perl5
cpan是perl自带的安装包的一个程序,但是如果不是你自己的perl,而是集群的,那么你是没有权限去安装到root用户的man3等文件夹,因此也就不可能安装成功(没有权限),因此需要安装到自己的文件夹。
查看是否安装了包
perl -e 'use Parallel::ForkManager;' #以 Parallel::ForkManager为例
1、安装
Perl5 中用Perl包来创建模块。
linux/Unix下安装Perl模块有两种方法:手工安装和自动安装。第一种方法是从CPAN上下载您需要的模块,手工编译、安装。第二种方法是联上internet,使用一个叫做CPAN的模块自动完成下载、编译、安装的全过程。
Perl 模块是一个可重复使用的包,模块的名字与包名相同,定义的文件后缀为 .pm。
非root权限用户安装JSON/模块的时候(这个是repeatmasker所需要的):
https://metacpan.org/中下载JSON-4.02.tar.gz
tar zxvf JSON-4.02.tar.gz && cd JSON-4.02
perl Makefile.PL PREFIX=/home/dongjiangxing/perl5/lib/perl5
make
make install PREFIX=/home/dongjiangxing/perl5/lib/perl5
mv /home/dongjiangxing/perl5/lib/perl5/share/man/man3/* /home/dongjiangxing/perl5/man/man3
mv /home/dongjiangxing/perl5/lib/perl5/share/相应的包 /home/dongjiangxing/perl5/lib/perl5
#export PERL5LIB=/home/dongjiangxing/perl5/lib/perl5:$PERL5LIB( 第一次加入环境变量,后续就不用了)
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