我生信入门，老师就要求我学好blast比对，说得也确实是很有道理，是个人都知道比对是最基本的东西，现在再想想那老师的建议，也只能呵呵一笑。

北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索，可以好好看看，快速入门。

序列数据库搜索

BLAST算法

Basic Local Alignment Search Tool

BLAST使用

BLAST - 序列数据库搜索的更多相关文章

  1. 序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介

    根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的. 数据同源搜索软件Fasta和Blast 是目前功能最全,使用最广的同源性数据库搜索软件包.他们在Needleman的动态算法 ...

  2. 时序列数据库武斗大会之什么是 TSDB ？

    本文选自 OneAPM Cloud Insight 高级工程师刘斌博客 . 刘斌,一个才思敏捷的程序员,<第一本 Docker 书>.<GitHub 入门与实践>等书籍译者,D ...

  3. [转]时序列数据库武斗大会之什么是TSDB

    由于工作上的关系,最近看了一些关于时序列数据库的东西,当然,我所看的也都是以开源方案为主. 趁着这股热劲还没退,希望能整理一些资料出来.如果正好你也有这方面的需求,那么希望这一系列的介绍能够帮助到你. ...

  4. Uncovering thousands of new peptides with sequence-mask-search hybrid de novo peptide sequencing framework （使用序列掩码搜索结合肽段从头测序框架发现了数千个新肽段）-解读人：刘佳维

    期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位: 朱拉隆功大学 费城威斯塔研究所 物种:人 技术:de novo ...

  5. 时序列数据库武斗大会之 OpenTSDB 篇

    [编者按] 刘斌,OneAPM后端研发工程师,拥有10多年编程经验,参与过大型金融.通信以及Android手机操作系的开发,熟悉Linux及后台开发技术.曾参与翻译过<第一本Docker书> ...

  6. 时序列数据库武斗大会之TSDB名录 Part 2

    [编者按] 刘斌,OneAPM后端研发工程师,拥有10多年编程经验,参与过大型金融.通信以及Android手机操作系的开发,熟悉Linux及后台开发技术.曾参与翻译过<第一本Docker书> ...

  7. 时序列数据库武斗大会之 TSDB 名录 Part 1

    [编者按] 刘斌,OneAPM后端研发工程师,拥有10多年编程经验,参与过大型金融.通信以及Android手机操作系的开发,熟悉Linux及后台开发技术.曾参与翻译过<第一本Docker书> ...

  8. LeetCode 81. Search in Rotated Sorted Array II（在旋转有序序列中搜索之二）

    Follow up for "Search in Rotated Sorted Array":What if duplicates are allowed? Would this ...

  9. LeetCode 33. Search in Rotated Sorted Array（在旋转有序序列中搜索）

    Suppose an array sorted in ascending order is rotated at some pivot unknown to you beforehand. (i.e. ...

随机推荐

  1. idea使用心得(1)-快捷键用法

    快捷键: Ctrl+F12,可以显示当前文件的结构,Alt+7,可在左侧生成固定框体控件,适合类复杂的情况 Ctrl+Alt+O,优化导入的类和包 Ctrl+X,删除行 删除光标所在的哪一行,对尤其是 ...

  2. Java学习-047-数值格式化及小数位数四舍五入

    此小工具类主要用于数值四舍五入.数值格式化输出,很简单,若想深入研究,敬请自行查阅 BigDecimal 或 DecimalFormat 的 API,BigDecimal.setScale(位数,四舍 ...

  3. Android 高德地图No implementation found for long com.autonavi.amap.mapcore.MapCore

    此篇博客最后更新时间写自2016.5.18.当下高德地图jar版本为3.3.1. 使用高德地图碰到此问题,纠结许久(接近4个多小时). 记录在此,希望遇到相同问题的读者可以有所借鉴. 错误截图: 导致 ...

  4. ID3决策树的Java实现

    package DecisionTree; import java.io.*; import java.util.*; public class ID3 { //节点类 public class DT ...

  5. SQL scripts

    Add a column with default current date timeALTER TABLE [TableName]ADD CreatedOn DATETIME NOT NULL DE ...

  6. java虚拟机内部介绍

    一.介绍 java 的内存管理和垃圾回收在某种程度是同一个问题来着.对于java程序员来说,在虚拟机自动内存管理机制的帮助下,不在需要为每一个new操作去写配对的delete/free代码,不容易出现 ...

  7. C++之路进阶——bzoj2879（美食节）

    2879: [Noi2012]美食节 Time Limit: 10 Sec  Memory Limit: 512 MBSubmit: 1304  Solved: 702[Submit][Status] ...

  8. FORM 提示保存

    修改的FORM在编译到测试环境后打开并没有修改什么数据,却提示是否保存,检查->system.form_satus 为"changed": 个人实际解决情况为:在数据块级的触 ...

  9. 关于ClassLoader的一点小问题

    今天在看某框架的源码的时候,遇到一个使用URLClassLoader加载Servlet类的问题,当自己在eclipse里面做试验的时候,始终无法把Class加载成功.比如: ClassLoader c ...

  10. Oracle分组排序查询

    用sql查询每个分组中amount最大的前两条记录: SELECT *FROM HW trWHERE(SELECT COUNT(*) FROM HW WHERE tr.DEPID=DEPID AND ...