Windows下利用虚拟机运行FSL 安装和配置
FSL是牛津大学FMRIB开发的用于分析功能磁共振影像的科研软件包。
运行要求:windows7或vista操作系统,10G硬盘空间,4G内存。
从FSL官网上下载Centos6的虚拟盘(FSLVm6_64bit.zip)解压。用VMPlayer打开其中的FSLVm6_64.vmx,运行虚拟机。
下载适用于CentOS6的FSL文件包(fsl-5.0.4-centos6_64.tar.gz),将其解压至虚拟机的/usr/local目录下(推荐)。修改~/.bashrc文件,添加以下内容并保存:
# User specific aliases and functions
FSLDIR=/usr/local/fsl
source ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH
打开terminal,输入fsl回车,就运行了。
几点备注:
Centos6虚拟盘和FSL文件包下载地址:http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fsldownloadmain.html
解压tar.gz文件命令:tar zxvf FileName.tar.gz
修改~/.bashrc文件命令:vim ~/.bashrc
在运行虚拟机后,可以运行桌面上的fslinstaller.py进行FSL的自动下载和安装,但速度太慢了。
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