MPI linux Ubuntu cluster 集群

在局域网内安装mpi，并进行并行计算。MPICH3。

下载源码：

wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.3.1/mpich-3.3.1.tar.gz

tar -xzf mpich-3.3..tar.gz

cd mpich-3.3.

mkdir build

cd build

../configure --disable-fortran

make 

sudo make install

修改主机名后需要重启。

sudo vim /etc/hostname

修改为 master 或 client0，client1等

sudo vim /etc/hosts

增加 192.*.*.* master

也就是增加master的IP地址。

或者增加client的IP地址， 注意master机器的hosts也要更新这些ip

sudo adduser mpiuser

#设置密码 其余回车

sudo apt­-get install openssh-server

################给mpiuser 增加sudo权限

sudo chmod u+w /etc/sudoers

sudo -i

vim /etc/sudoers

增加一行 mpiuser ALL=(ALL:ALL) ALL

sudo chmod u-w /etc/sudoers

################给mpiuser 增加sudo权限

su - mpiuser 

#我们都在每个机器的mpiuser 用户中做实验，安装源码可以在主用户下，

mpi用ssh进行通信，为了ssh通信免密我们需要用以下步骤生成秘钥文件，并发送到对方服务器，当然其他的机器也要互相做同样的动作。

ssh-keygen -t rsa

# 生成rsa秘钥

ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub master 

# 发送秘钥给master 输入yes 和 master机器的密码

sudo apt-get install nfs-kernel-server -y 

# 安装网络文件服务器，因为mpi运行的程序必须是一致，而且需要快速更新。

mkdir cloud

sudo mount -t nfs master:/home/mpiuser/cloud ~/cloud

test1#####################################

mpirun -np  -hosts client,client1 ./cpi

Process  of  is on client1
Process  of  is on client
Process  of  is on client1
Process  of  is on client
pi is approximately 3.1415926544231243, Error is 0.0000000008333312
wall clock time = 0.001272

另外一个test

master 与 client 建立TCP链接 ，首先在master上run server程序。源码在

https://github.com/qiaosiyi/ssserver/blob/master/tcptestserver.c

编译之，

mpicc tcptestserver.c -o tcptestserver

tcptestclient ，同理。

在master上运行：

################master###############################

$ mpirun -np  ./tcptestserver

$ portname: tag#$description#master$port#$ifname#192.168.187.160$

################master###############################

再在client上运行：

################client###############################

$ mpirun -np  ./tcptestclient 'tag#0$description#master$port#36221$ifname#192.168.187.160$'

$ Trying connect to tag#$description#master$port#$ifname#192.168.187.160$

################client###############################

在master上运行：

################master###############################

$ client connected

$ msg: 

################master###############################

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qsy

31 Jul 2019