李爱民-西安理工大学计算机科学与工程学院

● 简介(Introduction)->

李爱民(Aimin Li),男,湖北随州人,西安电子科学大学博士(PhD),中共党员。中国计算机学会会员,CSC访问学者,主要研究方向为生物信息学(Bioinformatics)、机器学习(Machine Learning)。发表学术论文30篇,其中SCI论文14篇,获发明专利1项。主审教材1部。 主持或参与科研项目20余项。高级程序员(信息产业部),软件工程师(陕西省人事厅Software Engineer),获软件著作权18项。BLOG: http://emanlee.cnblogs.com, ORCID: http://orcid.org/0000-0002-6983-2310, Researchgate: https://www.researchgate.net/profile/Aimin_Li3 Email: liaiminmail AT gmail.com,emanlee815 AT 163.com,QQ: 59193634。

● 工作经历(Affiliation)->

◇ 国家留学基金委(CSC)访问学者(Visiting Scientist),美国得州大学休斯敦健康科学中心(Dr Zhongming Zhao's Lab, University of Texas Health Science Center at Houston)(2017年9月至2018年9月)
◇ 2002/07-至今,西安理工大学,计算机科学与工程学院(School of Computer Science and Engineering, Xi'an University of Technology)

◇ 2001/07-2002/06,西安理工大学,计算中心教研室(网络信息中心)(Computer Center, Computer Network Center, Xi'an University of Technology)

● 学术兼职(Academic Part-time Job)->

◇ 中国计算机学会会员(Member of Chinese Computer Federation)
◇ 陕西省智能计算学会会员(Member of CCF Intelligence Computation)
◇ 担任多个生物信息学领域期刊或会议审稿人(Peer-Reviewer):Bioinformatics、BMC
Bioinformatics、Plos One、Scientific Reports、International Conference on
Intelligent Biology and Medicine(ICIBM)等。
◇ 担任ICIBM2018, ICIBM2019会议程序委员会委员(PC Member):http://icibm2018.zhaobioinfo.org/, http://icibm2019.org/

● 教育经历(Academic Background)->

◇ 2011/09-2015/12,西安电子科技大学,计算机学院,博士 导师:张军英教授(Ph.D, Xidian University, Xi'an, China)
◇ 2006/03,日本福井大学,交流访问研究生(Exchange Graduate, Fukui University, Fukui, Japan)
◇ 2004/09-2007/04,西安理工大学,计算机科学与工程学院,硕士 导师:张璟教授(ME, Xi'an University of Technology, Xi'an, China)
◇ 1997/09-2001/06,西安科技大学,计算机系 学士(BE, Xi’an University of Science and Technology, Xi'an, China)

● 发表论文(Published Papers)->

[英文论文]:
(Papers are availabel here)

17. Aimin Li(#); Guimin Qin; Akiko Suzuki; Mona Gajera; Junichi Iwata;
Peilin Jia(*); Zhongming Zhao(*). Network-based identification of
critical regulators as putative drivers of human cleft lip.
BMC medical genomics, 2019.1.31, 12(1): 16~16 ; SCIE
10.1186/s12920-018-0458-3

16. Rong Fei; Naike Cheng; Zhanmin Wang; Aimin Li; Shasha Li.
Comparative Study on Plant Feature Detection Algorithms Based Content.
2018 5th International Conference on Systems and Informatics, ICSAI 2018, p951-956, January 2, 2019.

15. Rong Fei; Shasha Li; Fang Liu; Aimin Li; Qingzheng Xu.
Random walk model based statistical analysis and application on transport simulation.
Proceedings of the 30th Chinese Control and Decision Conference, CCDC 2018, p5429-5434, July 6, 2018.

14. Zhong Yin Zhou(#); Yue Hu(#); Aimin Li(#); Ying Ju Li; Hui Zhao; Si
Qi Wang; Newton O Otecko; Dejiu Zhang; Jin Huan Wang; Yajun Liu; David M
Irwin; Yan Qin; Ya Ping Zhang(*).
Genome wide analyses uncover allele-specific RNA editing in human and
mouse.
Nucleic Acids Research, 2018.9.28, 46(17): 8888~8897 ; SCIE
10.1093/nar/gky613

13. Liu Yajun(#); Zhang Junying(*); Li Aimin; Liu Zhaowen; He Zhongzhen;
Yuan Xiguo; Tuo Shouheng.Prediction of Cancer-Associated piRNA-mRNA and
piRNA-lncRNA Interactions by Integrated Analysis of Expression and
Sequence Data.
Tsinghua Science and Technology, 2018.4, 23(2): 115~125 ; SCIE
10.23919/TST.2018.8329106

12. Aimin Li#*, Zhong-Yin Zhou#, Xinhong Hei#, Newton O. Otecko, Junying
Zhang, Yajun Liu, Hongfang Zhou, Zhiqiang Zhao & Lei Wang*.
Genome-wide discovery of long intergenic noncoding RNAs and their
epigenetic signatures in the rat[J].
Scientific reports, 2017, 7(1): 14817. SCIE
10.1038/s41598-017-13844-9

11. Zhou Zhong Yin(#); Li Aimin(#); Otecko Newton O; Liu Yan Hu; Irwin
David M; Wang Lu; Adeola Adeniyi C; Zhang Junying; Xie Hai Bing; Zhang
Ya Ping(*).
PigVar: a database of pig variations and positive selection signatures.
Database-The Journal of Biological Databases and Curation, 2017.6.13,
2017: 0~bax048 ; SCIE
10.1093/database/bax048

10. Yajun Liu(#); Junying Zhang(*); Aimin Li; Zhaowen Liu; Yuanyuan Zhang; Xiaohan Sun.
Detectionof Piwi-interacting RNAs based on sequence features.
Genetics & Molecular Research, 2016, 15(2): 0~15028638 ; SCIE
10.1007/s10586-017-1194-8

9. Aimin Li(#); Junying Zhang,(*); Zhongyin Zhou; Lei Wang; Yujuan Liu; Yajun Liu.
ALDB: A Domestic-Animal Long Noncoding RNA Database.
Plos One, 2015, 10(4): 0~UNSP e0124003 ; SCIE, EI
10.1371/journal.pone.0124003

8. Zhaowen Liu(#); Junying Zhang(*); Xiguo Yuan; Baobao Liu; Yajun Liu; Aimin Li; Yuanyuan Zhang; Xiaohan Sun; Shouheng Tuo.
Detecting pan-cancer conserved microRNA modules from microRNA expression profiles across multiple cancers.
Molecular Biosystems, 2015, 11(8): 2227~2237 ; SCIE, EI
10.1039/c5mb00257e

7. Bingbo Wang(#)(*); Lin Gao; Qingfang Zhang; Aimin Li; Yue Deng; Xingli Guo.
Diversified Control Paths: A Significant Way Disease Genes Perturb the Human Regulatory Network.
Plos One, 2015, 10(8): 0~e0135491 ; SCIE
10.1371/journal.pone.0135491

6. Zhong-Yin Zhou(#); Aimin Li; Li-Gang Wang; David M. Irwin; Yan-Hu
Liu; Dan Xu; Xu-Man Han; Lu Wang; Shi-Fang Wu; Li-Xian Wang; Hai-Bing
Xie(*); Ya-Ping Zhang(*).
DNA methylation signatures of long intergenic noncoding RNAs in porcine
adipose and muscle tissues.
Scientific Reports, 2015, 5: 0~15435 ; SCIE, EI
10.1038/srep15435

5. Aimin Li(#); Junying Zhang(*); Zhongyin Zhou; Lei Wang; Xiaohan Sun; Yujuan Liu.
Genome-scale identification of miRNA-mRNA and miRNA-lncRNA interactions in domestic animals.
Animal Genetics, 2015, 46(6): 716~719 ; SCIE
10.1111/age.12329

4. Zhong-Yin Zhou(#); Ai-Min Li; Adeniyi C. Adeola; Yan-Hu Liu; David M. Irwin; Hai-Bing Xie(*); Ya-Ping Zhang(*).
Genome-Wide Identification of Long Intergenic Noncoding RNA Genes and Their Potential Association with Domestication in Pigs.
Genome Biology and Evolution, 2014, 6(6): 1387~1392 ; SCIE
10.1093/gbe/evu113

3. Aimin Li(#); Junying Zhang(*); Zhongyin Zhou.
PLEK: a tool for predicting long non-coding RNAs and messenger RNAs based on an improved k-mer scheme.
Bmc Bioinformatics, 2014, 15(1): 311~314 ; SCIE, EI
10.1186/1471-2105-15-311

2. Xiaohan Sun(#); Junying Zhang(*); Aimin Li; Xiguo Yuan.
mirPD: A pattern-based approach for identifying microRNAs from deep sequencing data.
Digital Signal Processing, 2013, 23(6): 1887~1896 ; SCIE, EI
10.1016/j.dsp.2013.08.002

1. Bo Yang(#); Junying Zhang(*); Junliang Shang; Aimin Li.
A Bayesian network based algorithm for gene regulatory network
reconstruction.
IEEE International Conference on Signal Processing, Communications and
Computing (ICSPCC), Pingxiang,JiangXi, 14.9.2011-16.9.2011 ; EI
10.1109/ICSPCC.2011.6061811

[中文论文]:
13. 费蓉,王磊,梁琨,李爱民,王竹荣,王战敏. 基于“双创教育”的创业型人才培养模式探索与实践[J]. 计算机教育,2018(03):128-130+135.

12. 刘雅君,李爱民,刘晟,张爱玲,袁婷. 编程入门语言JS趣味化教学实践[J]. 电脑知识与技术,2018,14(16):102-103.
11. 刘雅君,李爱民,孙波. 高职辅导员在资助工作中的实践与思考[J]. 才智,2018(23):33.

10. 刘雅君,李爱民,刘晟,张爱玲. 浅谈兼职辅导员资助工作方法[J]. 才智,2018(26):76.

9. 刘雅君,李爱民,刘晟,袁婷. 国际化软件的硬编码和过度翻译问题自动测试研究[J]. 计算机系统应用,2017,26(09):274-278.
8. 李爱民,陆文彪,王德明,张保卫. 基于安卓的教务信息查询app的设计及实现[J]. 工科教育,2017.6

7. 李爱民,马维纲,刘晶. 多媒体文件在线展示通用框架设计及实现[J]. 计算机系统应用,2011,20(04):161-164.

6. 刘玉娟,李爱民. 基于ASP.NET的工资管理系统[J]. 中小企业管理与科技(下旬刊),2010(09):161-162.

5. 李爱民,刘晶,马维纲. Silverlight相关技术研究[J]. 计算机技术与发展,2009,19(06):117-120.

4. 刘晶,刘刚,李爱民,金海燕. 基于非采样Contourlet特征的水印算法[J]. 计算机工程,2009,35(17):143-145.

3. 鲁晓锋,王新房,李燕,李爱民. 基于Petri网的办公自动化工作流建模[J]. 计算机应用,2005(08):1893-1895.

2. 李爱民,鲁晓锋,吴江峰. .NET Framework核心安全技术研究[J]. 网络安全技术与应用,2005(10):38-40.

1. 李爱民,张璟,鲁晓锋,梁荣. 基于Web Service架构元搜索引擎的研究[J]. 计算机应用,2005(12):185-187.

● 软件著作权(Software Certification)->

18. 基于深度信念网络的增强子鉴定软件,编号:2019SR0059473, 2018.9.20
17. 基于gapped k-mer使用率的长非编码RNA鉴定软件,编号:2019SR0059467, 2018.9.20
16. 大鼠长非编码RNA数据存储及分析平台软件,编号:2019SR0078720,2017.4.10

15. 基于MFC的动态规划经典问题算法演示系统,编号:2018SR104478, 2018-02-09

14. 基因表达仿真软件,编号:2017SR095562,2016.12.1

13. 国际化软件的硬编码和过度翻译问题自动测试软件,编号:2017SR095565,2016.12.1
12. 室外光影反推拍摄系统,编号:2017SR534704, 2017-09-21
11. 随机过程问题求解演示系统,编号:2017SR534688,2017-09-21

10. 基于声学特征和情景需求的歌曲推荐软件,编号:2017SR506249,2017-09-12
9. 基于密度峰识别的piRNA簇识别软件,编号:2017SR506260,2017-09-12

8. 基于iOS的可定制社会娱乐资讯系统,编号:2017SR487343, 2017-09-04
7. 基于Tableau的智能报表系统,编号:2017SR486943, 2017-09-04

6. 基于安卓的音乐资讯系统, 编号:2017SR487974, 2017-09-04

5. 基于安卓的教务查询系统,编号:2017SR487967, 2017-09-04
4. 基于微信的教务查询系统,编号:2017SR487308, 2017-09-04
3. 基于web的智慧农业交易管理系统,编号:2017SR356909, 2017-07-10
2. 家养动物长非编码RNA数据存储及分析平台,编号:2016SR316155, 2016-11-02
1. 3D模型投影变换软件,编号:2014SR075989, 2014-06-11

[通用、常用软件]

开发的其他各类通用、常用软件见 个人博客 http://emanlee.cnblogs.com
https://www.cnblogs.com/emanlee/category/253785.html

● 科研项目(Grants)->

[各类纵向科研项目]
20. 陕西省榆林市科技局自然科学项目,201920,陕北白绒山羊非编码RNA与经济性状关系的研究,2019/01-2020/06,参与
19. 西安理工大学教育教学改革研究项目,xjy1866,基于安卓的教务管理信息系统平台的研究与开发,2019/1-2020/12,主持
18. 西安市碑林区科技计划项目,GX1819,IPV6环境下的博物馆实时路径诱导系统,2018/1/1-2019/12/31,参与
17. 陕西省教育厅重点实验室项目,17JS100,分布式并行环境下大规模图问题优化模型与算法研究,2017/6/1-2019/12/31,参与
16. 陕西省自然科学基础研究计划面上项目,2017JM6024,基于gapped k-mer使用率的长非编码RNA鉴定研究,2017/01-2018/12,主持
15. 陕西省教育厅专项科研计划面上项目,17JK0572,基于深度信念网络的增强子鉴定算法研究,2017/06-2018/12,主持
14. 西安市科技计划项目,2017080CG/RC043(XALG025),图像边缘模型及其应用系统的研制,2017/01/01-2018/12/31,参与

13. 西安理工大学教育教学改革研究项目,xjy1652,基于微信的教务管理信息系统平台的研究与开发,2017/1-2018/12,主持
12. 西安理工大学博士启动项目,112-451116001,基于k-mer的非编码RNA相关算法研究,2016/01-2019/12,主持
11. 国家自然科学基金青年项目,61303122,有向生物网络中可控性相关子图模式发现算法研究,2015/01-2016/12,参与
10. 西安市科技计划项目,CXY1509(12),基于数字水印技术的三维模型版权保护系统的研制与开发,2015/01/01-2016/12/31,参与

9. 西安市科技计划项目,CXY1440(5),非特定条件下三维人脸识别技术的研究及应用,2014/01/01-2014/12/31,参与

8. 西安市科技计划项目,CX1256④,立体视觉三维重建系统的研制与实现,2012/01/01-2013/12/31,参与

7. 陕西省教育厅自然科学专项,09JK642,基于构件技术的应用服务器中间件可靠性预测方法研究,2009/07/01-2011/07/01,参与

6. 西安理工大学科研基金,112-400210809,研究生四六级网报系统及学位网报系统,2008/12/01-2009/12/01,参与

5. 西安理工大学科研基金,112-400210707,面向领域特性的构件组装技术研究,2007/07/01-2009/07/01,参与

4. 陕西省教育厅自然科学专项,07JK348,基于合同的构件可测试性方法研究及应用,2007/01/01-2008/11/01,参与

3. 西安理工大学科研基金,112-400210511 工作流建模方法的研究与应用,2005/07/01-2006/12/01,参与

2. 西安理工大学科研基金,112-400210508,基于WEBService构架元搜索引擎的研究,2005/07/01-2006/12/01,主持
1. 西安理工大学科研基金,201-400210222,语言课考试系统研究与开发,2002/07/01-2004/07/01,参与

[各类横向项目]
9. “智能食堂”餐饮管理系统,121-441218002,2018-07-19

8. 片式150~250摩擦离合器的性能及耐久试验系统,602-441217002,2017-03-22

7. Z20任务系统仿真器处理系统开发,112-400231312,2013-09-23

6. 基因表达数据处理与分析系统,112-400231203,2012-03-12

5. Synchro表单及报表工具系统开发,112-400231010,2010-09-15

4. KZ101控制系统软件开发,112-400231014,2010-12-15

3. 劳动合同综合管理系统,112-400231003,2010-03-24

2. 单井数字化系统,112-400230908,2009-12-17

1. 人事工资综合管理系统,112-400230714,2007-12-11

● 授权专利(Patents)->

◇ 基于Surfacelet域的3D网格模型水印方法,专利号:ZL2014100724588,发明专利,专利授权 2016-08-24

● 获奖荣誉(Awards)->

◇ International Conference on Intelligent Biology and Medicine(ICIBM 2018)Travel Award 奖
◇ 2015-2016学年,西安理工大学优秀本科生导师; 2011-2012学年,西安理工大学优秀本科生导师
◇ 基于Web服务的应用集成中间件研究与应用,西安市人民政府,科技进步,三等奖,2008.3.21

● 其他(Miscellaneous)->

◇ 计算机科学与工程系党支部宣传委员(2014年至今)
◇ 计111班班主任; 计112班班主任; 计161班班主任

◇ 协助指导硕士研究生2名
◇ 教材,JavaScript程序设计,天津出版传媒集团,2017.7.1

◇ 主讲课程:大学计算机基础(双语),C语言程序设计,Visual Basic,SQL Server,C++面向对象程序设计,网络数据库,办公自动化,计算机软件基础,软件开发实践(C#),操作系统,软件项目管理(双语),构件技术等课程。

(更新日期:March 8, 2019)

● Contact Us:
Aimin Li, LiGongDaXue 666XinXiang, Xi'an University of Technology, 5 South Jinhua Road, Xi'an, Shaanxi 710048, P.R China

欢迎生物信息、医学、生物、农学领域的老师和同学合作!

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