癌症蛋白质基因组学主要研究driver性质的突变，该突变有可能是转化为癌基因的突变、抑癌基因突变、药物位点突变和蛋白突变，可以使用mutation assessor 预测突变

突变导致疾病，修饰仅影响生物学功能

将序列库、图谱库、公共突变数据库和RNAseq组合起来构成组合数据库找突变。比如：

dbSNP：数据库收录的基因组变异数据

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/

n SwissVar：基于UniProt的突变和疾病数据库

http://swissvar.expasy.org/

n CanProVar：人类癌特异性突变数据库

http://bioinfo.vanderbilt.edu/canprovar/

CHPP 人类染色体蛋白质组计划是整合所有已知蛋白质信息，分析染色体上蛋白编码情况

Eg：1号染色体中未鉴定出的蛋白质：

大规模蛋白质组学具有未饱和性特点

蛋白质组与其他组学的关系图：

 

dbSNP|n SwissVar|n CanProVar|CHPP|mutation assessor|的更多相关文章

  1. Detailed Information for Outputted Files from Somatic Mutation Annotators（annovar 注释文件条目详细解释）

    CONTENTS *_annoTable.txt (ANNOVAR) *_annoTable.txt (SnpEff) *_genelist.txt (ANNOVAR & SnpEff) db ...

  2. somatic mutation体细胞变异检测文献分享--转载

    转载 :http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102xuro.html Kalatskaya I, Trinh Q M, Spears M, et al. I ...

  3. HTML5新特性之Mutation Observer

    Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动时,Mutation Observer会得到通知. 要概念上,它很接近事件.可以理解为,当DOM发生变 ...

  4. 使用HTML5新特性Mutation Observer实现编辑器的撤销和撤销回退操作

     MutationObserver介绍 MutationObserver给开发者们提供了一种能在某个范围内的DOM树发生变化时作出适当反应的能力.该API设计用来替换掉在DOM3事件规范中引入的Mut ...

  5. Leetcode: Minimum Genetic Mutation

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  6. 转: HTML5新特性之Mutation Observer

    转: HTML5新特性之Mutation Observer Mutation Observer是什么 Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动 ...

  7. [LeetCode] Minimum Genetic Mutation 最小基因变化

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  8. ASP.NET Core中使用GraphQL - 第七章 Mutation

    ASP.NET Core中使用GraphQL - 目录 ASP.NET Core中使用GraphQL - 第一章 Hello World ASP.NET Core中使用GraphQL - 第二章 中间 ...

  9. [Swift]LeetCode433. 最小基因变化 | Minimum Genetic Mutation

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

随机推荐

  1. 解决XML警告"No grammar constraints (DTD or XML Schema) referenced in the document"

    解决办法: 顶部有这两行信息即可解决警告: <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <!DOCTYPE ...

  2. 【Pytyon模块】logging模块-日志处理

    一.日志相关概念 1.日志的作用 通过log的分析,可以方便用户了解系统或软件.应用的运行情况:如果你的应用log足够丰富,也可以分析以往用户的操作行为.类型喜好.地域分布或其他更多信息:如果一个应用 ...

  3. B - Given Length and Sum of Digits... CodeForces - 489C （贪心）

    You have a positive integer m and a non-negative integer s. Your task is to find the smallest and th ...

  4. Hadoop的常用指令

    -help:查看帮助 hadoop fs -help rm -rm [-f] [-r|-R] [-skipTrash] <src> ... : Delete all files that ...

  5. 计算机网络(6): http cookie

    Cookie作用: 1)帮助管理用户会话信息(用户需要记录的信息:登陆状态等) 2)跟踪浏览器的行为 3)用户自定义设置 实现方式: 当用户浏览带有Cookie的网站时,网站自动为其生成一个唯一的标志 ...

  6. spring学习之第一个spring程序

    spring的入门程序 1.在Eclipse中创建Java项目,并将spring的四个核心包和依赖包添加到src里,发布到类路劲下,项目如图所示: 2.UserDao程序如下: package com ...

  7. c语言中命令行参数argc,argv[]详解

    main(int argc,char *argv[ ]) 1.argc为整数 2.argv为指针的指针(可理解为:char **argv or: char *argv[] or: char argv[ ...

  8. java和数据库中所有的锁都在这了

    1.java中的锁 1.1 锁的种类 公平锁/非公平锁 可重入锁/不可重入 独享锁/共享锁 读写锁 分段锁 偏向锁/轻量级锁/重量级锁 自旋锁 1.2 锁详细介绍 1.2.1 公平锁,非公平锁 公平锁 ...

  9. tensorflow C++接口调用目标检测pb模型代码

    #include <iostream> #include "tensorflow/cc/ops/const_op.h" #include "tensorflo ...

  10. 架构之道(3) - 令後端的吐血和喊FUCK的次数锐减

    「那个产品经理不会技术,整天在需求,真操他妈的.」 这是很多产品经理遇到的一句话,如果你把顾客阶段完成了,回到自己的团队,遇到个技术大牛这麽说,那就表示,自己作为产品经理的功力还不够. 等我慢现解释, ...