转录本(transcript)长度范围  到

--3216021----

3UTR                       stop_codon                      CDS3         |      |           CDS2       |      |           CDS1                       start_codon                     5UTR

|      |                           |      |

3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498

exon3(3UTR,stop_codon, CDS3)                                    exon3(CDS2)                                      exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)

解释 transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon关系

CDS,是编码一段蛋白产物的序列。cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。反之,每个orf不一定都是cds。
开放阅读框(ORF)是基因序列的一部分,有内含子的,且包含一段可以编码蛋白的碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。OEF排除内含子就是CDS

25、转录本(transcript)组成(gtf文件的第三列)的更多相关文章

  1. 【转】C语言文件操作解析(三)

    原文网址:http://www.cnblogs.com/dolphin0520/archive/2011/10/07/2200454.html C语言文件操作解析(三) 在前面已经讨论了文件打开操作, ...

  2. Django文件上传三种方式以及简单预览功能

    主要内容: 一.文件长传的三种方式 二.简单预览功能实现 一.form表单上传 1.页面代码 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> ...

  3. matlab之导入txt文件并取其中一列数据

    1.我想导入下面这个文件的内容,并且获取这个文件中的两列数据. 2.首先确保Matlab当前所在文件夹为txt文件所在文件夹,然后命令行执行: X = load('2019_03_21_08_59_0 ...

  4. linux清空文件内容的三种方法

    linux系统中清空文件内容的三种方法 1.使用vi/vim命令打开文件后,输入"%d"清空,后保存即可.但当文件内容较大时,处理较慢,命令如下:vim file_name:%d: ...

  5. Ajax文件上传三式

    文件上传(三式) 1.urls.py文件 url(r'^upload.html$', views.upload), 2.views.py文件 import os def upload(request) ...

  6. 文件上传三:base64编码上传

    介绍三种上传方式: 文件上传一:伪刷新上传 文件上传二:FormData上传 文件上传三:base64编码上传 Flash的方式也玩过,现在不推荐用了. 优点: 1.浏览器可以马上展示图像,不需要先上 ...

  7. GTF文件

    一.GTF文件格式 Fields must be tab-separated. Also, all but the final field in each feature line must cont ...

  8. 第18月第25天 github下载单个文件夹 git命令

    1. 用 SVN 即可. 举例说明: 譬如这个项目: Mooophy/Cpp-Primer · GitHub, 我只想看 ch03 文件夹的代码怎么办? 先打开 ch03, 其 URL 为: &quo ...

  9. Shell系列(25)- 条件判断之文件权限

    按照文件权限进行判断 读.写.执行等选项权限,只要有,就返回真 不会按照所属者,所属用户组,其他用户进行区分 先判断文件是否存在,再去判断选项权限 测试选项 作用(标红熟记) -r 文件 判断该文件是 ...

随机推荐

  1. 算法(Algorithms)第4版 练习 1.5.22

    package com.qiusongde; import edu.princeton.cs.algs4.StdOut; import edu.princeton.cs.algs4.StdStats; ...

  2. DL二(稀疏自编码器 Sparse Autoencoder)

    稀疏自编码器 Sparse Autoencoder 一神经网络(Neural Networks) 1.1 基本术语 神经网络(neural networks) 激活函数(activation func ...

  3. bzoj 1579: [Usaco2009 Feb]Revamping Trails 道路升级 优先队列+dij

    1579: [Usaco2009 Feb]Revamping Trails 道路升级 Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 64 MBSubmit: 1768  Solv ...

  4. matlab产生很多个相同的数字

    如产生100行1列的0.5: ones(100,1)*0.5:

  5. django实现用户注册、登录、退出

    视图 from django.contrib import auth from django.contrib.auth.models import User from django.views.dec ...

  6. Python TCP通信网络编程

    最近在看廖雪峰老师的基础教程(http://www.liaoxuefeng.com/),今天实现了一下简单Python的Socket的网络编程. 1. Socket网络编程 Socket是网络编程的一 ...

  7. SQL语言方方面面

    1 数据库和SQL 1.1 数据库 DB, DBMS DBMS的种类: 层次性数据库, 关系型数据库, 非关系型数据库 RDBMS, 关系数据库管理系统 1.2 数据库的结构 RDBMS常见的系统结构 ...

  8. 输入框input内容变化与onpropertychange事件的兼容

    一.输入框常用的几个事件 onblur 元素失去焦点. onchange 域的内容被改变. onclick 当用户点击某个对象时调用的事件句柄. ondblclick 当用户双击某个对象时调用的事件句 ...

  9. 使用Visual Studio进行单元测试-Shim类中无法找到参数包含CancellationTokenSource的方法

    Shim类中无法找到参数包含CancellationTokenSource的方法,这句话有点绕口,看例子. 一.代码 public class CancellationDemo { public in ...

  10. DOM基础知识整理

    --<JavaScript高级程序设计>Chapter10学习笔记 一.节点层次 1.Node类型 1)(Node).nodeType属性 节点nodeType属性有12种. 检测node ...