.DNA拓扑学

在拓扑结构的限制下,DNA进行复制等过程。还有连环数=扭转数+缠绕数。

2.拓扑异构酶

DNA变性破坏了两条链之间碱基形成的氢键。和拓扑异构酶是不同的。

3.RNA的组成和结构特点

RNA的生物学功能。

4.DNA复制叉

复制只能由5'端到3'端(磷酸->五碳糖),DNA新链的起始需要一条RNA引物。本质是因为DNA聚合酶需要带有游离3'-OH的引物,而这个正好可以由引物酶现在DNA上合成一段短的RNA引物,这个引物可以提供(引物大约5-10个核苷酸)。

那么在DNA完成复制以后,需要去掉RNA引物,涉及到:RNA酶H、5‘外切核酸酶、DNA聚合酶、DNA连接酶。

dNTP是:脱氧核糖核苷酸三磷酸,包括dATP,dGTP,dTTP,dCTP,是DNA在复制时的原料。(核苷是由嘌呤或嘧啶碱基与核糖形成的缩合物,这种缩合物的核糖上的五位羟基再与三聚磷酸成脂,就形成三磷酸核苷。比如包括:ATP三磷酸腺苷、GTP三磷酸鸟苷、CTP三磷酸胞苷和UTP三磷酸尿苷)

dNMP是:ATP中A代表腺嘌呤、T代表3、P代表磷酸基团,也就是三磷酸腺苷。d是脱氧、N是核苷总称(ATCG)、M代表1 、P磷酸基团,就是脱氧核苷酸

以上两种都是核苷酸的几种结构之一,根据核苷酸中磷酸基的个数,核苷酸分子结构有一磷酸核苷(NMP)、二磷酸核苷(NDP)及三磷酸核苷(NTP)。

1.核苷酸是组成核酸的基本单位,有脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸,分别组成了DNA和RNA。

2.核苷+磷酸基团=核苷酸;核酸=很多核苷酸脱水缩合。

3.比如在ATP中A就是核苷,是核苷酸去掉磷酸基团后的部分。

PCR聚合酶链式反应:用于放大扩增特定DNA片段的技术,能将微量的DNA大幅增加。利用DNA在95°以上会变性为单链,低温碱基按互补原则配对,再将温度调至DNA聚合酶最适反应温度72°,再5'->3'方向形成互补链。

RT-PCR逆转录PCR:一条RNA链被逆转录为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。

DNA脱氧核糖核酸:由4种脱氧核苷酸组成。核苷酸由:一个含氮碱基、一个磷酸、一个脱氧核糖。如下图:

5.DNA聚合酶的特化

DNA聚合酶比较容易脱落,和滑动夹结合可以阻止其从DNA上完全脱离。

5.1DNA在复制叉上的合成

复制器和起始子蛋白,子蛋白识别复制器种的DNA原件并激活复制的蛋白。左边为简单示意图。

基因复制的起点是固定的。

真核细胞的复制起始子是起始位点识别复合物ORC——origin recognition complex。  

真核生物的DNA复制必须全在S期完成,真核生物的复制起始点很多,如果有一个DNA复制起始位点未被激活,那么可能导致断裂。

2点是不管是主动开始的位点和被动开始的位点在复制后都要被失活,上图就很好地说明了这个问题。

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