关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲 RNA-Seq adapter barcode cutadapt 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已知的核酸链,用于链接序列未知的目标测序片段. 2.barcode,也称为index,是一段很短的寡居核酸链,用于在多个样品混合测序时,标记不同的样品. 3.insert是用于测序的目标片段,因为是包括在两个adapter之间,所以被称为“插入”片段. 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已…

1.adapter是一段短的序列已知的核酸链,用于链接序列未知的目标测序片段. 2.barcode,也称为index,是一段很短的寡居核酸链,用于在多个样品混合测序时,标记不同的样品. 3.insert是用于测序的目标片段,因为是包括在两个adapter之间,所以被称为“插入”片段. 一个常见测序片段类似与adapter--barcode--insert--adapter.测序开始时前几个碱基无法测得,第一个adapter在数据输出时被去除:由于测序仪读长限制,第二个adapter通常无法测得.…

两种RNA seq的基因表达量计算方法: 1. RPKM:http://www.plob.org/2011/10/24/294.html 2. RSEM:这个是TCGAdata中使用的.RSEM据说比RPKM更有优势.anyway,原来还以为TCGA 的data需要重新换算成RPKM,现在不需要了~:)…

sql 游标例子 根据一表的数据去筛选另一表的数据 DECLARE @MID nvarchar(20)DECLARE @UTime datetime DECLARE @TBL_Temp table( MID nvarchar(20), Uptime datetime, Chat nvarchar(20)) --Get UserDECLARE My_Cursor CURSOR --定义游标FOR ( SELECT distinct MID, Uptime from TLinkTest) OPEN…

摘要: 当浩瀚的数字化信息能够联网在线,在万物互联网的新世界中,所有东西都可能有感知.变智能,想象一下电表.冰箱.心电图监测仪等设备的信息都能数字化并联网,从城市管理到个人生活,都会迎来翻天覆地的变化.现在让我们看看阿里是如何用计算和数据去改变整个世界的. 用计算和数据去改变整个世界 云栖大会首日精彩爆棚,第二天继续开启信息量超大的烧脑模式,阿里巴巴集团CTO张建锋在主论坛的开场发言中,对马云提出“五个新”当中的新零售.新制造和新技术进行了深度解读,认为计算能力的提升将加速世界的智能化进程,阿里…

RNA -seq RNA-seq目的.用处::可以帮助我们了解,各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异. 比如:正常组织和肿瘤组织的之间的差异:检测药物治疗前后,基因表达的差异:检测发育过程中,不同的发育阶段,不同的组织之间的基因表达差异 等 在所有检测的差异类型中,最常用的一种检测就是:检测所有mRNA的表达量的差异. 还可以检测 RNA 的结构上的差异.例如:mRNA的剪接方式的差异,即“可变剪接”:还可以检测“融合基因”,同时还可以检测基因单点突变导致的SNP. 测序方法.步骤:人的细胞…

我们在处理数据库接口的过程中,如果数据中出现null,我们是没法处理的.我在使用NSUserDaults保存后,出现崩溃. null产生原因 null是后台在处理数据的时候,如果没有设置value值,数据库默认填充的值. 解决办法 数据库做处理 本地做删除null处理 本地做删除null处理 如果是数据库做处理的话,可以在数据库中,将未设置的value填充为" "即可. 如果是本地处理的话,我个人是通过添加类别来达到效果的. 代码如下: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11…

上篇讲到如何用jquery ajax提交数据至后台,后台接收并返回给ajax.https://www.cnblogs.com/tiezhuxiong/p/11943328.html 今天我们把数据传到数据库去做一下查询.话不多说,上教程. 首先,我们先建立数据库: CREATE TABLE `user` ( `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT, `username` varchar(255) DEFAULT NULL, `password` varchar(…

一,数组去重复 function unique(arr) { // 遍历arr,把元素分别放入tmp数组(不存在才放) var tmp = new Array(); for (var i in arr) { //该元素在tmp内部不存在才允许追加 ) { tmp.push(arr[i]); } } return tmp; } 使用例子: var arr = []; var narr = []; ; i < data.length; i++) { Time.push(i); } arr.push(…

使用distinct 和group by都可以实现数据去重. select distinct 字段 group by 一般放在where条件后…