有两种情况:

1.先加载Prototype,再加载jQuery。

2.先加载jQuery,再加载Prototype。

针对情况1:先加载Prototype,再加载jQuery。
方法一:jQuery 库和它的所有插件都是在jQuery名字空间内的,包括全局变量也是保存在jQuery 名字空间内的。
使用jQuery.noConflict();主要作用是在任何时候,只要在jQuery加载后就可以调用,将$符号的使用权返回给其它的js库,jQuery在创建它自己的名字空间时就将其它库的$保存在自己的一个变量当中。

<html>
<head>
<script src="prototype.js"></script>
<script src="jquery.js"></script>
<script type="text/javascript" >
//各个js库之间的主要冲突在于$的冲突,这个方法是用来处理这个问题的
jQuery.noConflict(); //原本使用jQuery代码部分的$ 用jQuery替代
jQuery(document).ready(function (){
jQuery("div").hide();
}); // Use Prototype with $(...), etc.
$('proto').hide();
</script>
</head>
<body></body>
</html>

方法二:如果你仍然想使用类似于$这样比较简短的字符,你可以将jQuery.noConflict()的返回值赋值给某个变量。这个变量就是jQuery的新缩写了,当然你可以使用$以外的任意字符串,比如:

<html>
<head>
<script src="prototype.js"></script>
<script src="jquery.js"></script>
<script type="text/javascript" >
//$j就相当于jQuery,名称你可以自主定义
var $j = jQuery.noConflict(); // Use jQuery via $j(...)
$j(document).ready(function (){
$j("div").hide();
}); // Use Prototype with $(...), etc.
$('proto').hide();
</script>
</head>
<body></body>
</html>

方法三:如果你还是想使用$,而不想使用别的字符,也是可以的。而且通常程序员都比较喜欢这样做,因为这样做写好的代码几乎都不用替换原来的$符号。那就是利用名字空间的概念就所有的jQuery代码封装在document的ready事件名字空间范围内,如:jQuery(document).ready(这里填入jQuery代码)

<html>
<head>
<script src="prototype.js"></script>
<script src="jquery.js"></script>
<script type="text/javascript" >
jQuery.noConflict(); // Put all your code in your document ready area
jQuery(document).ready(function ($){
// 这样你可以在这个范围内随意使用$而不用担心冲突
$("div" ).hide();
}); // Use Prototype with $(...), etc.
$('proto' ).hide();
</script>
</head>
<body></body>
</html>

针对第二种情况:先加载jQuery,再加载Prototype。
方法四:按照这样的顺序加载,就不存在其它js库的$符号被jQuery占用的问题。所以对其它的js库的代码可以不作任何修改,照常使用$,而对 jQuery可以使用jQuery来替代$。如:

<html>
<head>
<script src="jquery.js"></script>
<script src="prototype.js"></script>
<script type="text/javascript" >
// 使用 jQuery 用 jQuery(...)
jQuery(document).ready(function (){
jQuery("div" ).hide();
}); // 使用 Prototype 时,用 $(...),
$('someid' ).hide();
</script>
</head>
<body></body>
</html>

或者你不想写jQuery这么长的字符,你可以通过另外一种方法:
方法五:

var  $j = jQuery;

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