 2.default :默认值,用于保证该字段的默认值 ; 比如年龄:1900-10-10 3.primary key : 主键,用 ...

  10. KingbaseES 约束

    目录 什么是约束 如何定义约束 列约束 表约束 为约束创建名称 默认约束名称 自定义约束名称 KingbaseES 的可用约束列表 CHECK约束 非空约束 UNIQUE约束 PRIMARY KEY约 ...

随机推荐

  1. JavaScript异步概念及与c#异步的区别

    JS的异步操作函数往往是通过回调函数来实现异步任务的结果处理,在ES6之前如setTimeout函数和异步AJAX编程: 在ES6规范后Promise 类对象使得书写异步任务更加容易,返回Promis ...

  2. uniapp使用rich-text内容过长在真机无法滚动

    解决方案:在rich-text标签上加scroll-view解决 <scroll-view scroll-y="true" style="height: 745rp ...

  3. DNS服务器(简)

    服务端:192.168.182.187 客户端:192.168.182.16 windows客户端:192.168.182.17 1.安装相关服务 yum -y install bind bind-c ...

  4. 【Java】zuul

    报错 com.netflix.zuul.exception.ZuulException: Hystrix Readed time out 解决办法,zuul模块的yml配置文件增加 ribbon: C ...

  5. Oracle数据库简单常用语句

    简单常用语句: 登录超级用户 sqlplus / as sysdba; 登录普通用户 connect username/password; 显示当前用户名 show user; 查询所有用户名 sel ...

  6. R语言原生管道绘图

    前言 最近写论文的时候又一次用到了R.这次我是对Java有一定程度了解后再次转向R,才真正认识到R这门语言在统计编程和数据可视化领域的优雅和快速. 首先可以看一段Java的stream代码: redi ...

  7. windows安装kafka

    1.软件下载 kafka运行需要有jdk+zookeeper环境才能够使用,官网下载 https://www.apache.org/dyn/closer.cgi/zookeeper/ http://k ...

  8. Mysql存储类型长度

    分析MySQL数据类型的长度 MySQL有几种数据类型可以限制类型的"长度",有CHAR(Length).VARCHAR(Length).TINYINT(Length).SMALL ...

  9. 内存模型和名称空间复习题(c++ prime plus )

    第一题 注意到setgolf()被重载,可以这样使用其第一个版本: golf ann; setgolf(ann, "Ann Birdfree", 24); 上述函数调用提供了存储在 ...

  10. nuxt防止第三方ui多次打包

    在nuxt.config.js中的 build:{ extend(){}, verdor:['element-ui'] }