中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）
假设中性突变的频率分别为P和1-P，则其突变年龄为：-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)]
The average age of a neutral two-allele polymorphism with frequencies p and is 1-p：-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)];
这里，Ne为有效群体大小，假定一个群体的有效群体大小是5000，某个SNP突变频率分别为0.1和0.9,则其突变年龄为：
-4*5000*(0.1*log(0.1)+0.9*log(0.9))= 6501.659
这里的6501单位为generation，一个generation是25年。所以突变年龄是：6501.659*25
公式出处：
1、The age of a neutral mutant persisting in a finite population. Genetics 75:199–212
2、Dating the Origin of the CCR5-D32 AIDS-Resistance Allele by the Coalescence of Haplotypes
中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）的更多相关文章
- Linq to 泛型集合查询集合包括大写M和年龄小于等于18
#region Linq to 泛型集合查询集合包括大写M和年龄小于等于18 //List<Student> list = new List<Student&g ...
- python工具 - alert弹框输出姓名年龄、求和
使用python自带的tkinter库进行GUI编程,完成两个功能: (1)要求用户输入姓名和年龄然后打印出来 (2)要求用户输入一个数字,然后计算1到该数字之间的和 代码部分: # 导入tkinte ...
- 基于虹软 2.0 人脸识别猜年龄 java版 demo
首先感谢虹软,是你们提供这么好的SDK支撑了我们的想象力! 这是一个用javav编写的可视化应用,用户通过自己的脸和计算机进行交互,计算机则通过萌萌女孩的语音和用户对话.核心程序就是利用ArcFace ...
- 用sql语句实现年龄分段统计
SELECT CASE WHEN (age >= 10 AND age <= 20) THEN '10-20' WHEN (age >= 21 AND age <= 30) T ...
- 用python写了一个猜年龄小游戏
写一个猜年龄游戏: 需要实现用户登录的功能 初始用户登录信息为 {'hades': '13579','nick': '123','ruixing': 'a1','fanping': 'b2'} 登录时 ...
- [spark程序]统计人口平均年龄（本地文件）（详细过程）
一.题目描述 (1)编写Spark应用程序,该程序可以在本地文件系统中生成一个数据文件peopleage.txt,数据文件包含若干行(比如1000行,或者100万行等等)记录,每行记录只包含两列数据, ...
- day_10猜年龄游戏函数版
''' 1. 在猜年龄的基础上编写登录.注册方法,并且把猜年龄游戏分函数处理,如 2. 登录函数 3. 注册函数 4. 猜年龄函数 5. 选择奖品函数 ''' import json real_age ...
- spark 应用场景1-求年龄平均值
原文引自:http://blog.csdn.net/fengzhimohan/article/details/78535143 该案例中,我们将假设我们需要统计一个 10 万人口的所有人的平均年龄,当 ...
- CFA一级知识点总结
更多来自: www.vipcoursea.com Ethics 部分 Objective of codes and standard:永远是为了maintain public trust in ...
随机推荐
- java.lang.Comparable 接口 详解
参考https://blog.csdn.net/itm_hadf/article/details/7432782 http://www.blogjava.net/jjshcc/archive/2011 ...
- python django 的环境搭建（centos）
一.安装好nginx 二.安装uwsgi yum install python-devel -y pip3 install uwsgi #测试启动django /usr/local/python3/b ...
- kubernetes资源类别介绍
类别 名称 资源对象 Pod.ReplicaSet.ReplicationController.Deployment.StatefulSet.DaemonSet.Job.CronJob.Horizon ...
- linux服务器运维
1. grep正则匹配 grep -E "([0-9]{1,3}\.){4}" filepath egrep "([0-9]{1,3}\.){4}" fil ...
- Scss - 简单笔记
原文链接:scss 教程 手头上疯狂在用 scss,虽然可以在里面写原生的 css, 但是为了保持风格的一致性,还是滚去看了看 scss 文档. 一.变量 变量的引入是 scss 的一个核心特性,变量 ...
- react 入坑笔记（四） - React 事件绑定和传参
React 事件处理 建议:在了解 js 的 this 取值后食用更佳. 一.react 与 Html 中用法的异同和注意点 html 中的绑定事件的写法: <button onclick=&q ...
- 扒一扒开源世界有哪些licenses？
摘要:license,中文译为“许可证”.在开源世界里,license是具有法律效力的,通过选择相应的license,版权拥有者可以声称自己相应的权利,包括其他人使用.修改.引用.共享等一系列涉及版权 ...
- Spring validator常用注解
规则: 原版在这里 https://www.cnblogs.com/wjh123/p/8745473.html @AssertFalse Boolean,boolean 验证注解的元素值是false ...
- 学习 Spring (六) 自动装配
Spring入门篇 学习笔记 No: (默认)不做任何操作 byName: 根据属性名自动装配.此选项将检查容器并根据名字查找与属性完全一致的 bean,并将其与属性自动装配 byType: 如果容器 ...
- Nginx 假如reload或reopen时发生错误如何解决
配置Nginx 如果reload 或 quit发生不存在文件的时候 重新编译下即可 ./nginx -c /usr/local/webserver/nginx/conf/nginx.conf //重 ...