cutadapt

参考：用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头

fastqc可以用于检测，检测出来了怎么办？

看了几篇高水平文章，有不少再用cutadapt，虽然有时候数据真的不错，但是还是要质控一下，修剪一下。

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq

　　

待续~

质控工具之cutadapt的使用方法的更多相关文章

  1. ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法等

    ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法 官网教程:http://wiki.ros.org/cn/ROS/Tutorials/Getting%20started%20with ...

  2. Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用、类型方法大全 C# 算法题系列(二) 各位相加、整数反转、回文数、罗马数字转整数 C# 算法题系列(一) 两数之和、无重复字符的最长子串 DateTime Tips c#发送邮件，可发送多个附件 MVC图片上传详解

    Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用.类型方法大全   Newtonsoft.Json Newtonsoft.Json 是.Net平台操作Json的工具,他的介绍就 ...

  3. iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频？视频格式转换工具制作动图的方法

    使用iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?使用视频格式转换工具,你可以轻松进行动图或视频的制作,也可以把你喜欢的视频的某一段提取出来,制作成你自己风格的 ...

  4. 质控工具之TrimGalore使用方法

    TrimGalore 就是一个简单的perl wrapper,打包了fastqc和cutadapt,但是却非常实用. 因为cutadapt的参数选择实在是有够复杂,光接头类型就有5种,还有各种参数,大 ...

  5. Google软件构建工具Bazel原理及使用方法介绍

    近期,Google开源了强大的自动化构建工具Bazel. 正好博主近期在使用china版的Bazel--腾讯自主开发的Blade,所以准备跟大家分享一下Google Bazel这个分布式构建系统的原理 ...

  6. charles抓包工具的中文乱码解决方法

    charles是 MAC上最好用的抓包工具.charles 网上的参考文档已经很多,我就不再赘述啦.只是说说我在安装过程遇到的问题和解决方法,仅供参考. charles抓包的数据中的中文内容显示乱码, ...

  7. 为Autodesk Viewer添加自定义工具条的更好方法

    上一篇文章中我介绍了使用Autodesk Viewer的UI API来给viewer添加自定义工具条的方法,看起来很简单是吧.不过有个问题,就是关于自定义工具条的信息(包括按钮的文本.图标.样式.ca ...

  8. ADB工具和手机抓包方法介绍

    Android抓包方法 工具包内容如下:(下载地址:http://download.csdn.net/download/yezhaohui2011/8368061) adb ——谷歌提供的安卓远程调试 ...

  9. Android基础知识02—安卓日志工具LogCat的五种方法

    --------Android 02-------- >>> Android的日志工具LogCat    五个方法,记录信息的级别不一样,从低到高为:    1.Log.v()-日志 ...

随机推荐

  1. Java Spring+Mysql+Mybatis 实现用户登录注册功能

    前言: 最近在学习Java的编程,前辈让我写一个包含数据库和前端的用户登录功能,通过看博客等我先是写了一个最基础的servlet+jsp,再到后来开始用maven进行编程,最终的完成版是一个 Spri ...

  2. 如何用Tensorflow训练模型成pb文件和和如何加载已经训练好的模型文件

    这篇薄荷主要是讲了如何用tensorflow去训练好一个模型,然后生成相应的pb文件.最后会将如何重新加载这个pb文件. 首先先放出PO主的github: https://github.com/ppp ...

  3. ATL、MFC、WTL CString 的今生前世(转载)

    转载:https://www.cnblogs.com/tekkaman/archive/2011/04/20/2022650.html 上文分析了ATL.MFC CString的设计和实现,我们不禁会 ...

  4. vector.resize 与 vector.reserve的区别(转载)

    转载:https://blog.csdn.net/shuilan0066/article/details/3588478 reserve是容器预留空间,但并不真正创建元素对象,在创建对象之前,不能引用 ...

  5. php的__autoload和php的__call

    首先, __call是php语言自身就具有的一种语言features...,不是thinkphp的语言特征. 关于__call参考: http://love-love-l.blog.163.com/b ...

  6. newcoder H肥猪（单调队列 / 线段树）题解

    题意: 小B来到了一个异世界,成为了肥猪之王. 在这个异世界,共有n种肥猪,编号分别为1,...,n. 小B希望集齐这n种肥猪. 召集肥猪有两种方式: 1. 花费a[i]的金币召唤一只编号为i的肥猪. ...

  7. python 之 知识点（1）

    在python是使用bif=built in functions 即内置函数 dir(__builtins__) 可以查看所有的内置函数.注:pycharm中无法使用,不知道原因 help(input ...

  8. P4568 [JLOI2011]飞行路线

    思路 套路题 建出k+1分层图,从上一层走到下一层代表坐了一次免费航线,跑最短路即可 注意可能有情况不需要耗完所有k次机会,所以应从每层的终点向下一层终点连一条边权为0的边 代码 #include & ...

  9. 第五个神奇的电梯（代码抢先看<1>）

    关于一些自认为比较独特的设计思路,也不知道是好还是坏,放在这里让大家一起看一下. 关于mian函数:因为采用了注册机制所以主函数比较简单. #include "stdafx.h" ...

  10. JVM相关笔记

    类的加载过程 加载阶段 主要完成以下3件事情:1.通过“类全名”来获取定义此类的二进制字节流2.将字节流所代表的静态存储结构转换为方法区的运行时数据结构3.在java堆中生成一个代表这个类的java. ...