经过几轮调试和修改,共线性图终于可以上眼了。如下:

图中红色的为目标基因,蓝色的为reference species目标基因周围15个基因,天蓝色为再往外15个基因,黄色为与reference species存在的共线性,灰色为相邻物种间的共线性。

标注有物种信息,scaffold信息,并用颜色加以区分物种的不同属性。

最后一章的代码和思路更新见公众号。

接下来公众号将继续更新R画图和文献等内容。

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