seaborn做横向条形图
数据格式如下
这里选择fold值最大的前20个作图进行展示
代码如下
import seaborn as sns
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
infpkm="gene_diff2019102206.xls"
genename="Aoc1"
picpathname="Aoc1.test"
df = pd.read_csv(infpkm,header=0,sep="\t")
#根据绝对值大小从大到小进行排序
df = df.reindex(df['log2FoldChange'].abs().sort_values(ascending=False).index)
#取前20行
df = df.iloc[:20,:]
#获取最大的fold绝对值作为x轴的上下限
txlim = np.abs(df.loc[:,'log2FoldChange'].tolist()[0])
#获取作图的两列
pre_draw=df[['Datebase_type','log2FoldChange']]
#选择绝对值大于0.58496的数据
pre_draw = pre_draw[np.abs(pre_draw['log2FoldChange'])>0.58496]
#将所有绝对值大于3的整数设置3,绝对值大于3的负数,设置为-3
#df[np.abs(df)>3] = np.sign(df)*3
logfold = [float(n) for n in pre_draw['log2FoldChange'].tolist()]
ngroup = [str(n) for n in pre_draw['Datebase_type'].tolist()]
ax = sns.barplot(x=logfold, y=ngroup, color='blue', orient='h')
ax.set_title('20 Top FoldChange of Gene '+str(genename)+' expression in different dataset', fontsize=15)
ax.set_ylabel('Datebase name', fontsize=15)
ax.set_xlabel('Log2(Fold change)', fontsize=15)
ax.set_xlim([-txlim-0.25, txlim+0.25])
plt.savefig(picpathname+'.png', format='png', dpi=50, bbox_inches='tight')
plt.savefig(picpathname+'.pdf', format='pdf', dpi=100, bbox_inches='tight')
图片效果如下:
seaborn做横向条形图的更多相关文章
- [转载] ul li css 做横向菜单
原文地址: http://www.cnblogs.com/amylis_chen/archive/2011/09/24/2188398.html 第一步:建立一个无序列表 我们先建立一个无序列表,来建 ...
- 使用CollectionView做横向滑动分页效果:
一开始几页滑动是没有问题的,等滑到三四个页面之后,就出现奇怪的缝隙,一开始死活找不到原因,最后在layout的代理方法minimumLineSpacingForSectionAtIndex返回值设置为 ...
- LinearLayout遇到的问题——利用LinearLayout做横向滑动冲突
问题:当我添加两个TextView的时候,然后滑动,发现只生成了一个TextView. 就是 <?xml version="1.0" encoding="utf-8 ...
- 用ul、li做横向导航
/* ul li以横排显示 */ /* 所有class为menu的div中的ul样式 */ div.menu ul { list-style:none; /* 去掉ul前面的符号 */ margin: ...
- ul li做横向导航栏例子
/* ul li以横排显示 */ /* 所有class为menu的div中的ul样式 */ div.menu ul { list-style:none; /* 去掉ul前面的符号 */ margin: ...
- SignalR学习笔记(五) 横向扩展之SQL Server
当一个Web应用程序达到一台服务器能力限制,即请求处理数量限制之后,有2种解决方案:纵向扩展和横向扩展. 纵向扩展即用更强的服务器(或虚拟机),或为当前的服务器添加更多的内存,CPU等 横向扩展即添加 ...
- 3.matplotlib绘制条形图
plt.bar() # coding=utf-8 from matplotlib import pyplot as plt from matplotlib import font_manager my ...
- matplotlib系列——条形图
import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import matplotlib x = ["战狼2","激情8& ...
- 5行Python代码就能实现刷爆全网的动态条形图!
说起动态图表,最火的莫过于动态条形图了. 在B站上搜索「数据可视化」这个关键词,可以看到很多与动态条形图相关的视频. 好多视频都达到了上百万的播放量,属实厉害. 目前网上实现动态条形图现成的工具也很多 ...
随机推荐
- Apache Shiro<=1.2.4反序列化RCE漏洞
介绍:Apache Shiro是一个强大且易用的Java安全框架,执行身份验证.授权.密码和会话管理. 漏洞原因:因为shiro对cookie里的rememberme字段进行了反序列化,所以如果知道了 ...
- 2019.12.09 java for循环
for(初始化表达式; 循环条件; 操作表达式){ 执行语句 ……… } 先走初始化表达式,再走循环条件,如条件满足,走执行语句,然后走操作表达式,再走循环条件,如条件满足,走执行语句 ...
- WinDbg常用命令系列---显示加载的模块列表lm
lm (List Loaded Modules) lm命令显示指定的加载模块.输出包括模块的状态和路径. lmOptions [a Address] [m Pattern | M Pattern] 参 ...
- CSS行内元素
一.典型代表 span a ,strong em del, ins 二.特点: 在一行上显示 不能直接设置宽高 元素的宽和高就是内容撑开的宽高. <style type="text/c ...
- 使用 css/less 动态更换主题色(换肤功能)
前言 说起换肤功能,前端肯定不陌生,其实就是颜色值的更换,实现方式有很多,也各有优缺点 一.看需求是什么 一般来说换肤的需求分为两种: 1. 一种是几种可供选择的颜色/主题样式,进行选择切换,这种可供 ...
- Noip 2017 题目整理
目录 2017Noip: 小凯的疑惑 时间复杂度 逛公园 奶酪 宝藏(50fen) 列队(QAQ不会,以后再研究吧) 2017Noip: 小凯的疑惑 题目描述 小凯手中有两种面值的金币,两种面值均为正 ...
- 02-线性结构3 Reversing Linked List (25 分)
Given a constant K and a singly linked list L, you are supposed to reverse the links of every K elem ...
- java学习笔记(4)运算符
java中的运算符分为以下几种: 算数运算符 +.-.*./.++.--.% 关系运算符 <.<=.>.>=.==.!= 布尔运算符 &&.||.&.| ...
- HTML试题解析
1.关于CSS为什么会出现Bug说法不正确的是(). (选择二项) A:编写CSS样式时需要考虑在不同浏览器中实现表现一致 B:各大主流浏览器由于不同厂家开发,浏览器使用的内核不同,支持CSS的程度不 ...
- 第09组 Alpha冲刺(4/4)
队名:软工9组 组长博客:https://www.cnblogs.com/cmlei/ 作业博客:https://edu.cnblogs.com/campus/fzu/SoftwareEngineer ...