Spark如何对源端数据做切分?
简介: 典型的Spark作业读取位于OSS的Parquet外表时,源端的并发度(task/partition)如何确定?特别是在做TPCH测试时有一些疑问,如源端扫描文件的并发度是如何确定的?是否一个parquet文件对应一个partition?多个parquet文件对应一个partition?还是一个parquet文件对应多个partition?本文将从源码角度进行分析进而解答这些疑问。
引言
典型的Spark作业读取位于OSS的Parquet外表时,源端的并发度(task/partition)如何确定?特别是在做TPCH测试时有一些疑问,如源端扫描文件的并发度是如何确定的?是否一个parquet文件对应一个partition?多个parquet文件对应一个partition?还是一个parquet文件对应多个partition?本文将从源码角度进行分析进而解答这些疑问。
分析
数据源读取对应的物理执行节点为FileSourceScanExec,读取数据代码块如下
lazy val inputRDD: RDD[InternalRow] = {
val readFile: (PartitionedFile) => Iterator[InternalRow] =
relation.fileFormat.buildReaderWithPartitionValues(
sparkSession = relation.sparkSession,
dataSchema = relation.dataSchema,
partitionSchema = relation.partitionSchema,
requiredSchema = requiredSchema,
filters = pushedDownFilters,
options = relation.options,
hadoopConf = relation.sparkSession.sessionState.newHadoopConfWithOptions(relation.options))
val readRDD = if (bucketedScan) {
createBucketedReadRDD(relation.bucketSpec.get, readFile, dynamicallySelectedPartitions,
relation)
} else {
createReadRDD(readFile, dynamicallySelectedPartitions, relation)
}
sendDriverMetrics()
readRDD
}
主要关注非bucket的处理,对于非bucket的扫描调用createReadRDD方法定义如下
/**
* Create an RDD for non-bucketed reads.
* The bucketed variant of this function is [[createBucketedReadRDD]].
*
* @param readFile a function to read each (part of a) file.
* @param selectedPartitions Hive-style partition that are part of the read.
* @param fsRelation [[HadoopFsRelation]] associated with the read.
*/
private def createReadRDD(
readFile: (PartitionedFile) => Iterator[InternalRow],
selectedPartitions: Array[PartitionDirectory],
fsRelation: HadoopFsRelation): RDD[InternalRow] = {
// 文件打开开销,每次打开文件最少需要读取的字节
val openCostInBytes = fsRelation.sparkSession.sessionState.conf.filesOpenCostInBytes
// 最大切分分片大小
val maxSplitBytes =
FilePartition.maxSplitBytes(fsRelation.sparkSession, selectedPartitions)
logInfo(s"Planning scan with bin packing, max size: $maxSplitBytes bytes, " +
s"open cost is considered as scanning $openCostInBytes bytes.")
// Filter files with bucket pruning if possible
val bucketingEnabled = fsRelation.sparkSession.sessionState.conf.bucketingEnabled
val shouldProcess: Path => Boolean = optionalBucketSet match {
case Some(bucketSet) if bucketingEnabled =>
// Do not prune the file if bucket file name is invalid
filePath => BucketingUtils.getBucketId(filePath.getName).forall(bucketSet.get)
case _ =>
_ => true
}
// 对分区下文件进行切分并按照从大到小进行排序
val splitFiles = selectedPartitions.flatMap { partition =>
partition.files.flatMap { file =>
// getPath() is very expensive so we only want to call it once in this block:
val filePath = file.getPath
if (shouldProcess(filePath)) {
// 文件是否可split,parquet/orc/avro均可被split
val isSplitable = relation.fileFormat.isSplitable(
relation.sparkSession, relation.options, filePath)
// 切分文件
PartitionedFileUtil.splitFiles(
sparkSession = relation.sparkSession,
file = file,
filePath = filePath,
isSplitable = isSplitable,
maxSplitBytes = maxSplitBytes,
partitionValues = partition.values
)
} else {
Seq.empty
}
}
}.sortBy(_.length)(implicitly[Ordering[Long]].reverse)
val partitions =
FilePartition.getFilePartitions(relation.sparkSession, splitFiles, maxSplitBytes)
new FileScanRDD(fsRelation.sparkSession, readFile, partitions)
}
可以看到确定最大切分分片大小maxSplitBytes对于后续切分为多少个文件非常重要,其核心逻辑如下
def maxSplitBytes(
sparkSession: SparkSession,
selectedPartitions: Seq[PartitionDirectory]): Long = {
// 读取文件时打包成最大的partition大小,默认为128MB,对应一个block大小
val defaultMaxSplitBytes = sparkSession.sessionState.conf.filesMaxPartitionBytes
// 打开每个文件的开销,默认为4MB
val openCostInBytes = sparkSession.sessionState.conf.filesOpenCostInBytes
// 建议的(不保证)最小分割文件分区数,默认未设置,从leafNodeDefaultParallelism获取
// 代码逻辑调用链 SparkSession#leafNodeDefaultParallelism -> SparkContext#defaultParallelism
// -> TaskSchedulerImpl#defaultParallelism -> CoarseGrainedSchedulerBackend#defaultParallelism
// -> 总共多少核max(executor core总和, 2),最少为2
val minPartitionNum = sparkSession.sessionState.conf.filesMinPartitionNum
.getOrElse(sparkSession.leafNodeDefaultParallelism)
// 总共读取的大小
val totalBytes = selectedPartitions.flatMap(_.files.map(_.getLen + openCostInBytes)).sum
// 单core读取的大小
val bytesPerCore = totalBytes / minPartitionNum
// 计算大小,不会超过设置的128MB
Math.min(defaultMaxSplitBytes, Math.max(openCostInBytes, bytesPerCore))
}
对于PartitionedFileUtil#splitFiles,其核心逻辑如下,较为简单,直接按照最大切分大小切分大文件来进行分片
def splitFiles(
sparkSession: SparkSession,
file: FileStatus,
filePath: Path,
isSplitable: Boolean,
maxSplitBytes: Long,
partitionValues: InternalRow): Seq[PartitionedFile] = {
if (isSplitable) {
// 切分为多个分片
(0L until file.getLen by maxSplitBytes).map { offset =>
val remaining = file.getLen - offset
val size = if (remaining > maxSplitBytes) maxSplitBytes else remaining
val hosts = getBlockHosts(getBlockLocations(file), offset, size)
PartitionedFile(partitionValues, filePath.toUri.toString, offset, size, hosts)
}
} else {
Seq(getPartitionedFile(file, filePath, partitionValues))
}
}
在获取到Seq[PartitionedFile]列表后,还并没有完成对文件的切分,还需要调用FilePartition#getFilePartitions做最后的处理,方法核心逻辑如下
def getFilePartitions(
sparkSession: SparkSession,
partitionedFiles: Seq[PartitionedFile],
maxSplitBytes: Long): Seq[FilePartition] = {
val partitions = new ArrayBuffer[FilePartition]
val currentFiles = new ArrayBuffer[PartitionedFile]
var currentSize = 0L
/** Close the current partition and move to the next. */
def closePartition(): Unit = {
if (currentFiles.nonEmpty) {
// Copy to a new Array.
// 重新生成一个新的PartitionFile
val newPartition = FilePartition(partitions.size, currentFiles.toArray)
partitions += newPartition
}
currentFiles.clear()
currentSize = 0
}
// 打开文件开销,默认为4MB
val openCostInBytes = sparkSession.sessionState.conf.filesOpenCostInBytes
// Assign files to partitions using "Next Fit Decreasing"
partitionedFiles.foreach { file =>
if (currentSize + file.length > maxSplitBytes) {
// 如果累加的文件大小大于的最大切分大小,则关闭该分区,表示完成一个Task读取的数据切分
closePartition()
}
// Add the given file to the current partition.
currentSize += file.length + openCostInBytes
currentFiles += file
}
// 最后关闭一次分区,文件可能较小
closePartition()
partitions.toSeq
}
可以看到经过这一步后,会把一些小文件做合并,生成maxSplitBytes大小的PartitionFile,这样可以避免拉起太多task读取太多小的文件。
生成的FileScanRDD(new FileScanRDD(fsRelation.sparkSession, readFile, partitions))的并发度为partitions的长度,也即最后Spark生成的Task个数
override protected def getPartitions: Array[RDDPartition] = filePartitions.toArray
整体流程图如下图所示
拆分、合并过程如下图所示
实战
对于TPCH 10G生成的customer parquet表
共8个Parquet文件,总文件大小为113.918MB
Spark作业配置如下,executor只有1core
conf spark.driver.resourceSpec=small;
conf spark.executor.instances=1;
conf spark.executor.resourceSpec=small;
conf spark.app.name=Spark SQL Test;
conf spark.adb.connectors=oss;
use tpcd;
select * from customer order by C_CUSTKEY desc limit 100;
根据前面的公式计算
defaultMaxSplitBytes = 128MB
openCostInBytes = 4MB
minPartitionNum = max(1, 2) = 2
totalBytes = 113.918 + 8 * 4MB = 145.918MB
bytesPerCore = 145.918MB / 2 = 72.959MB
maxSplitBytes = 72.959MB = Math.min(defaultMaxSplitBytes, Math.max(openCostInBytes, bytesPerCore))
得到maxSplitBytes为72.959MB,从日志中也可看到对应大小
经过排序后的文件顺序为(00000, 00001, 00002, 00003, 00004, 00006, 00005, 00007),再次经过合并后得到3个FilePartitioned,分别对应
- FilePartitioned 1: 00000, 00001, 00002
- FilePartitioned 2: 00003, 00004, 00006
- FilePartitioned 3: 00005, 00007
即总共会生成3个Task
从Spark UI查看确实生成3个Task
从日志查看也是生成3个Task
变更Spark作业配置,5个executor共10core
conf spark.driver.resourceSpec=small;
conf spark.executor.instances=5;
conf spark.executor.resourceSpec=medium;
conf spark.app.name=Spark SQL Test;
conf spark.adb.connectors=oss;
use tpcd;
select * from customer order by C_CUSTKEY desc limit 100;
根据前面的公式计算
defaultMaxSplitBytes = 128MB
openCostInBytes = 4MB
minPartitionNum = max(10, 2) = 10
totalBytes = 113.918 + 8 * 4MB = 145.918MB
bytesPerCore = 145.918MB / 10 = 14.5918MB
maxSplitBytes = 14.5918MB = Math.min(defaultMaxSplitBytes, Math.max(openCostInBytes, bytesPerCore))
查看日志
此时可以看到14.5918MB会对源文件进行切分,会对00001, 00002,00003,00004,00005,00006进行切分,切分成两份,00007由于小于14.5918MB,因此不会进行切分,经过PartitionedFileUtil#splitFiles后,总共存在7 * 2 + 1 = 15个PartitionedFile
- 00000(0 -> 14.5918MB), 00000(14.5918MB -> 15.698MB)
- 00001(0 -> 14.5918MB), 00001(14.5918MB -> 15.632MB)
- 00002(0 -> 14.5918MB), 00002(14.5918MB -> 15.629MB)
- 00003(0 -> 14.5918MB), 00003(14.5918MB -> 15.624MB)
- 00004(0 -> 14.5918MB), 00004(14.5918MB -> 15.617MB)
- 00005(0 -> 14.5918MB), 00005(14.5918MB -> 15.536MB)
- 00006(0 -> 14.5918MB), 00006(14.5918MB -> 15.539MB)
- 00007(0 -> 4.634MB)
经过排序后得到如下以及合并后得到10个FilePartitioned,分别对应
- FilePartitioned 1: 00000(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 2: 00001(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 3: 00002(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 4: 00003(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 5: 00004(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 6: 00005(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 7: 00006(0 -> 14.5918MB)
- FilePartitioned 8: 00007(0 -> 4.634MB),00000(14.5918MB -> 15.698MB)
- FilePartitioned 9: 00001(14.5918MB -> 15.632MB),00002(14.5918MB -> 15.629MB),00003(14.5918MB -> 15.624MB)
- FilePartitioned 10: 00004(14.5918MB -> 15.617MB),00005(14.5918MB -> 15.536MB),00006(14.5918MB -> 15.539MB)
即总共会生成10个Task
通过Spark UI也可查看到生成了10个Task
查看日志,000004(14.5918MB -> 15.617MB),00005(14.5918MB -> 15.536MB),00006(14.5918MB -> 15.539MB)在同一个Task中
00007(0 -> 4.634MB),00000(14.5918MB -> 15.698MB)
00001(14.5918MB -> 15.632MB),00002(14.5918MB -> 15.629MB),00003(14.5918MB -> 15.624MB)在同一个Task中
总结
通过源码可知Spark对于源端Partition切分,会考虑到分区下所有文件大小以及打开每个文件的开销,同时会涉及对大文件的切分以及小文件的合并,最后得到一个相对合理的Partition。
原文链接:http://click.aliyun.com/m/1000349867/
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