Quorumpeps 群体感应数据库简介
群体感应的定义:
细菌能自发产生、释放一些特定的信号分子,并能感知其浓度变化,调节微生物的群体行为, 这一调控系统称为群体感应。细菌群体感应参与包括人类、动植物病原菌致病力在内的多种生物学功能的调节。
近年来的研究证明细菌之间存在信息交流,许多细菌都能合成并释放一种被称为自诱导物质(autoinducer,AI)的信号分子,胞外的AI浓度能随细菌密度的增加而增加,达到一个临界浓度时,AI能启动菌体中相关基因的表达,调控细菌的生物行为。如产生毒素、形成生物膜、产生抗生素、生成孢子、产生荧光等,以适应环境的变化,我们将这一现象称为群体感应调节(quorum sensing.QS)。这一感应现象只有在细菌密度达到一定阈值后才会发生,所以也有人将这一现象称为细胞密度依赖的基因表达(cell density dependent control of gene expression)
根据细菌合成的信号分子和感应机制不同,QS系统基本可分为三个代表性的类型:革兰氏阴性细菌一般利用酰基高丝氨酸内酯( AHL) 类分子作为AI ,革兰氏阳性细菌—般利用寡肽类分子(Al P) 作为信号因子,另外许多革兰氏阴性和阳性细菌都可以产生一种AI - 2的信号因子,一般认为AI - 2是种间细胞交流的通用信号分子,另外最近研究发现,有些细菌利用两种甚至三种不同信号分子调节自身群体行为,这说明群体感应机制是极为复杂的
以上解释来源于百度百科,可以看到,信号分子AI 在群体感应中其关键的调控作用,而 Quorumpeps 数据库收录了许多文献报导的信号分子的蛋白质序列,并对其来源物种,功能 ,受体,化学结构给出了对应的信息。
数据库的网址如下:
http://quorumpeps.ugent.be
检索界面如下:
如果检索框中不输入任何字符,直接检索,就可以得到数据库中所有的记录
检索的结果如下:
每个字段的含义如下:
ID : 数据库中记录的ID号,每条记录一个唯一的ID,从1开始
Sequence: 序列名称,可以在NCBI中检索得到对应的序列信息
Molecular formula : 分子式
Species origin : 来源的物种
Receptor : 受体
Reference : 对应的文献的数量
Quorumpeps 数据库共收录了346个信号分子,但是并没有提供信号分子对应的序列下载
Quorumpeps 群体感应数据库简介的更多相关文章
- MongoDB数据库简介及安装
一.MongoDB数据库简介 简介 MongoDB是一个高性能,开源,无模式的,基于分布式文件存储的文档型数据库,由C++语言编写,其名称来源取自"humongous",是一种开源 ...
- Oracle数据库简介
Oracle数据库简介 一.介绍 Oracle数据库系统是美国Oracle(甲骨文)公司提供的以分布式数据库为核心的一组软件产品,是目前最流行的客户/服务器(Client/Server,C/S)或浏览 ...
- 数据库 简介 升级 SQLite 总结 MD
Markdown版本笔记 我的GitHub首页 我的博客 我的微信 我的邮箱 MyAndroidBlogs baiqiantao baiqiantao bqt20094 baiqiantao@sina ...
- MongoDB,无模式文档型数据库简介
MongoDB的名字源自一个形容词humongous(巨大无比的),在向上扩展和快速处理大数据量方面,它会损失一些精度,在旧金山举行的MondoDB大会上,Merriman说:“你不适宜用它来处理复杂 ...
- 全球第一开源ERP Odoo操作手册 数据库简介
1.3 数据库简介 每一个独立核算的企业都有一套相互关联的账簿体系, 把这一套完整的账簿体系建立在计算机系统中就称为一个数据库. 一般一个企业只用一个数据库. 如果企业有几个下属的独立核算的实体,也可 ...
- MySql数据库基础之数据库简介及安装
MySql数据库简介: 众所周知,MySql数据库是一款开源的关系型数据库,在Web应用方面,MySql是最好的.最流行的RDBMS(Relational Database Management Sy ...
- Scopus数据库简介
ScienceDirect数据库1. Elsevier简介荷兰Elsevier 是全球最大的科学文献出版发行商,已有180多年的历史.其产品涵盖科学.技术和医学等各个领域,包括1800多种学术期刊(大 ...
- 数据库----ORACLE和MYSQL数据库简介
一.什么是数据库? 数据库(Database---DB)按照组织.储存和管理数据的仓库.(理解以下三个概念) 数据(Data)用来描述事物的记录都可称数据,如文字音乐图像. 数据库系统(Dat ...
- 数据库之一、数据库简介及SQL概要
1.数据库简介: 数据库(Database,DB)是一个长期存储在计算机内的.有组织的.有共享的.统一管理的数据集合.简单来讲就是可以放大量数据的地方.管理数据库的计算机系统称为数据库管理系统(Dat ...
随机推荐
- 【驱动】网卡驱动·linux内核网络分层结构
Preface Linux内核对网络驱动程序使用统一的接口,并且对于网络设备采用面向对象的思想设计. Linux内核采用分层结构处理网络数据包.分层结构与网络协议的结构匹配,既能简化数据包处理流程 ...
- spring-kafka手动提交offset
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <beans xmlns="http://www.sp ...
- 使用PyHive操作Hive
使用PyHive操作Hive 废话 搜了一下,看到了StackOverFlow的回答,试了一下前两个方案,感觉第二个更简洁,这里记录一下,更详细的见参考. 安装依赖 pip install sasl ...
- 标准JAVA MD5方法
https://blog.csdn.net/wangfei0904306/article/details/71565968 ************************************** ...
- if __name__ == '__main__' 含义
if __name__ == '__main__': app.run(host = '0.0.0.0',debug=app.config['DEBUG']) 1.是项目入口的含义2.如果是在生产环境下 ...
- java 多线程 26 : 线程池
使用线程池与不使用线程池的差别 先来看一下使用线程池与不适应线程池的差别,第一段代码是使用线程池的: public static void main(String[] args) { long sta ...
- 06Vue.js快速入门-Vue组件化开发
组件其实就是一个拥有样式.动画.js逻辑.HTML结构的综合块.前端组件化确实让大的前端团队更高效的开发前端项目.而作为前端比较流行的框架之一,Vue的组件和也做的非常彻底,而且有自己的特色.尤其是她 ...
- java工具类POI导出word
1.新建一个word,里面填写内容,如: 2.导出wordjava类 /** * POI导出word测试 * @throws Exception */ @RequestMapping(value=&q ...
- Sublime Text 3安装与使用,安装插件,快捷键,默认配置
本文是Sublime Text 全程指引 by Lucida (http://www.cnblogs.com/figure9/p/sublime-text-complete-guide.html)的笔 ...
- [转]JSP中EL表达式三元运算符的使用
原文地址:http://www.guance.com/469.html Java中的三元运算符为:条件?条件为true值:条件为false的值EL也有一样的运算符,用EL的三元运算符有时可以代替c:c ...