https://www.cnblogs.com/johnsonzzz/p/15151634.html

https://github.com/YangJianshun/LINKVIEW

可以绘制两个基因组、三个基因组的染色体水平的共线性关系。

按染色体配置比对文件参数，配置-k参数可以调整染色体的位置。

Nucmer+LINKVIEW实现序列水平的共线性分析的更多相关文章

  1. 基因组共线性分析工具MCScanX

    软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析..MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具. 软件安装 进入官网http: ...

  2. 共线性分析-MCscan - python （jcvi）

    本来是不会再写这个文档的,但是由于长时间没有用这个模块,这个模块不知道是我自己弄掉了,还是别的同学误删了,于是我重新安装一下. 首先下载conda,并下载好python which pip 直接安装 ...

  3. R语言实战（五）方差分析与功效分析

    本文对应<R语言实战>第9章:方差分析:第10章:功效分析 ================================================================ ...

  4. 搜索引擎case︱从搜索序列文本看高端商务车︱统计之都

    朱雪宁(北京大学光华管理学院)               王汉生(北京大学光华管理学院) 摘要:本文对100万搜索引擎用户的13亿搜索序列文本进行探索分析,对高端车用户以及商学院人群做了描述对比,并 ...

  5. R in action读书笔记（13）第十章 功效分析

    功效分析 功效分析可以帮助在给定置信度的情况下,判断检测到给定效应值时所需的样本量.反过来,它也可以帮助你在给定置信度水平情况下,计算在某样本量内能检测到给定效应值的概率.如果概率低得难以接受,修改或 ...

  6. 生物信息-McScan（Python-jcvi）共线性画图

    比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的 ...

  7. 剑指Offer面试题：20.栈的压入、弹出序列

    一.题目:栈的压入.弹出序列 题目:输入两个整数序列,第一个序列表示栈的压入顺序,请判断第二个序列是否为该栈的弹出顺序.假设压入栈的所有数字均不相等.例如序列1.2.3.4.5是某栈的压栈序列,序列4 ...

  8. SPSS数据分析—生存分析

    生存分析是对生存时间进行统计分析的一种技术,所谓生存时间,就是指从某一时间点起到所关心的事件发生的这段时间.这里的时间不一定就是钟表日历上的时间,也有可能是其他的度量单位,比如长度单位等. 生存时间有 ...

  9. LR12.53—第7课：分析场景

    第7课:分析场景 在前面的课程中,您学习如何设计,控制和执行方案运行.一旦您已加载您的服务器,你要分析的运行,并确定需要被淘汰,以提高系统性能的问题. 在图表和报告中有关方案的性能您的分析会议上提出的 ...

  10. 《UNIX/Linux网络日志分析与流量监控》新书发布

    本书从UNIX/Linux系统的原始日志(Raw Log)采集与分析讲起,逐步深入到日志审计与计算机取证环节.书中提供了多个案例,每个案例都以一种生动的记事手法讲述了网络遭到入侵之后,管理人员开展系统 ...

随机推荐

  1. PostgreSQL 谁堵塞了谁（锁等待检测）- pg_blocking_pids

    一.背景 当一个进程处于等待(被堵塞)状态时,是谁干的?可以使用如下函数,快速得到捣蛋(堵塞别人)的PID. 二.案例 1.会话1 postgres=# begin; BEGIN postgres=# ...

  2. rotate matrix

  3. Linux——CentOS7无法ping通外网问题

    出现问题: 当在终端中出现 ping: unknown host www.baidu.com 或 ping: www.baidu.com: 未知的名称或服务 时,该如何解决? 解决方法: 1.使用ro ...

  4. 第七周作业-N67044-张铭扬

    1. 说明自动化运维的路径,原理,实践方法. 所谓自动化运维是指通过将日常IT运维中大量的重复性工作(小到简单的日常检查.配置变更和软件安装,大到整个变更流程的组织调度)由过去的手工执行转为标准化.流 ...

  5. springboot自带的MD5加密

    //md5DigestAsHex返回的是string类型 DigestUtils.md5DigestAsHex(user.getPassword().getBytes(StandardCharsets ...

  6. UE4笔记索引

    图形 渲染 延迟渲染 三维渲染流程 渲染优化 基本渲染 材质 材质节点组合 节点分类 特别的属性 其他 坐标空间与切线空间 坐标轴 编码 平台相关 UBT编译 命令行 程序到CPU路径 C++与蓝图互 ...

  7. 使用batch-import工具向neo4j中导入海量数据【转】

    转载备忘 链接:https://www.yisu.com/zixun/496254.html 这篇文章给大家分享的是有关数据库中怎么使用batch-import工具向neo4j中导入海量数据的内容.小 ...

  8. Javascript高级程序设计(000)

    该分类下为学习Javascript高级程序设计的笔记,希望自己可以坚持学习,努力学习!加油! 一.组织结构 第 1 章,介绍 JavaScript 的起源:从哪里来,如何发展,以及现今的状况.这一章会 ...

  9. Minio--docker部署

    拉取镜像 docker pull minio/minio 启动容器 创建文件夹 bin data config 启动脚本 docker run -p 9000:9000 -p 9001:9001 \ ...

  10. DP5340:国产兼容替代CS5340立体声音频A/D转换器芯片

    DP5340简介 DP5340 是一款完整的采样.模数音频信号转换. 抗混叠滤波的芯片,在串行格式下以每声道最高 200kHz 采样率高达 24 位宽,并支持大部分的音频 数据格式. DP5340 基 ...