更新时间:2019.09.23

1. 序言

之前曾经用过一段时间的R(一直忍受着原生R那个超级“简洁”的界面),但是后来重装了系统并且学习了Python,就没有再怎么碰过R了。然而这两学期又开个R语言的课(统计狗一枚),只能再重新装一下。
这次有点不同的是,是想直接将R的内核嵌入到jupyter notebook中,用jupyter notebook来写R。为了方便起见,记录一些安装的过程,以便不时之需。

2. R的下载

其实,R的下载十分的简单,一种方法是直接进入R的官网-->选择download R-->选择China的镜像(像清华源)-->Download R for Windows(我的是windows系统)-->选择base版的直接下载就可以了

3. IDE---RStudio

从官网上下载下来的R界面极其“简洁”,除了jupyter notebook以外,我们也可以使用RStudio(从官网上下载,点击安装包,无脑点击下一步就可以了)。当然需要注意的是一定要先安装R,才能使用RStudio。

  • ps:从官网上下载RStudio的速度很慢,有时还下不了(毕竟是国外的网站),也试一下用conda来安装。

3. jupyter notebook中的R内核嵌入

将jupyter notebook中的R内核嵌入主要有两种方法,其中强烈建议anaconda的用户用第一种方法。
方法1:利用anaconda进行安装

  1. 安装R的命令:conda install -c r r-essentials,使用这个命令可以直接将R下载并嵌入jupyter notebook中,此外还能对R的各种包进行管理,可谓是一举多得。
  2. 安装RStudio的命令:conda install -c r rstudio
  3. 安装R的包:conda install -c r r-vcd,以安装vcd包为例
  4. 删除R的包:conda remove r-vcd,以删除vcd包为例
  5. 更新R的包:conda update r-vcd, 以更新vcd包为例

方法2:手动嵌入R的内核
主要是参考这篇文章:Jupyter Notebook/Lab中添加R Kernel的详细步骤,为了方便查看,把内容转载到下面:

  1. 打开R安装相关的包(没有选择镜像的需要选择),输入install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
  2. 安装 IRkernel包,输入devtools::install_github('IRkernel/IRkernel'),其中更新该包时也需要使用devtools::,而R中其他包使用update.packages()命令进行更新即可。
  3. 通过intallspec()函数,使Jupyter能找到刚刚安装的R核:
    • 可以直接安装在当前用户中:IRkernel::installspec()
    • 通过设置user=FALSE安装在系统中,建议使用第二种:IRkernel::installspec(user = FALSE)
  4. ps:值得注意的是,手动嵌入内核的时候,第三步可能会发生错误,其中一个原因是jupyter与R没有安装在同一个环境

R的安装的更多相关文章

  1. 如何将R包安装到自定义路径

    参考  设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径   实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参 ...

  2. R语言安装xlsx包,读入excel表格

    开学的时候,男神给了数据(.xlsx格式)让用R语言分析分析,作为编程小白,读了一天都没读近R,更别提如何分析了. 现在小伙伴们都喜欢读txt 和csv格式的,好多xlsx的表格读不进R,将xlsx格 ...

  3. R 语言安装

    在linux下,对于手动安装的软件,当时间长了,我们就会忘记安装这个软件的细节.这就不利于以后软件的卸载工作了.而yum则会帮我们记住相关安装细节,当软件被卸载的时候,没用的文件也会一并被删除.因此, ...

  4. linux ubuntu R 无法安装rggobi包的原因及解决方案

    错误信息 Package'libxml-2.0',requiredby'ggobi',notfound     错误原因 ggobi缺乏libxml依赖 解决方案 sudo apt install l ...

  5. linux-ubuntu 下R无法安装HH包的原因及解决方案

    错误信息: configure: error: GNU MP not found, or not 4.1.4 or up, see http://gmplib.org ERROR: configura ...

  6. R简易安装

    post={"title":"my Blog post","content":"Here's my blog post" ...

  7. 在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3

    在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3 Seurat  作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道.Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中 ...

  8. Linux下R环境安装

    R环境的两种安装方式,源码编译安装和yum在线安装 第一种:源码编译安装 1.首先,从官网上下载3.5.0版本 2.下载完后记得解压,我的习惯是解压在/usr/local下面 tar -zxvf R- ...

  9. R的安装以及包安装

        今天看论文,需要用到R语言的库,于是又折腾了半天..     其实并没有什么太大的问题,只是在第三方包的下载方面还有python中使用R方面遇到了问题: 第三方包的导入      其实在网上有 ...

随机推荐

  1. python中pyqt5的进度条--python实战(十)

    python太博大精深了,使用场景非常多.最近笔者一直使用PyQt5编一些小程序,顺便就把一些常用的东西列出来,做个记录和积累吧.进度条是非常常用的东西,今天用的时候,顺便温习了一下,这个东西自己感觉 ...

  2. java数据结构——二叉树(BinaryTree)

    前面我们已经学习了一些线性结构的数据结构和算法,接下来我们开始学习非线性结构的内容. 二叉树 前面显示增.删.查.遍历方法,完整代码在最后面. /** * 为什么我们要学习树结构. * 1.有序数组插 ...

  3. 【Django】ModelForm

    ModelForm 1.Model与Form内容回顾 Model - 数据库操作 - 验证 class A(MOdel): user = email = pwd = Form - class Logi ...

  4. Redis 5.0 redis-cli --cluster help说明

    背景: Redis Cluster 在5.0之后取消了ruby脚本 redis-trib.rb的支持(手动命令行添加集群的方式不变),集合到redis-cli里,避免了再安装ruby的相关环境.直接使 ...

  5. unzip 命令指定解压路径

    在使用unzip进行文件包解压,可以用来解压zip/jar/war包类型,有时解压时需要解压到指定路径时可以使用参数 -d 来指定,例如: unzip services-bak.jar -d ./we ...

  6. line-height属性

    line-height属性的细节 与大多数CSS属性不同,line-height支持属性值设置为无单位的数字.有无单位在子元素继承属性时有微妙的不同. 语法 line-height: normal | ...

  7. git基本命令整合

    基础命令 用户设置 $ git config --global user.name "Your Name" $ git config --global user.email &qu ...

  8. Kubernetes 系列(七):持久化存储StorageClass

    前面的课程中我们学习了 PV 和 PVC 的使用方法,但是前面的 PV 都是静态的,什么意思?就是我要使用的一个 PVC 的话就必须手动去创建一个 PV,我们也说过这种方式在很大程度上并不能满足我们的 ...

  9. linux分析工具之vmstat详解

    一.概述 vmstat命令是最常见的Linux/Unix监控工具,可以展现给定时间间隔的服务器的状态值,包括服务器的CPU使用率,内存使用,虚拟内存交换情况,IO读写情况.首先我们查看下帮助.如下图所 ...

  10. 如何在linux下编写一个简单的Shell脚本程序

    在了解了linux终端和其搭配的基本Shell(默认为bash)的基础下,我们就可以在终端中用vi/vim编辑器编写一个shell的脚本程序了 Shell既为一种命令解释解释工具,又是一种脚本编程语言 ...