BCR-ABL融合基因及检测】的更多相关文章

费城染色体 费城染色体(Philadelphia chromosome, Ph (or Ph') chromosome),或称费城染色体易位(Philadelphia translocation),是一种与慢性粒细胞性白血病(chronic myelogenous leukemia, CML)相关的特殊染色体易位现象.其中细胞的9号染色体长臂与22号染色体长臂进行相互易位,具体定义为t(9;22)(q34;q11).这一染色体易位现象与慢性粒细胞性白血病有高度的灵敏度,有95%的慢性粒细胞性白血…
定义:融合基因是指两个或者多个基因联合起来,一起转录形成一个转录本: 检测的意义:融合基因可以作为某些疾病的特异分子标记,比如 bcr/abl融合基因存在于95%以上的慢性粒细胞白血病患者中: AML1/ETO融合基因主要见于急性粒细胞白血病部分分化型患者中: CBFβ/MYH11融合基因是M4Eo型白血病的分子标志: PML/RARα融合基因是急性早幼粒细胞白血病(APL)的分子标志: 检测方法: 只有少数的融合基因是因为染色体易位等原因,在DNA水平上联合在一起,而大多数的融合基因在DNA水…
tophat-fusion 是一款利用RNA_seq 数据鉴定融合基因的工具,官网链接如下: http://ccb.jhu.edu/software/tophat/fusion_index.shtml 安装: tophat-fusion 是集成在tophat软件中的,具体的安装参考tophat的安装就好了 使用方法: 对于tophat-fusion 而言,要求固定的目录结构,比如我在result 文件夹下进行tophat-fusion的分析 那么我需要在该目录下准备几个文件: 1)物种对应的re…
RNA-seq 测序可以用于融合基因的发现,在过去的十几年里,RNA-seq 测序数据不断增加,发现的融合基因的数据也不断增加: FusionCancer 是一个人类癌症相关的融合基因的数据库,利用NCBI SRA数据库中的RNA-seq 数据,采用tophat-fusion, soap-fusion, fusionmap, chimerascan 4款预测融合基因的软件进行预测: 网址如下: http://donglab.ecnu.edu.cn/databases/FusionCancer/…
导读: ALK融合是非小细胞肺癌的关键驱动机制之一,在NSCLC患者中发生的频率约为3-7%.针对ALK融合的抑制剂克唑替尼.色瑞替尼以及Alectinib在治疗ALK融合阳性的NSCLC患者中都取得了巨大成功,而ALK融合检测是靶向ALK治疗的前提. 1.传统ALK检测技术的特点及不足之处 目前对ALK融合的检出方法包括传统的荧光原位杂交(FISH),基于PCR扩增技术(RACE-PCR或RT-PCR联合测序技术.qRT-PCR等)和免疫组织化学法(IHC),这些传统方法各有其优缺点(表1).…
一,布局 R绘图所占的区域,被分成两大部分,一是外围边距,一是绘图区域. 外围边距可使用par()函数中的oma来进行设置.比如oma=c(4,3,2,1),就是指外围边距分别为下边距:4行,左边距3行,上边距2行,右边距1行.很明显这个设置顺序是从x轴开始顺时针方向.这里的行是指可以显示1行普通字体.所以当我们使用mtext中的line参数时,设置的大小就应该是[0,行数)的开区间.当我们使用mtext在外围边距上书写内容时,设置mtext中的outer=TRUE即可. 绘图区域可使用par(…
ALK FISH探针是FDA批准的用于检测肺癌患者中ALK重排的方法,这些患者可能受益于ALK激酶抑制剂.FISH测定在技术上可能具有挑战性并且难以解释.已经有研究者提出以ALK免疫组织化学和下一代测序作为替代方法.在本研究中,我们比较了各种ALK-FISH模式与下一代测序(NGS)针对基因融合的检测效果,以及ALK免疫组织化学(IHC)和肿瘤对克唑替尼的反应.在2116例肺腺癌样本中,72例(4%)是ALK-FISH阳性,其中28个ALK-FISH阳性病例用于研究,包括15个分裂信号(54%)…
自从操作系统升级到64位以后,就要不断的需要面对32位.64位的问题.相信有很多人并不是很清楚32位程序与64位程序的区别,以及Program Files (x86),Program Files的区别.同时,对于程序的dll文件应该放到System32文件夹,还是SysWow64,大部分人做的决定是,32位程序放到System32,64位程序放到SysWow64.是不是这样呢,那么今天就由我身边发生的一个案例来详细的说明一下. dll文件不匹配导致数据库无法启动 前段时间,数据库做了一些功能上的…
前言: 最近公司C轮融资成功了,移动团队准备扩大一下,需要招聘Android开发工程师,陆陆续续面试了几位Android应聘者,面试过程中聊到性能优化中如何避免内存泄漏问题时,很少有人全面的回答上来.所以决定抽空学习总结一下这方面的知识,以及分享一下我们是如何检测内存泄漏的.我们公司使用开源框架LeakCanary来检测内存泄漏. 什么是内存泄漏? 有些对象只有有限的生命周期.当它们的任务完成之后,它们将被垃圾回收.如果在对象的生命周期本该结束的时候,这个对象还被一系列的引用,这就会导致内存泄漏…
C++大量的手动分配.回收内存是存在风险的,也许一个函数中一小块内存泄漏被重复放大之后,最后掏空内存. 这里介绍一种在debug模式下测试内存泄漏的方法. 首先在文件的开头以确定的顺序写下这段代码: #define _CRTDBG_MAP_ALLOC #include <crtdbg.h> #include <stdlib.h> 第1行定义了宏,实现一些内存分配函数向debug模式的映射. 打开<crtdbg.h>我们可以找到这么一段代码: 可以看到,定义了_DEBUG…
本文在腾讯技术推文上 修改 发布. http://wetest.qq.com/lab/view/63.html?from=ads_test2_qqtips&sessionUserType=BFT.PARAMS.195040.TASKID&ADUIN=913337456&ADSESSION=1468996652&ADTAG=CLIENT.QQ.5431_.0&ADPUBNO=26510 自从Google在2013年发布了Android Studio后,Android…
一.整体介绍 前面已经介绍了网络访问的NSURLSession.NSURLConnection,还有网页加载有关的webview,基本满足通常的网络相关的开发. 其实在网络开发中还有比较常用的就是网络状态的检测.苹果对需要联网的应用要求很高,就是必须要进行联网检查.另外,当网络发生异常时能够及时提示用户网络已断开,而不是程序问题造成卡顿:当用户观看视频或下载大文件时,提示用户当前的网络状态为移动流量或wifi下,是否继续使用,以避免在用户不知情下产生过多流量资费等等. 网络状态的检测有多种方法,…
简介     在一个理想的世界中,不会存在任何数据库的损坏,就像我们不会将一些严重意外情况列入我们生活中的日常一样,而一旦这类事情发生,一定会对我们的生活造成非常显著的影响,在SQL Server中也同样如此,或许几年内您没有遇见过数据库中出现这类情况,而一旦遇见这类情况,往往伴随着数据的丢失,宕机,严重甚至您本身的职业生涯也会受到影响.因此对于这类情况,我们需要了解数据库损坏方面的知识,以便我们能够事前准备,事后能够处理.本篇文章会对数据库损坏的原因.现象.事前和事后的一些处理方法以及简单的修…
[引]:侵入检测的作用就是监测侵入事件,保护重要的数据不被非法窃取. 你的数据是保存在RAM里的;但是一掉电RAM里的数据就没了;有一块地方,后备电池相关的一块RAM的数据却放不掉(除非电池没电了);还有一个方法可以自动清掉这一部分RAM(寄存器组);就是入侵事件; 有什么用?你的系统上电后你输入一个密码;这个密码就保存在后备寄存器组中;只要电池有电,这个密码一直保存完好;你的系统每次开机后检测这个密码是否正确; 如果不正确;2种可能:A)电池没电了;B)有人把IC拆下来过;…
我们通过System.Environment.OSVersion.Version获得操作系统的版本号,然后再根据版本号进行判断操作系统是什么版本 Version 类的属性 Operating system Version number dwMajorVersion dwMinorVersion Windows 10 10.0 10 0 Windows 8.1 6.3 6 3 Windows 8 6.2 6 2 Windows 7 6.1 6 1 Windows Server 2008 6.0 6…
软件安全课程的一次实验,整理之后发出来共享. 什么是KD树 要说KD树,我们得先说一下什么是KNN算法. KNN是k-NearestNeighbor的简称,原理很简单:当你有一堆已经标注好的数据时,你知道哪些是正类,哪些是负类.当新拿到一个没有标注的数据时,你想知道它是哪一类的.只要找到它的邻居(离它距离短)的点是什么类别的,所谓近朱者赤近墨者黑,KNN就是采用了类似的方法. 如上图,当有新的点不知道是哪一类时,只要看看离它最近的几个点是什么类别,我们就判断它是什么类别. 举个例子:我们将k取3…
1. instanceof操作符(ECMAScript3) 对于一个网页,或者是一个全局作用域而言,使用instanceof操作符来检测数组就可以得到满意的结果. 语法:if(value instanceof Array){ //对数组执行某些操作 } eg: var colors=["red","pink"]; var n=18; var isArray=colors instanceof Array;//返回true var isArray1=n instanc…
类型检测: 类和对象: Call,Apply,Bind…
利用的私有库检测正在安装的app 分为两步:第一,通过placeholderApplications获得所有的正在安装的app的信息 第二,遍历正在安装的app的信息,根据名称获得你想检测的app是否正在安装 一旦使用了私有的接口你的app便不能再上架了 利用私有的库MobileCoreServices检测正在安装的应用 NSMutableArray *app = [NSMutableArray array]; //获得私有的类 Class LSApplicationWorkspace_clas…
前言 译文链接:http://websystique.com/spring/spring-auto-detection-autowire-component-scanning-example-with-annotations/ 在本篇文章我们会看到Spring是如何通过component-scanning配置,在没有使用@Bean和@Configuration声明bean,也没有使用XML配置声明bean的情况下,自动检测到程序中配置的bean,并且自动装配这些bean. 对于component…
在我们使用scvmm2012的时候,经常会看到群集状态变成了这样 点开看属性后,我们发现是这样 . 发现了吗?Over-committed,如果翻译过来就是资源过载,或者说资源过量使用了,那么这个状态是怎么出现的呢? 出现这个状态以后会出现什么问题?怎么解决? 今天我们就谈一谈在SCVMM中over-committed的算法,知道SCVMM是如何确认一个群集是否过载后,就知道如何避免它,带来种种问题也就能解决了 part 1. 算法概述 SCVMM 2012 群集的过载检查主要是用来确认整个群集…
需求分析 "null exception"很见的一种异常,但在某些情况下却会引起严重的bug! 本文目的就是对代码进行null 的检查,避免不应该出现的Error. 本文借助reshaper,全局检测项目中所有可能出现的null exception 关于resharper的知识:http://zzk.cnblogs.com/s?w=blog%3Azhaoqingqing%20resharper 环境 Windows 7 X64 Visual Studio 2015社区版 Resharp…
文/笨笨的糯糯(简书作者)原文链接:http://www.jianshu.com/p/0837331875f0著作权归作者所有,转载请联系作者获得授权,并标注“简书作者”. 作为一名iOS开发攻城狮,在苹果没有出ARC(自动内存管理机制)时,我们几乎有一半的开发时间都耗费在这么管理内存上.后来苹果很人性的出了ARC,虽然在很大程度上,帮助我们开发者节省了精力和时间.但是我们在开发过程中,由于种种原因,还是会出现内存泄露的问题.内存泄露是一个很严重的问题.下面就简单介绍下怎么使用Xcode7自带的…
  ×   检测到在集成的托管管道模式下不适用的ASP.NET设置的解决方法(非简单设置为[经典]模式). 我们将ASP.NET程序从IIS6移植到IIS7,可能运行提示以下错误: HTTP 错误 500.23 - Internal Server Error 检测到在集成的托管管道模式下不适用的 ASP.NET 设置. 为什么会出现以上错误? 在IIS7的应用程序池有两种模式,一种是“集成模式”,一种是“经典模式”. 经典模式 则是我们以前习惯的IIS 6 的方式. 如果使用集成模式,那么对自定…
上一篇提到,无论在单目.双目还是RGBD中,追踪得到的位姿都是有误差的.随着路径的不断延伸,前面帧的误差会一直传递到后面去,导致最后一帧的位姿在世界坐标系里的误差有可能非常大.除了利用优化方法在局部和全局调整位姿,也可以利用回环检测(loop closure)来优化位姿. 这件事情就好比一个人走在陌生的城市里,一开始还能分清东南西北,但随着在小街小巷转来转去,已经不知道自己在什么地方了.通过认真辨识周边环境,他可以建立起局部的地图信息(局部优化).再回忆以前走过的路径,他可以纠正一些以前的地图信…
引言 web应用中有很多地方会用到打点,用来检测用户行为,今天就做了个打点相关的需求,为了统计一个广告给用户的展示次数,每次用户请求完成并且渲染完成之后就算一次成功的展示,其实有时候这个广告还没有在用户的可视范围之内,用户需要滑动滚动条才能看见,但已经算了一次成功展示了,显然这里不太合理,这里做了个检测元素是否在可视范围之内的小插件. 验证可行性 为了实现这个,我首先想到的就是碰撞检测,把浏览的页面的宽度作为水平坐标,页面的高度作为垂直的坐标,页面中的一个元素看做一个矩形物体a,固定在坐标系中,…
由于JavaScript是门松散类型语言,定义变量时没有类型标识信息,并且在运行期可以动态更改其类型,所以一个变量的类型在运行期是不可预测的,因此,数据类型检测在开发当中就成为一个必须要了解和掌握的知识点. 对于数据类型检测,实习新手会用typeof,老司机会用Object.prototype.toString.call();,在实际开发当中,后者可以说是目前比较好的办法了,可以准确地检测几种常见的内置类型,要比typeof靠谱得多.那么究竟类型检测都有哪些方法,各自都有哪些优劣呢,博主就借此机…
[1,2] instanceof Array //true Object.prototype.toString.apply([]); === "[object Array]"; Object.prototype.toString.apply(function(){}); === "[object Function]"; Object.prototype.toString.apply(null); === "[object Null]" Objec…
问题: 在使用 vscode 以及 eslint 来检测 基于 webpack 的 vue-cli 的项目中,eslint 无法检测到 .vue 文件中的less 部分内容. 解答: 1.通过 下载 一个 vscode 插件 vetur 2.然后在 user setting 里面添加一 段 代码 3. "files.associations": { "*.vue": "vue" }…
最近又遇到了一个崩溃,栈回溯非常怪异. /lib/i386-linux-gnu/libc.so.(gsignal+0x4f) [0xb2b751df] /lib/i386-linux-gnu/libc.so.(abort+0x175) [0xb2b78825] /lib/i386-linux-gnu/libc.so.(+0x6b39a) [0xb2bb239a] /lib/i386-linux-gnu/libc.so.(__fortify_fail+0x45) [0xb2c4b0e5] /lib…