下列所用到的数据均为千人基因组数据库 1.通过vcftools计算FST 命令行如下: ./vcftools --vcf input_data.vcf --weir-fst-pop population_1.txt --weir-fst-pop population_2.txt --out pop1_vs_pop2 其中,input_data.vcf就是输入的vcf格式 population_1.txt的格式如下: population_2.txt的格式同population_1.txt,只有一…

:或者1.简单介绍 固定指数(FST)是一种由遗传结构决定的种群分化指标.它通常是由遗传多态性数据,如单核苷酸多态性(SNP)或微卫星估计.作为莱特f统计的一个特例,它是种群遗传学中最常用的统计方法之一. 2.Definition 两个最常用的FST定义是基于群体间等位基因频率的方差,以及由血统决定身份的概率. 或者 p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total populati…

群体遗传学--Fst指数,即群体间分化指数,用于群体间分化分析. 群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数.Fst指数,由F统计量演变而来.F统计量(FIS,FIT,FST)主要有三种.Fst是针对一对等位基因,如果基因座上存在复等位基因,则需要用Gst衡量,基因差异分化系数(gene differentiation coefficient,Gst).   从配子间亲缘关系角度分析,FST和FIT分别相当于地方群体和整个群体中携带的一对等位基因是同源的概率,而FST是…

Design based on biology 通过比较基因组学的方法,将脊椎动物基因组的数据,解决生物学各方面问题.新的调控注释(在脊椎动物的进化过程中的出现的)可以丰富物种树(比如不同功能蛋白质进化速度上的差异(因为编码蛋白质基因和早期进化基因的发现)). Sequencing 需要以下两种策略叠加: 1.Pooled genome sequence strategies :测同一物种的不同个体,不同个体叠加. 2.representative genome assembly approac…

[转]Fst指数 转载自 http://blog.csdn.net/zhu_si_tao/article/details/71513099 与 http://blog.sina.com.cn/s/blog_4ab0b3390102viol.html 群体遗传学--Fst指数,即群体间分化指数,用于群体间分化分析. 群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数.Fst指数,由F统计量演变而来.F统计量(FIS,FIT,FST)主要有三种.Fst是针对一对等位基因,如果基因座…

什么是会话固定攻击? 会话固定攻击(session fixation attack)是利用应用系统在服务器的会话ID固定不变机制,借助他人用相同的会话ID获取认证和授权,然后利用该会话ID劫持他人的会话以成功冒充他人,造成会话固定攻击. 看下面Session Fixation攻击的一个简单例子: 整个攻击流程是: 1.攻击者Attacker能正常访问该应用网站: 2.应用网站服务器返回一个会话ID给他: 3.攻击者Attacker用该会话ID构造一个该网站链接发给受害者Victim: 4-5.受…

ICP技术是在MySQL5.6中引入的一种索引优化技术.它能减少在使用 二级索引 过滤where条件时的回表次数 和 减少MySQL server层和引擎层的交互次数.在索引组织表中,使用二级索引进行回表的代价相比堆表中是要高一些的.相关文档地址:http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/index-condition-pushdown-optimization.html Index Condition Pushdown optimization is use…

<li v-for="(el,index) in event" v-bind:class="{ 'm-swipe-active': !index}"></li> index来源于v-for,el表示遍历的数组的元素,index表示索引.index从0开始,所以第一项!0就是true,这样就可以添加m-swipe-active这个类.…

需要开启Apache2的rewrite模块 1.打开/etc/apache2/apache2.conf 将文件中的AllowOverride None改为AllowOverride All 2.修改mods-enable配置,添加一个软件链接 cd /etc/apache2/mods-enable ln -s ../mods-avaiable/rewrite.load rewrite.load 3.在项目根目录下添加.htaccess文件,修改rewrite规则 <IfModule mod_re…

前言 本节我们再来穿插讲讲索引知识,后续再讲数据类型中的日期类型,简短的内容,深入的理解,Always to review the basics. 强制索引查询条件 前面我们也讲了一点强制索引查询的知识,本节我们再来完整的讲述下 (1)SQL Server使用默认索引 USE TSQL2012 GO SELECT * FROM Sales.Orders 上述就不用我再啰嗦了,使用默认主键创建的聚集索引来执行查询执行计划. (2)SQL Server使用强制索引 USE TSQL2012 GO S…