在GWAS分析的结果中,偶尔会遇到到pvalue为0的SNP位点,这时如果直接做曼哈顿或QQ图,会出错,因为log0无意义. 此时,该如何处理? 如果你用的是Plink1.9来做的GWAS,可加一个参数: --output-min-p 1e-99,即将小于1e-99的pvalue都当成1e-99,0也不例外. 如果你用的是其他软件,手动将结果改动.可先用NA填充,再以最小值或更小值替换,如: dat[dat==0] <- NA dat[is.na(dat)] <- min(dat$P,na.r…

目录 材料与方法 结果分析 本文利用99085个高质量SNP 通过STRUCTURE,PCA和neighbour-joining tree的群体结构分析将地方品种分为三个亚群,这些亚群表现出地理上的遗传分化.利用纬度相差10°的两个位置(北京.武汉)收集的表型数据,鉴定了17个与开花时间性状相关的SNP(TAS),包括一个稳定的基因位点Chr12:5914898和以前未检测到的在开花基因E1和E2附近的候选基因.利用与地方种收集地点相关的已公布数据,鉴定出与三个生物气候学变量(温度,日长和降水)…

分析URI中的字符有K种方法(K >= 2),如果查询字符串中的参数比较简单,可以通过子字符串查找的方式来处理:如果查询字符串相对复杂,你可以使用正则表达式来匹配 key1=value1 ,  key2=value2等. 如果你想很轻松地完成查询参数分析,应当考虑使用现成的API,这不,在Windows.Foundation命名空间下面,你会看到一个名字很刺眼的类——WwwFormUrlDecoder.这个很是简单,调用构造函数创建实例时需要提供一个参数,就是URI中的查询字符串,而且必须是以…

在CSDN中发现这篇文章,讲解的比较详细,所以在这里备份一个.原文链接:http://blog.csdn.net/breaksoftware/article/details/8167641 DllMain的相关特性 首先列出<DllMain中不当操作导致死锁问题的分析--进程对DllMain函数的调用规律的研究和分析>中论证的11个特性:  Dll的加载不会导致之前创建的线程调用其DllMain函数. 线程创建后会调用已经加载了的DLL的DllMain,且调用原因是DLL_THREAD_ATT…

博客搬到了fresky.github.io - Dawei XU,请各位看官挪步.最新的一篇是:一个使用C#的TPL Dataflow Library的例子:分析文本文件中词频.…

分类: Jquery/YUI/ExtJs 2010-08-30 11:27 2700人阅读 评论(0) 收藏 举报 functiondate算法语言c 通常遇到的一个问题是日期的“1976-02-03 HH:mm:ss”这种格式 ,我的比较简单的处理方法是这样: function formatDate(d) {  var D=['00','01','02','03','04','05','06','07','08','09']  with (d || new Date) return [   …

从虚拟机指令执行的角度分析JAVA中多态的实现原理 前几天突然被一个"家伙"问了几个问题,其中一个是:JAVA中的多态的实现原理是什么? 我一想,这肯定不是从语法的角度来阐释多态吧,隐隐约约地记得是与Class文件格式中的方法表有关,但是不知道虚拟机在执行的时候,是如何选择正确的方法来执行的了.so,趁着周末,把压箱底的<深入理解Java虚拟机>拿出来,重新看了下第6.7.8章中的内容,梳理一下:从我们用开发工具(Intellij 或者Eclipse)写的 .java 源程…

1.首先,使用# ifconfig查看Linux系统中的网卡名称,有的是eth0,有的是em1,以查看结果为准,下图为em1 2.先试试Linux系统中有没有安装ethtool工具,没有的话,下载ethtool工具,安装到系统.然后使用# ethtool em1,查看网络带宽,如下如图是1000Mb/s. 3.查看分析文件中NET sheet页中total-read和total-write的绝对值之和,如下图:total-read和total-write的绝对值之和约为82000KB/s,网络带…

上一篇中对HashMap中的基本内容做了详细的介绍,解析了其中的get和put方法,想必大家对于HashMap也有了更好的认识,本篇将从了算法的角度,来分析HashMap中的那些函数. HashCode 先来说说HashMap中HashCode的算法,在上一篇里,我们看到了HashMap中的put方法是这样的: public V put(K key, V value) { return putVal(hash(key), key, value, false, true); } 那这个hash函数…

数据库表设计时一对一关系存在的必要性 2017年07月24日 10:01:07 阅读数:694 在表设计过程中,我无意中觉得一对一关系觉得好没道理,直接放到一张表中不就可以了吗?真是说,网上信息什么都有,也可以说与我一样困惑的有好多人.感谢大神在网上的活跃,我知道了一对一关系存在的必要性. 1.首先就是这种关系出现的场景是什么样子,最好可以举个实际中的需求. 这样的场景有很多,比如:就拿最普通的用户信息来说,数据库中有一个表为user,一个表为user_auth.user表主要存放的字段为用户基…