Storm实战常见问题及解决方案
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目录
1.3 关于Storm中tuple 的可靠处理问题... 2
1.5 关于Storm如何处理重复的tuple问题... 3
1.9 关于IRichBolt与IBasicBolt接口的区别... 4
2.1 发布topologies 到远程集群时,出现Nimbus host is not set 异常... 4
2.2 发布topology到远程集群时,出现AlreadyAliveException(msg: xxx is already active)异常 4
2.3 启动Supervisor 时,出现java.lang.UnsatisfiedLinkError. 4
2.4 发布topologies 时,出现不能序列化log4j.Logger 的异常... 4
2.5 bolt 在处理消息时,worker 的日志中出现Failing message. 5
2.6 在打包toplogy工程的时候, 如果采用assembly方式, 对于相关的依赖的配置一般要这样: 5
2.7 在提交topology的时候有时可能出现如下异常: 5
3.1 发布drpc 类型的topologies 到远程集群时,出现空指针异常,连接drpc服务器失败... 6
3.2 客户端调用drpc 服务时,worker 的日志中出现Failing message,而bolt都未收到数据 6
4.1 storm 启动时报no jzmq in java.library.path 错误... 6
4.2 安装jzmq 时遇到No rule to make target ‘classdist_noinst.stamp’的make 错误... 7
4.3 安装jzmq 时遇到cannot access org.zeromq.ZMQ 的make 错误... 7
4.4 在部署storm节点的时候需要安装jzmq和zeromq, 在安装这两个依赖包之后, 需要执行sudo -u root ldconfig. 否则会出现异常: 7
6.2 干掉supervisor上的所有storm进程: 8
8.1 首先maven的pom文件中的storm依赖,要么加exclude storm的相关语句(github有说明),要么加<scope>,如下: 9
8.2 使用maven插件,在打jar包时,包含依赖。... 9
13 关于java.lang.NoClassDefFoundError: clojure.core.protocols$. 12
15 关于metaq启动的出现服务拒绝连接的问题... 13
文档说明
该文档包涵了storm实战中经常遇到一些问题,及对应解决方案。这个文档是群里一个朋友在学习storm,并实战storm中遇到的一些问题,及和群里其他朋友一起交流给出的对应解决方案,并由他整理好,委托我发布出来(也算是交流者之一),供大家参考,希望能对大家有所帮助。
感谢 某某(哈哈 鉴于部分原因,不便透露名字~~~~!)…
问题锦集
1关于Storm集群
1.1关于storm集群的环境变量配置问题
安装好JDK后,需要配置环境变量,通常情况下出于经验,我们往往会修改/etc/profile的值进行环境变量配置,但这在安装JDK以及后面安装的storm集群、zookeeper集群以及metaq集群时会出问题,这时候我们需要在/etc/.bashrc文件中加入环境变量,不然安装的java和ZK集群等就无法使用,尤其这个问题在我用shell写调度脚本去启动storm集群的时候就遇到过,如果没有将java的环境变量配置在/etc/.bashrc文件中,就会报一个错,这个问题在后面我会提到。
1.2关于zookeeper集群安装问题
记得刚刚接触storm,在安装zookeeper集群的时候有这样的考虑:为什么不可以把zookeeper只安装在nimbus上,然后让其他的supervisor来它这里读取任务?如果在每台机器上都安装zookeeper,那nimbus分配任务的时候,是每台机器上的zookeeper都收到同一份的任务,还是只是将分配给每个supervisor节点的那部分写到同一节点上的zookeeper中?
有朋友解答说:ZK也是以集群的方式工作的,ZK集群内部有他自己的一套相互通信机制,而storm正是要借助其通讯机制,例如任务下发等,往往在执行一个任务的时候,storm会把任务及相关执行的代码经过序列化之后发送到各个ZK节点供supervisor去下载,然后才会各自执行自己部分的代码或者任务。说的直接一点就是每个ZK节点收到的任务是一样的,而supervisor只需要下载属于自己的任务即可。
1.3关于Storm中tuple 的可靠处理问题
Storm 为了保证tuple 的可靠处理,需要保存tuple 信息,这样会不会导致内存泄漏?
关于这个问题,其实网上是有资料进行了详细的解释的。这里只是大概将一下,如果还不明白,可以上网搜搜“storm可靠处理”。Storm 为了保证tuple 的可靠处理,acker 会保存该节点创建的tuple id的xor (异或)值,这个值称为ack value,那么每ack 一次,就将tuple id 和ack value做异或(xor)。当所有产生的tuple 都被ack 的时候,ack value 必定为0。这是个很简单的策略,对于每一个tuple 也只要占用约20 个字节的内存。对于100万tuple,也才20M 左右,所以一般情况下是不用考虑内存泄漏问题的。
1.4关于storm计算结果的存放问题
很多人在刚刚学习Storm 的时候都会有这个问题:storm处理后的结果保存在哪里? 内存中?还是其他地方?
官方解释说: Storm 是不负责保存计算结果的,这是应用程序里需要负责的事情,如果数据不大,你可以简单地保存在内存里,也可以每次都更新数据库,也可以采用NoSQL存储。storm 并没有像s4 那样提供一个Persist API,根据时间或者容量来做存储输出。这部分事情完全交给用户。数据存储之后的展现,也是你需要自己处理的,storm UI 只提供对topology 的监控和统计。
1.5关于Storm如何处理重复的tuple问题
有人问到Storm 是怎么处理重复的tuple?
因为Storm 要保证tuple 的可靠处理,当tuple 处理失败或者超时的时候,spout 会fail 并重新发送该tuple,那么就会有tuple 重复计算的问题。这个问题是很难解决的,storm 也没有提供机制帮助你解决。不过也有一些可行的策略:
(1)不处理,这也算是种策略。因为实时计算通常并不要求很高的精确度,后
续的批处理计算会更正实时计算的误差。
(2)使用第三方集中存储来过滤,比如利用MySQL、MemCached 或者Redis 根据逻辑主键来去重。
(3)使用bloom filter 做过滤,简单高效。
1.6关于task与executor的关系问题
在storm的学习过程中,有许多人问到task与executor的关系问题。
在我们安装配置storm的时候,不知大家是否主要到了一个问题,就是我们在配置的时候会加几个worker的端口( supervisor.slots.ports:),比如众多文档中提到的6700/6701等等类似的东西。没错,这就是我们定义了该supervisor最多的worker数,worker中执行一个bolt或者spout线程,我们就称之为task,而executor是物理上的线程概念,我们可以将其称为执行线程;而task更多是逻辑概念上的,有时候bolt与spout的task会共用一个executor,特别是在系统负荷比较高的时候。
1.7关于Storm UI显示内容的问题
Storm UI 里spout 统计的complete latency 的具体含义是什么?为什么emit 的数目会是acked 的两倍?
简单地说,complete latency 表示了tuple 从emit 到被acked 经过的时间,可以认为是tuple 以及该tuple 的后续子孙(形成一棵树)整个处理时间。其次spout 的emit 和transfered 还统计了spout 和acker 之间内部的通信信息,比如对于可靠处理的spout 来说,会在emit 的时候同时发送一个_ack_init 给acker,记录tuple id 到task id 的映射,以便ack 的时候能找到正确的acker task。
1.8关于Storm的ack和fail问题
在学习storm的过程中,有不少人对storm的Spout组件中的ack及fail相关的问题存在困惑,这里做一个简要的概述。
Storm保证每一个数据都得到有效处理,这是如何保证的呢?正是ack及fail机制确保数据都得到处理的保证,但是storm只是提供给我们一个接口,而具体的方法得由我们自己来实现。例如在spout下一个拓扑节点的bolt上,我们定义某种情况下为数据处理失败,则调用fail,则我们可以在fail方法中进行数据重发,这样就保证了数据都得到了处理。其实,通过读storm的源码,里面有讲到,有些类(BaseBasicBolt?)是会自动调用ack和fail的,不需要我们程序员去ack和fail,但是其他Bolt就没有这种功能了。
1.9关于IRichBolt与IBasicBolt接口的区别
首先从类的组成上进行分析可以看到,IBasicBolt接口只有execute方法和declareOutputFields方法,而IRichBolt接口上除了以上几个方法还有prepare方法和cleanup及map方法。而且其中execute方法是有些不一样的,其参数列表不同。
总体来说Rich方法比较完善,我们可以使用prepare方法进行该Bolt类的初始化工作,例如我们链接数据库时,需要进行一次数据库连接操作,我们就可以把该操作放入prepare中,只需要执行一次就可以了。而cleanup方法能在该类调用结束时进行收尾工作,往往在处理数据的时候用到,例如在写hdfs(hadoop的文件系统)数据的时候,在结束时需要进行数据clear,则需要进行数据收尾。当然,根据官网及实际的测验,该方法往往是执行失败的。
2关于Topology发布
2.1发布topologies 到远程集群时,出现Nimbus host is not set 异常
原因是Nimbus 没有被正确启动起来,可能是storm.yaml 文件没有配置,或者配置有问题。
解决方法:打开storm.yaml 文件正确配置:nimbus.host: "xxx.xxx.xxx.xxx",重启nimbus 后台程序即可。
2.2发布topology到远程集群时,出现AlreadyAliveException(msg: xxx is already active)异常
原因是提供的topology 与已经在运行的topology 重名。
解决方法:发布时换一个拓扑名称即可。
2.3启动Supervisor 时,出现java.lang.UnsatisfiedLinkError
具体信息:启动Supervisor 时,出现java.lang.UnsatisfiedLinkError:
/usr/local/lib/libjzmq.so.0.0.0: libzmq.so.1: cannot open shared object
file: No such file or directory 异常。
原因是未找到zmq 动态链接库。
解决方法1:配置环境变量 export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib
解决方法2:编辑/etc/ld.so.conf 文件,增加一行:/usr/local/lib。再执行
sudo ldconfig 命令,重启Supervisor。
2.4发布topologies 时,出现不能序列化log4j.Logger 的异常
原因是日志系统无法正确支付序列化。
解决方法:使用slf4j 代替log4j。
2.5 bolt在处理消息时,worker 的日志中出现Failing message
原因:可能是因为Topology 的消息处理超时所致。
解决方法:提交Topology 时设置适当的消息超时时间,比默认消息超时时间(30
秒)更长。比如:
conf.setMessageTimeoutSecs(60);
2.6在打包toplogy工程的时候, 如果采用assembly方式, 对于相关的依赖的配置一般要这样:
Xml 代码
1. <dependencySets>
2. <dependencySet>
3. <outputDirectory> / </outputDirectory>
4. <unpack> true </unpack>
5. <excludes>
6. <exclude> storm:storm </exclude>
7. </excludes>
8. </dependencySet>
9. </dependencySets>
wiki上说可以用<scope>compile</scope>。然后将storm依赖设置为runtime, 貌似不行。 另外就是所有的依赖包将全部解压, 然后将所有依赖的配置和class文件生成一个文件。这个是通过<unpack>true</unpack>参数来控制的。
2.7在提交topology的时候有时可能出现如下异常:
Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException : Nimbus host is not set
at backtype.storm.utils.NimbusClient.<init>(NimbusClient.java:30)
at backtype.storm.utils.NimbusClient.getConfiguredClient(NimbusClient.java:17)
at backtype.storm.StormSubmitter.submitJar(StormSubmitter.java:78)
at backtype.storm.StormSubmitter.submitJar(StormSubmitter.java:71)
at backtype.storm.StormSubmitter.submitTopology(StormSubmitter.java:50)
at com.taobao.kaleidoscope.storm.IcdbTopology.main(IcdbTopology.java:59)
但是启动nimbus是没有问题的, 这个主要因为conf_dir路径设置不正确, 在bin/storm脚本中需要加上这样一句:
Python 代码
1. CONF_DIR = STORM_DIR + "/conf"
3关于DRPC
3.1发布drpc 类型的topologies 到远程集群时,出现空指针异常,连接drpc服务器失败
原因是未正确配置drpc 服务器地址。
解决方法:在conf/storm.yaml 文件中增加drpc 服务器配置,启动配置文件中
指定的所有drpc 服务。内容如下:
drpc.servers:
- "drpc 服务器ip"
3.2客户端调用drpc 服务时,worker 的日志中出现Failing message,而bolt都未收到数据
错误日志如下所示:
2011-12-02 09:59:16 task [INFO] Failing message
backtype.storm.drpc.DRPCSpout$DRPCMessageId@3770bdf7: source: 1:27,
stream: 1, id: {-5919451531315711689=-5919451531315711689},
[foo.com/blog/1, {"port":3772,"id":"5","host":"10.0.0.24"}]
原因是主机名,域名,hosts 文件配置不正确会引起这类错误。
解决方法:检查并修改storm 相关机器的主机名,域名,hosts 文件。重启网络服务:service network restart。重启storm,再次调用drpc 服务,成功。Hosts 文件中必须包含如下
内容:
[nimbus 主机ip] [nimbus 主机名] [nimbus 主机别名]
[supervisor 主机ip] [supervisor 主机名] [supervisor 主机别名]
[zookeeper 主机ip] [zookeeper 主机名] [zookeeper 主机别名]
4关于jzmq安装
4.1 storm启动时报no jzmq in java.library.path 错误
原因是找不到jzmq,默认情况下在执行install_zmq.sh 时,那些.so 文件
安装路径在/usr/local/lib,但是实际安装时可能装在其他的路径下了。
解决方法:在storm.yaml 中添加:
java.library.path:
"/opt/storm/jzmq/lib:/opt/storm/zeromq/lib:/usr/local/lib:/opt/local/
lib:/usr/lib"
4.2安装jzmq 时遇到No rule to make target ‘classdist_noinst.stamp’的make 错误
具体的make 错误信息:
make[1]: *** No rule to make target `classdist_noinst.stamp',needed by `org/zeromq/ZMQ.class'. Stop.
解决方法:手动创建classdist_noinst.stamp 空文件。
touch src/classdist_noinst.stamp
4.3安装jzmq 时遇到cannot access org.zeromq.ZMQ 的make 错误
具体的make 错误信息:
error: cannot access org.zeromq.ZMQ class file for org.zeromq.ZMQ not found
javadoc: error - Class org.zeromq.ZMQ not found.
解决方法:手动编译,然后重新make 即可通过。
cd src
javac -d . org/zeromq/*.java
cd ..
4.4 在部署storm节点的时候需要安装jzmq和zeromq, 在安装这两个依赖包之后, 需要执行sudo -u root ldconfig. 否则会出现异常:
2012-02-24 16:30:30 worker [ERROR] Error on initialization of server mk-worker
java.lang.UnsatisfiedLinkError: /usr/local/lib/libjzmq.so.0.0.0: libzmq.so.1: cannot open shared object file: No such file or
directory
at java.lang.ClassLoader$NativeLibrary.load(Native Method)
at java.lang.ClassLoader.loadLibrary0(ClassLoader.java:1803)
at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(ClassLoader.java:1728)
at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Runtime.java:823)
at java.lang.System.loadLibrary(System.java:1028)
at org.zeromq.ZMQ.<clinit>(ZMQ.java:34)
5关于Storm的配置问题
1. yaml跟我们一般用的属性配置文件有所不同, 它的要求更严格一些, 因此在往conf/storm.yaml中添加配置的时候必须注意,比如必须注意开始位置和冒号后面的空格, 否则配置不会生效。
2. 如何检查配置是否生效?
可以使用命令: storm localconfvalue 配置关键字
但是这个命令只能在nimbus上生效, 在supervisor看到的还是默认值. 不知道为什么 。
6关闭storm相关进程
6.1关闭nimbus相关进程:
kill `ps aux | egrep '(daemon\.nimbus)|(storm\.ui\.core)' | fgrep -v egrep | awk '{print $2}'`
备注:这是在网上看到的,没有经过实际测试,有兴趣的朋友可以自己测试一下。
6.2干掉supervisor上的所有storm进程:
kill `ps aux | fgrep storm | fgrep -v 'fgrep' | awk '{print $2}'`
备注:这是在网上看到的,没有经过实际测试,有兴趣的朋友可以自己测试一下。
7关于Topology发布之后的log
1) 用storm jar ...将项目提交给storm集群后,想查看本项目的log信息,要到supervisor机器的:storm安装路径/logs/worker-number.log(其中的number视实际情况而定)中查看。
2) 如果是用daemontools启动的storm,daemontools监控的目录是/service/storm,那么到/service/storm/logs中查看worker-number.log日志。
3) 若要更改log的级别,是debug还是info等,在storm安装路径/log4j下有个配置文件,按需要修改即可。
4) Storm的debug模式下,它本身的log非常庞大,所以我觉得自己的代码中有些重要的信息,用info比较好,这样将storm的log级别调整为info比较方便查看。
8关于maven打包问题
8.1首先maven的pom文件中的storm依赖,要么加exclude storm的相关语句(github有说明),要么加<scope>,如下:
<dependency>
<groupId>storm</groupId>
<artifactId>storm</artifactId>
<scope>test</scope>
</dependency>
加scope可以使打jar包时,不包含storm。如果包含了storm,那么提交到storm集群,会运行出错。官方要求打jar包时,要去除storm的依赖。
8.2使用maven插件,在打jar包时,包含依赖。
在pom中加入:
<plugin>
<artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId>
<configuration>
<descriptorRefs>
<descriptorRef>jar-with-dependencies</descriptorRef>
</descriptorRefs>
<archive>
<manifest>
<mainClass>com.path.to.main.Class</mainClass>
</manifest>
</archive>
</configuration>
</plugin>
打jar包时使用命令:mvn assembly:assembly
8.3依赖的jar冲突问题
如果本地依赖的jar与storm的lib下的jar有冲突,即都用了一个jar,但是版本不同,那么貌似目前只能改为跟storm保持统一。官方的讨论组是这样说的。
9关于nimbus的启动问题
9.1 Storm nimbus启动失败
在使用了storm一段时间后,需要重新部署storm的集群,主要是想将storm部署在其它机器上。做了以下错误操作:
1) 没有kill 正在运行的topology,kill nimbus和supervisor的storm进程
2) 删除了配置中"storm.local.dir"的文件夹内的内容
3) 启动storm nimbus
报错:
backtype.storm.daemon.nimbus
$fn__2692$exec_fn__945__auto____2693$this__2731@62135133
java.io.FileNotFoundException: File '/opt/apps-install/storm/
storm_local/nimbus/stormdist/appFailed-6-1325065153/stormconf.ser'
does not exist
at
org.apache.commons.io.FileUtils.openInputStream(FileUtils.java:137)
at
org.apache.commons.io.FileUtils.readFileToByteArray(FileUtils.java:
1135)
at backtype.storm.daemon.nimbus
$read_storm_conf.invoke(nimbus.clj:128)
at backtype.storm.daemon.nimbus
$compute_new_task__GT_node_PLUS_port.invoke(nimbus.clj:244)
at backtype.storm.daemon.nimbus
$mk_assignments.invoke(nimbus.clj:288)
at backtype.storm.daemon.nimbus
$fn__2692$exec_fn__945__auto____2693$this__2731.invoke(nimbus.clj:460)
at backtype.storm.event$event_manager
$fn__2068$fn__2069.invoke(event.clj:25)
at backtype.storm.event$event_manager
$fn__2068.invoke(event.clj:22)
at clojure.lang.AFn.run(AFn.java:24)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:662)
2011-12-29 16:15:02 util [INFO] Halting process: ("Error when
processing an event")
报错原因:因为没有先kill topology,所以在启动nimbus时,zookeeper中依然保留了上次运行着的topology的信息。
解决办法:用zookeeper的zkCli.sh清理一下,我直接重装了zookeeper。但是据说在storm 0.6.1中解决了该bug。而我用的是storm 0.6.0。
10 Storm使用JVM参数
在配置文件storm.yaml中,有:
# to nimbus
nimbus.childopts: "-Xmx1024m"
# to supervisor
supervisor.childopts: "-Xmx1024m"
# to worker
worker.childopts: "-Xmx768m"
如果worker在运行时,需要用指定的JVM参数,那么可以像这样配置:
worker.childopts: "-Dworker=worker -Xmx768m -Xdebug –Xnoagent -Djava.compiler=NONE -Xrunjdwp:transport=dt_socket,address=8111,suspend=y,server=y "
11关于spout/bolt的生命周期
一般来说spout/bolt的生命周期如下:
1 在提交了一个topology之后(在nimbus所在的机器), 创建spout/bolt实例(spout/bolt在storm中统称为component)并进行序列化;
2 将序列化的component发送给所有的任务所在的机器;
3 在每一个任务上反序列化component;
4 在开始执行任务之前, 先执行component的初始化方法(bolt是prepare, spout是open);
因此component的初始化操作应该在prepare/open方法中进行, 而不是在实例化component的时候进行。
12关于storm与spring框架集成问题
首先声明一下,这个问题是当时有考虑到是否可以将storm与spring集成时,在网上看到的一点介绍,只是为了日后做参考。
在进行storm与spring集成时,本来想着一次就能成功,抱着很大的希望可是运行时竟然报了个java.io.NotSerializableException 的异常。该异常要求被依赖注入的jar包实现序列化接口,但那些jar包都是别人开发的你不能一个一个都改掉 源码 才能用到项目里。
再网上找一下还真有人遇到类似的问题,具体原因是对storm的spout和bolt的生命周期理解的不够深刻。
一般来说spout/bolt的生命周期如下:
1.在提交了一个topology之后(在nimbus所在的机器), 创建spout/bolt实例(spout/bolt在storm中统称为component)并进行序列化.
2.将序列化的component发送给所有的任务所在的机器
3.在每一个任务上反序列化component.
4.在开始执行任务之前, 先执行component的初始化方法(bolt是prepare, spout是open).
因此component的初始化操作应该在prepare/open方法中进行, 而不是在实例化component的时候进行.
按照这种说法进行改造,结构该问题消失了。但接下来又有了新的问题:
Caused by: org.xml.sax.SAXParseException: Content is not allowed in prolog.
这个异常网上搜索之后发现原来是由于*.xml文件编码的问题。原因是在从其他项目里或者编辑工具编辑时,在文件编码中加入了BOM头的原因,于是用notePad++打开xml文件选择去掉BOM头信息,重新进行保存即可。
13关于java.lang.NoClassDefFoundError: clojure.core.protocols$
原因:JDK版本不匹配,安装虚拟机时系统自带一个jdk.1.5.0。
解决办法:检查jdk版本,卸载系统自带的JDK,使用自己安装的JDK版本。
# rpm –qa | grep java
# rpm –e –nodeps java-*
配置环境变量,vi /etc/profile
重新执行一遍试试,貌似问题解决了。
14关于storm连接Mysql
连接远程mysql是报如下错误:
message from server:"Host FILTER" is not allowed to connect to this MySQL server
解决方案:
很可能是你没有给其他IP访问你数据库的权限,你可以试试:
在MySql数据库的主机上,在mysql命令行中输入以下命令:
grant all on *.* to root@'%' identified by "111111" ;
这样,给任何IP都赋予了访问的权限,
任何IP都能以,用户名:root ,密码:111111
来进行局域网的访问!
(命令中*.*是通配任何IP,你也可以指定IP)
15关于metaq启动的出现服务拒绝连接的问题
解决办法:在metaq安装目录下,删掉之前的日志文件,测试网络是否正常连接。将之前的服务的metaq进程kill掉,然后重启。
16关于topology的spout与bolt
之前有问到,一个topology中可不可以有多个spout?这个问题貌似很幼稚啊,呵呵。关于这个问题,我是这样考虑的:实际应用中,如果我们每一条应用都创建一个topology的话,未免也太夸张了。如果是同一个应用,同一个数据来源,但是你想分几种方式对这个数据做处理的话,这时候就应该是建多个spout了,让这些spout并行去读数据,然后交给订阅这个spout的bolt去处理就行,
17关于shell脚本编码格式问题
这是我在写启动storm集群的shell脚本时遇到的一个实际问题。shell脚本运行时报错误:/bin/bash^M: bad interpreter
出现原因:windows上写的脚本,直接拷贝到linux系统上运行由于格式不兼容导致。
17.1解决方案(一):
1. 比如文件名为myshell.sh,vim myshell.sh
2. 执行vim中的命令 : set ff?查看文件格式,如果显示fileformat=dos,证明文件格式有问题。
3. 执行vim中的命令 :set fileformat=unix 将文件格式改过来就可以了,然后:wq保存退出就可以了。
17.2解决方案(二)
或者使用最笨的方法:将windows下编辑好的脚本通过txt文本格式转换,然后在拷贝到linux下。
如果是使用Notepad编辑器进行编辑的话,可以在菜单栏上选择“编辑”—“档案格式转换”—“转换为 UNIX 格式”。
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