bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C.

Aid文件:
ID001.1
ID032.1
ID090.10

Bfilt文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID055.1 XXX
6666666666666666666666666666666666666
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

要得到Cnew文件:
XX XX XXX ID001.1 XXX
999999999999999999999999999999999999999
XX XX XXX ID032.1 XXX
333333333333333333333333333333333333333

awk 'NR==FNR{a[FNR]=$0} NR>FNR{for(i in a)if($0~a[i]){print;getline;print}}' Aid Bfilt >Cnew

这个十分慢;用 extractfastabyid 处理。

linux bash脚本把A和B文件中有相同ID的B文件的内容输出到文件C的更多相关文章

  1. shell编程学习笔记(七):Shell中将指定内容输出到文件中

    我们这里把echo要打印的内容输出到文件中 以下蓝色字体部分为Linux命令,红色字体的内容为输出的内容: # cd /opt/scripts # vim script06.sh 开始编写script ...

  2. 标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps

    /* *使用标准IO ——将A文件fpd第3个字节之后的内容复制到文件fps 流程: 1.创建两个流,链接目标文件和源文件 2.输入流的基准点偏移四个单位然后输入缓冲区 3.输出流读取缓冲区数据送入文 ...

  3. 将windows控制台内容输出到文件中

    将windows控制台内容输出到文件中 dir>c:/file.txt 2>&1   对应的java  class   >c:/file.txt 2>&1   ...

  4. 【翻译自mos文章】对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名

    对于每个文件的 file.id and file.incarnation number,重命名文件别名 參考原文: Rename Alias of Datafile as Per file.id an ...

  5. Linux Bash脚本编程语言中的美学与哲学

    我承认,我再一次地当了标题党.但是不可否认,这一定是一篇精华随笔.在这一篇中,我将探讨Bash脚本语言中的美学与哲学. 这不是一篇Bash脚本编程的教程,但是却能让人更加深入地了解Bash脚本编程,更 ...

  6. linux过滤旧文件中的空行和注释行剩余内容组成新文件

    一.说明 在某些场景下我们想要将旧文件中空行和注释行过滤掉,将产生实际效果的行保留. 比如redis提供的配置示例文件中有很多用于说明的空行和注释行,我们想把产生实际效果的配置行筛选出来组成新的简洁的 ...

  7. Linux Bash 脚本:自己定义延迟代码块(裸数据保存方案)

    结合 alias 和 read 使用方法.能够保存一些将要延迟执行的脚本,或者裸数据(字符串不被扩展)到一个变量中.以备后用. $ alias BEGIN='read -d "" ...

  8. Linux bash脚本及常用命令--不断更新中

    1.如何在向alias命令传递参数: 这种用法的话就需要使用函数来配合使用. 如要cd到指定目录,并且ls当前目录下的文件可以使用:  alias cdls='cdls(){ cd $1; ls; } ...

  9. 一个java文件中有几个类,编译后有几个class文件?

    在一个源文件中用class关键字定义了几个类,编译的时候就会产生几个字节码文件

随机推荐

  1. ASP.NET工具

    每个开发人员现在应该下载的十种必备工具 发布日期: 7/20/2004 | 更新日期: 7/20/2004 本文自发布以来已经增加了新信息. 请参阅下面的编辑更新. 本文讨论: • 用于编写单元测试的 ...

  2. H264学习第一篇(编码结构分析)

    学习H264之前,最好阅读一下维基百科中有关H264的相关介绍,里面包含了其的发展历程.主要特点.参考文献.参考网站等. 研究H264的主要文件包括两份参考手册(一份是语法结构参考手册,一份是JM开发 ...

  3. Nginx upstream的5种权重分配方式

    .轮询(默认) 每个请求按时间顺序逐一分配到不同的后端服务器,后端服务器down掉,能自动剔除 .weight 指定轮询几率,weight和访问比率成正比,用于后端服务器性能不均的情况. upstre ...

  4. 四、mysql内置函数

    .字符串函数 concat('a','b'); 字符串拼接函数 ,,"我是A我是B"): 从指定位置开始替换指定长度的指定数据(起步为1) lower() 转小写 upper() ...

  5. 选中excel中的对象

    2007在查找和选择中点击“选择对象”,然后再全选全个sheet(ctrl+a)就可以看到了. 2010 “选择对象”在  开始——查找和选择——选择对象

  6. [译] ASP.NET 生命周期 – ASP.NET 上下文对象(七)

    使用 HttpRequest 对象 HttpRequest 对象描述的是一个正在被处理的 HTTP 请求.下表列举了 HttpRequest 中的属性,它们提供了当前请求的相关信息(HttpReque ...

  7. 【BZOJ1305】 [CQOI2009]dance跳舞

    Description 一次舞会有n个男孩和n个女孩.每首曲子开始时,所有男孩和女孩恰好配成n对跳交谊舞.每个男孩都不会和同一个女孩跳两首(或更多)舞曲.有一些男孩女孩相互喜欢,而其他相互不喜欢(不会 ...

  8. MySQL与Oracle主键Query性能测试结果

    测试结果总结如下: 1. 按主键读:SQL形式:SELECT * FROM table WHERE id=?. 1.1. 主键为数字.如果所有ID均不存在,纯比较SQL解析能力.MySQL解析SQL的 ...

  9. 在DataTable中执行DataTable.Select("条件")

     .在DataTable中执行DataTable.Select("条件")返回DataTable:  // <summary> // 执行DataTable中的查询返回 ...

  10. Javascript字典操作

    <script type="text/javascript">        var dic = new Array();      //注意它的类型是Array    ...