纠错工具之 - Proovread】的更多相关文章

BioInf-Wuerzburg/proovread - Github 主要是来解读 proovread 发表的文章,搞清楚它内在的原理. Proovread,这个工具绝对没有你想的那么简单,它引入了很多局部模型,而且在总体设计上也是很有眼光的. 原文:proovread: large-scale high-accuracy PacBio correction through iterative short read consensus 摘要 动机:目前边合成边测序的二代技术占主导,虽然准,但太…
三代纠错的重要性不言而喻,三代的核心优势就是长,唯一的缺点就是错误率高,但好就好在错误是随机分布的,可以通过算法解决,这也就是为什么现在有这么多针对三代开发的纠错工具. 纠错和组装是分不开的,纠错就是为了组装,单纯的为了纠错而纠错是没有意义的. 目前的算法大致可以分为三种:1.三代数据自纠:2.二代对三代纠:3.二代三代混合纠错. 目前已有的三代纠错程序: PacBioToCA 自纠(falcon也是用MHAP,SMRT的HGAP使用的是另一种速度慢的自纠算法,自纠的核心是多重序列比对) CCS…
教材学习内容总结 1.java中的错误都会被包装为对象这是书上的一句原话,我的理解就是,在java这个大环境中,就像是流水线工厂一样,代码的编译就是进行流水线作业,代码输进来,开始的时候就是打包封装,但是这个时候你是不知道产品的好坏,所以要进行筛选就是编译,好的产品就通过了筛选,可以离开工厂,就是编译成功将编译结果展示给我们看:那个偶有坏的产品,就是错误,其实他们也已经被包装为对象了,但是因为是次品所以不能出工厂,也就是不能给我们展示, 就像工厂中的红色指示灯一样,我们看到的只是红色的错误原因.…
xnalara模型修改---增添(技术交流贴2) 其实很早就想做这个教程(流程)但有一种叫拖延症的东东捆了我半年~~于是这个帖子诞生与此,,希望对某些骚年有用... 送TA礼物     回复 举报|1楼2013-09-21 23:07 热门推荐    [熊孩子晒原创]白模涂鸦--现代机械·SUPER XIONG 随后会放制作过程 2074 李炜"托奶天王",谭杰希整容无人认识,10年快男... 解读热点,就来百闻不如... 23 <本吧第一贴>进来就是我的人了! 幼儿园老师…
在不同的Linux发行版中,会有不同的GUI程序可以显示各种系统信息,比如SUSE Linux发行版中,就有非常棒的图形化的配置和管理工具YaST,KDE桌面环境里的KDE System Guard也很不错. AD: 在不同的Linux发行版中,会有不同的GUI程序可以显示各种系统信息,比如SUSE Linux发行版中,就有非常棒的图形化的配置和管理工具YaST,KDE桌面环境里的KDE System Guard也很不错. 然而,对于一名Linux系统管理员来说,除非迫不得已,否则不会在Linu…
WebHost Manager 11使用手册(WHM使用手册) 本手册翻译自cpanel官方文档. 本翻译中文版本版权归美国主机侦探所有,未经允许,禁止复制. Overview(概述) 本用户手册主要目的是让新用户熟悉WebHost Manager Interface(WebHost Manager界面):并给老用户补充点额外的知识.本手册将着重介绍如何使用WebHost Manager来安装,配置和管理你的服务器以满足虚拟主机的需要. 如果你是刚刚接触服务器管理和虚拟主机,那么本手册中出现的很…
本原创文章属于<Linux大棚>博客. 博客地址为http://roclinux.cn. 文章作者为roc. == 原文:16 Linux Server Monitoring Commands You Really Need To Know 为了让大家能更直观的学习这些命令,添加了更多的解释内容.实例和外部链接. == 在使用Linux服务器的过程中,有16个命令可以帮助你全面了解你的服务器的运行状况.如果你能够很熟练地掌握这些命令,就离成为一名专业的Linux系统管理员不远啦! 在不同的Li…
在不同的Linux发行版中,会有不同的GUI程序可以显示各种系统信息,比如SUSE linux发行版中,就有非常棒的图形化的配置和管理工具YaST,KDE桌面环境里的KDE System Guard也很不错. 然而,对于一名Linux系统管理员来说,除非迫不得已,否则不会在Linux服务器上去运行这样的GUI程序,主要还是因为GUI会占用很多的系统资源.所以呢,使用GUI工具一般都是做简单的排查,如果你真的想知道系统里真正发生了什么,那么请关掉你的GUI,快点进入Linux命令行的世界吧. 如果…
工欲善利其事必先利其器,sublime作为一款轻量.便捷的编译工具,集成了很多插件,功能强大,深受大家的喜爱.掌握好sublime的具体用法,必会为你的工作带来极大的便利!好了,闲话不多说了,下面开始具体的教程吧: 一.安装sublime(这好像是多余的,地球人都知道...0.0) 本教程是基于sublimeText3所编写的,若想了解sublime2,本文可作参考,具体请自行百度. sublime3 下载地址:https://download.sublimetext.com/Sublime%2…
这一章我们不聊模型来聊聊数据,解决实际问题时90%的时间其实都是在和数据作斗争,于是无标注,弱标注,少标注,半标注对应的各类解决方案可谓是百花齐放.在第二章我们也尝试通过多目标对抗学习的方式引入额外的NER样本,或者分词边界来提高people daily小样本数据集的效果. 以下我会结合一些业界的案例和新鲜出炉的NLP数据增强综述,聊聊都有哪些数据增强方案,其中哪些适用于NER以及效果提升.代码详见 people_daily_augment NLP数据增强综述 Paper:Data Augmen…