<Spark><Programming><Loading and Saving Your Data>
Motivation
- Spark是基于Hadoop可用的生态系统构建的,因此Spark可以通过Hadoop MapReduce的InputFormat和OutputFormat接口存取数据。
- Spark所提供的上层接口有这几类:
- File formats and filesystems: 对于存储在本地或分布式系统的数据,比如NFS,HDFS,Amazon S3。Spark可以访问多种数据格式,包括text,JSON,SequenceFiles,protocol buffers。
- Structured data sources through Spark SQL: Spark SQL模块提供了结构化数据结构的API,包括JSON和Apache Hive
- Databases and key/value pairs:包括内置的和第三方的库,可以用来连接Cassandra,HBase,Elasticsearch以及JDBC数据库。
File Formats
- Spark提供大量的数据格式来使数据加载和存储更加方便。这些包括了非结构化(比如文本),半结构化(比如JSON),结构化(比如序列文件)。
格式名称 结构化 评论 Text files 非结构化 Plain old text files. Records are assumed to be one per line. JSON 半结构化 普通的基于文本的格式,半结构化;大多数库需要每行一个记录 CSV 结构化 非常常见的基于文本的格式,经常和电子表格应用一起使用 SequenceFils 结构化 一个常见的Hadoop文件格式,用于key/value数据 Protocol buffers 结构化 一个快速的,space-efficient多语言格式 Object files 结构化 Useful for saving data from a Spark job to be consumed by shared code. Breaks if you change your classes, as it relies on Java Serialization.
Text Files
- 在Spark中,加载和存储文本文件十分方便。当你加载一个文本文件作为RDD时,每一行都变成RDD中的一个元素。
- 也可以一次加载多个text files到一个pair RDD,key就是文件名,value是文件内容
Loading text file
val input = sc.textFile("file:///home/holden/repos/spark/README.md")
- 可以通过制定minPartitions来控制partitions的数量
- 当我们指定目录而非文件时,有两种处理方式:
- 使用textFile()方法:那么将会把所有部分加载到RDD
- 使用wholeTextFiles()方法:当我们需要知道输入来自哪个文件或需要一次处理一个文件时,wholeTextFiles()方法会返回一个pair RDD,其中key是文件名。
# get the average value per file
val input = sc.wholeTextFiles("file://home/holden/salesFiles")
val result = input.mapValues{ y =>
val nums = y.split(" ".map(x => x.toDouble)
nums.sum / nums.size.toDouble
}
Saving text files
result.saveAsTextFile(outputfile)
JSON
- 最简单的加载JSON数据的方式是作为文本加载,然后使用JSON parser来映射值。同样的,也可以使用preferred JSON序列化库来将值作为strings写出。
- 在JAVA和sacla中我们也可以使用自定义的Hadoop format来操作JSON数据
Loading JSON
- 上面说的以文本方式加载JSON的方法,只能用于每行一个JSON的情况。如果你想处理多行的JSON,你只能加载整个文件,然后parse每一行,这时候如果构建一个JSON parser是昂贵的的话,你可以使用mapPartitions()方法来reuse the parser.
# loading JSON in Scala
import com.fasterxml.jackson.module.scala.DefaultScalaModule
import com.fasterxml.jackson.module.scala.experimental.ScalaObjectMapper
import com.fasterxml.jackson.databind.ObjectMapper
import com.fasterxml.jackson.databind.DeserializationFeature
...
case class Person(name: String, lovesPandas: Boolean) // Must be a top-level class ...
// Parse it into a specific case class. We use flatMap to handle errors
// by returning an empty list (None) if we encounter an issue and a
// list with one element if everything is ok (Some(_)).
val result = input.flatMap(record => {
try {
Some(mapper.readValue(record, classOf[Person]))
} catch {
case e: Exception => None
}})- 处理错误格式记录是一个大问题。如果你是简单地skip错误的数据,那么你最好使用accumulators来追踪错误数目。
Saving JSON
# example of python
(data.filter(lambda x: x['lovesPandas']).map(lambda x: json.dumps(x)) .saveAsTextFile(outputFile)) # example of scala
result.filter(p => P.lovesPandas).map(mapper.writeValueAsString(_)) .saveAsTextFile(outputFile)
Comma-Seperated Values and Tab-Separated Values
- Comma-separated value(CSV) are supposed to contain a fixed number of fields per line, and the fields是逗号分隔的(或是tab分隔的TSV文件)。
- P79 TBD....
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