Downloading and installing the SRA Toolkit step1: 下载并安装SRAtoolkit    (Download the Toolkit from the SRA website) If you are using a web browser, the following page contains download links to the most current version of the toolkit for each of the sup…

SRA数据的的处理流程大概如下 一.SRA数据下载. NCBI 上存储的数据现在大都存储为SRA格式. 下载以后就是以SRA为后缀名. 这里可以通过三种方式下载SRA格式的数据. 1.通过http方式,2.通过ftp方式,3.通过Aspera Aspera可以在NCBI网站上下载. 参阅:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47540/ 二.SRA格式转换成FASTQ格式 ./fastq-dump -A SRR058977 ~/project/yanzi/d…

1)介绍 我们用SRAdb library来对SRA数据进行处理. SRAdb 可以更方便更快的接入  metadata associated with submission, 包括study, sample, experiment, and run. SRAdb 包通过 NCBI SRA数据库中的metadata信息 作用. 首先dbConnect ()接入 R system 中的local database systems, 所有的搜索就在本地文件的基础上进行.the queries we…

将得到的xml格式的数据转化成数组 <?php //构造xml $url = "http://api.map.baidu.com/telematics/v3/weather?location=太原&output=xml&ak=6b219a615eb77699a10eb54054959a2e"; // $xmldata = file_get_contents($url); //将请求到的文件内容读入到一个字符串中 $xmlResult = simplexml_loa…

/* 目的:将数据转化成字符串时:用字符串的链接 还是 StringBuilder呢? */ public class Test{ public static void main(String[] args){ int[] arr={1,2,4,5}; System.out.println(arrayToString(arr)); } /* public static String arrayToString(int[] arr){//这种方法(字符串连接)导致内存中会出现多个字符串常量,而需要…

jQuery 把列表数据转成Json再输出为如下 dom树 <div id="menu" class="lv1"> <ul class="menu"> <li><a href="#" class="parent"><span>aaaaaaaaaaa</span></a> <div class="lv2&quo…

最近angularjs post到后台 400一头雾水 没有任何错误. 最后发现好文,感谢作者 SpringMVC中出现" 400 Bad Request "错误(用@ResponseBody处理ajax传过来的json数据转成bean)的解决方法 今天开发过程中,在SpringMVC中的Action中处理前台ajax请求传过来的json数据直接转成对应的实体类时出错:400 Bad Request,后台也不报错,400指的的是请求无效(请求有语法问题或者不能满足请求),调试了好长时间…

Oracle一列的多行数据拼成一行显示字符   oracle 提供了两个函数WMSYS.WM_CONCAT 和 ListAgg函数.    www.2cto.com   先介绍:WMSYS.WM_CONCAT 例:         id  name         1   aa         2   bb         3   cc   要的结果是"aa,bb,cc"   select WMSYS.WM_CONCAT(a.name) from user a 这样的话,查询出的结果:…

1.按Ctrl+F,弹出“替换”的窗口: 2.选择“替换”菜单: 3.“查找目标”内容输入为:\r\n: 4.“替换为”内容为空: 5.“查找模式”选择为正则表达式: 6.设置好之后,点击“全部替换”,即可将多行数据合并成一行.  …

使用gfortran将数据写成Grads格式的代码示例: !-----'Fortran4Grads.f90' program Fortran4Grads implicit none integer,parameter::xn=32 !-----经度(Longitude)网格数 integer,parameter::yn=18 !-----纬度(Latitude)网格数 integer,parameter::zn=7 !-----高度层数 integer,parameter::tn=5 !----…