用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix
sparse matrix是用来存储大型稀疏矩阵用得,单细胞表达数据基本都用这个格式来存储,因为单细胞很大部分都是0,用普通文本矩阵存储太占空间。
使用也是相当简单:
library("Matrix")
readsCount <- read.csv("data/count.csv", header = T, row.names = 1)
readsCountSM <- as(as.matrix(readsCount), "dgCMatrix")
# str(M1)
想转回去,as.matrix() 就可以了。
参考:
Coercion of matrix tosparsematrix (dgCMatrix) and maintainingdimnames.
用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix的更多相关文章
- R语言 ggplot2包
R语言 ggplot2包的学习 分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将 ...
- R语言rvest包网络爬虫
R语言网络爬虫初学者指南(使用rvest包) 钱亦欣 发表于 今年 06-04 14:50 5228 阅读 作者 SAURAV KAUSHIK 译者 钱亦欣 引言 网上的数据和信息无穷无尽,如 ...
- R语言-神经网络包RSNNS
code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; }if (window.hljs && docu ...
- R语言-Knitr包的详细使用说明
R语言-Knitr包的详细使用说明 by 扬眉剑 来自数盟[总舵] 群:321311420 1.相关资料 1:自动化报告-谢益辉 https://github.com/yihui/r-ninja/bl ...
- ASP.NET Core的身份认证框架IdentityServer4(5)- 包和构建
包和构建 IdentityServer有许多nuget包 IdentityServer4 nuget | github 包含IdentityServer核心对象模型,服务和中间件. 仅支持内存配置和用 ...
- R语言dplyr包初探
昨天学了一下R语言dplyr包,处理数据框还是很好用的.记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的,以后有空再写一篇详细的用法. #dplyr learning library(dplyr) #fil ...
- R+NLP︱text2vec包——四类文本挖掘相似性指标 RWMD、cosine、Jaccard 、Euclidean (三,相似距离)
要学的东西太多,无笔记不能学~~ 欢迎关注公众号,一起分享学习笔记,记录每一颗"贝壳"~ --------------------------- 在之前的开篇提到了text2vec ...
- IdentityServer4(5)- 包和构建
包和构建 IdentityServer有许多Nuget包组件 IdentityServer4 nuget | github 包含IdentityServer核心对象模型.服务和中间件.默认只包含了基于 ...
- R语言扩展包dplyr——数据清洗和整理
R语言扩展包dplyr——数据清洗和整理 标签: 数据R语言数据清洗数据整理 2015-01-22 18:04 7357人阅读 评论(0) 收藏 举报 分类: R Programming(11) ...
随机推荐
- Java Spring+Mysql+Mybatis 实现用户登录注册功能
前言: 最近在学习Java的编程,前辈让我写一个包含数据库和前端的用户登录功能,通过看博客等我先是写了一个最基础的servlet+jsp,再到后来开始用maven进行编程,最终的完成版是一个 Spri ...
- SPOJ Meteors - 可持久化线段树 - 二分法
Byteotian Interstellar Union (BIU) has recently discovered a new planet in a nearby galaxy. The plan ...
- Codeforces Round #423 (Div. 2, rated, based on VK Cup Finals) Problem C (Codeforces 828C) - 链表 - 并查集
Ivan had string s consisting of small English letters. However, his friend Julia decided to make fun ...
- Windows 动态链接库DLL使用
转载:https://blog.csdn.net/heyabo/article/details/8721611 转载:https://www.cnblogs.com/jin521/p/5598529. ...
- 前端 --- 7 Bootstrop框架
一.基本结构 1.下载地址 官方地址:https://getbootstrap.com 中文地址:http://www.bootcss.com/ 2.HTML基本搭建结构 <!DOCTYPE ...
- B/S交互过程及tomcat体系结构
浏览器与服务器交互过程: 1.浏览器根据主机名,如www.baidu.com,去操作系统的hosts文件中查找主机名对应的ip地址. 2.如果查找不到,则会去互联网上的dns服务器上查找主机名对应的i ...
- FireMonkey 源码学习(3)
五.TTextLayoutNG 在FMX.TextLayout.GPU.pas文件中,实现了几个基础功能,其中: (1)渲染单元 在TextLayout中,每一批同字体和颜色的1~n个字符,组成一个最 ...
- js二叉树
插入数值//初始化node对象function Node ( data) { this.data = data; this.left = null; this.right = null;}// 定义插 ...
- data:image/png;base64 上传图像将图片转换成base64格式
大家可能注意到了,网页上有些图片的src或css背景图片的url后面跟了一大串字符,比如: data:image/png;base64,iVBORw0KGgoAAAANSUhEUgAAAAkAAAAJ ...
- RN原生调用一:安卓Toast
首先安卓原生方法:Toast.makeText(getApplicationContext(), "默认的Toast", Toast.LENGTH_SHORT); 在RN中js如何 ...