假设想要计算ATP1A4基因上的外显子碱基覆盖度 首先查询这个基因所有exon的起始和终止位置,查询链接:http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Exons?db=core;g=ENSG00000132681;r=1:160121360-160156767;t=ENST00000368081 如下图所示,可以看到该基因有6个转录本,假定选择第二个转录本ENST00000470705.1,点击进去,显示该转录本有5个外显子 具体外显子的详…

/** * 计算地球上任意两点(经纬度)距离 * * @param long1 * 第一点经度 * @param lat1 * 第一点纬度 * @param long2 * 第二点经度 * @param lat2 * 第二点纬度 * @return 返回距离 单位:米 */ public static double Distance(double long1, double lat1, double long2, double lat2) { double a, b, R; R = 637813…

/** * 计算地球上任意两点(经纬度)距离 * * @param long1 * 第一点经度 * @param lat1 * 第一点纬度 * @param long2 * 第二点经度 * @param lat2 * 第二点纬度 * @return 返回距离 单位:米 */ public static double Distance(double long1, double lat1, double long2, double lat2) { double a, b, R; R = 637813…

摘要:如果不设置任何过滤标准的话,SOAPsnp会call出更多的SNVs:AtlasSNP2算法比较严格,因此call出来的SNVs数量是最少的,GATK 和 SAMtools call出来的数量位于SOAPsnp 和 Atlas-SNP2之间:四种calling算法的整体一致性是很低的,尤其在non-dbSNPs数据库中:GATK 和 Atlas-SNP2有较高的阳性call率和灵敏性,GATK call出来的SNVs数量比较多. 1.dbSNP数据库和non-dbSNPs在用四种不同软件c…

安装和配置计算节点这个章节描述如何在计算节点上安装和配置计算服务. 计算服务支持几种不同的 hypervisors.为了简单起见,这个配置在计算节点上使用 :KVM <kernel-based VM (KVM)>`扩展的:QEMU <Quick EMUlator (QEMU)>`作为hypervisor,支持虚拟机的硬件加速.在旧的硬件上,这个配置使用通用的QEMU作为hypervisor.你可以根据这些说明进行细微的调整,使用额外的计算节点来横向扩展你的环境. 节点配置信息说明:…

go --计算地球上两个坐标点(经度,纬度)之间距离sql函数 --作者:lordbaby --整理:www.aspbc.com CREATE FUNCTION [dbo].[fnGetDistance](@LatBegin REAL, @LngBegin REAL, @LatEnd REAL, @LngEnd REAL) RETURNS FLOAT AS BEGIN --距离(千米) DECLARE @Distance REAL DECLARE @EARTH_RADIUS REAL SET @…

计算地图上两点间的距离,使用的是谷歌地图 <?php class GeoHelper { /** * @param int $lat1 * @param int $lon1 * @param int $lat2 * @param int $lon2 * @param string $unit * @return */ public static function distance($lat1, $lon1, $lat2, $lon2, $unit = "K") { $theta…

/** 日期:2015-10-15 版本: 1.0.0 -------------------------------------------------------------- 功能说明 -------------------------------------------------------------- 根据IOS视图中圆组件的中心点(x,y).半径(r).圆周上某一点与圆心的角度这3个 条件来计算出该圆周某一点在IOS中的坐标(x2,y2). 注意: (1)IOS坐标体系与数学坐标…

在windwo server2008服务器上配置ftp服务器.及配置phpstrom工具.实现项目同步. 在windwo server2008服务器上配置ftp服务器 参考该篇文章:http://blog.csdn.net/u010022051/article/details/52046345 在phpstrom上配置ftp…

前言:前面一开始写了一篇通过命令来操作本地项目上传远程仓库的文章,后来发现此方式没有那么灵活.故跟开发同事请教了下,知道了通过工具来操作更方便.所以写了这篇文章来分享&记录. 前提条件:本地安装了Git 以及在码云上创建了远程仓库. 所需工具下载地址:https://pan.baidu.com/s/1xcwCqROX1Soe51l9Ttdr3w 链接失效的话,可以联系我获取. 一.安装TortoiseGit(小乌龟) 下载好安装包后,打开有两个安装文件. 一个是小乌龟安装,一个汉化包. 安装过程…