canu软件文献

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1)背景组装:短的reads通过overlap来组装成contig 局限性:repeat 大于overlap导致ambiguous reconstructions and fragment the assembly 两个策略:increasing the effective read length(增加reads长度), and separating nonexact repeats based on copy-specific variants(通过特定的copy-变异分离repeats)…

JabRef 文献管理软件

JabRef 文献管理软件简明教程大多只有使用LaTeX撰写科技论文的研究人员才能完全领略到JabRef的妙不可言,但随着对Word写作平台上BibTeX4Word插件的开发和便利应用,使用Word撰写文章且用JabRef推送参考文献同样令人十分愉悦.作为新生代的文献的送和管理工具(2005年开发),不仅功能齐全.各种操作也考虑周到,实现科技研究人员在跨操作平台和不同写作环境下终身使用一个“自己的文献库”不再是一个奢望. JabRef主页和下载地址:http://jabref.sourcefo…

文献管理软件zotero的一点使用感受作者：杨林畅

作者是我的本科同学叶家鑫 http://www.renren.com/profile.do?id=240875124 文章写于去年12月,我做了一些排版上的修改,括号内的蓝字为我所加 ---- zotero简介 zotero(zotero.org)是Firefox浏览器下的一款扩展(add-on),虽然它的桌面版已经在开发中了,但短时间内只能通过打开浏览器来使用,好在对于现代人来说,使用电脑的大多数时间都在对着浏览器.(现在zotero standalone版本已经开发到beta版,支持safa…

安装三代组装canu、smartdenovo、wtdbg及矫正软件Racon、Nanopolish的安装

1)三代组装软件 ------------------------------------------------------------------canu-------------------------------------------- wget https://github.com/marbl/canu/releases/download/v1.8/canu-1.8.Linux-amd64.tar.xz tar -Jxf canu-1.8.Linux-amd64.tar.xz ech…

[工具] Citavi – 文献管理软件(笔记记录)

https://www.citavi.com/en/ 如果你有论文写作的需求,特别是对于科研人员.研究生来说,文献管理软件是不可或缺的.目前流行的文献管理软件有老牌的 EndNote,本土化的 NoteExpress 和新兴的 Mendeley.Zotero 等.他们各有特色,也有不同的用户群,满足了大多数人对文献管理的需求.这类软件的最主要功能有两个: 作为文献数据库,保存并管理文献题录信息: 作为样式管理器,根据论文需求,将文献引用样式导入文档编辑器中. 上面各软件都围绕这两个功能做出了不同…

Mendeley文献管理软件使用介绍

<!DOCTYPE html> New Document /* GitHub stylesheet for MarkdownPad (http://markdownpad.com) / / Author: Nicolas Hery - http://nicolashery.com / / Version: b13fe65ca28d2e568c6ed5d7f06581183df8f2ff / / Source: https://github.com/nicolahery/markdownpad-…

为文献管理软件Mendeley设置代理

Mendeley由于某些原因无法在线同步,需要fq,在tools->option->connection中可以设置http代理或者sock5代理, sock5可以使用shadowsocks进行代理,具体方法参见ishadowsocks.com网站,包含windows,linux和mac的软件.使用方法和免费帐号(每6小时更新密码). http代理可以使用类goagent代理,目前goagent已经惨遭封杀,已经不是很好用,目前有一个XX-net可用(https://github.com/XX-…

Zotero引用文献格式(软件学报)

最近在写一篇综述,要处理大量引用文献,选用Zotero作为文献管理工具.在插入参考文献目录时需要遵循格式,奈何网上找不到<软件学报>对应的csl模板文件,所以决定自己动手修改.在此记录下自己的学习所得. Zotero入门关于Zotero的用法建议阅读这篇博客:文献管理软件Zotero基础及进阶示范 CSL基本概念理解 CSL是一种xml文件,专门用来描述论文中的参考文献格式,具体包括引用格式(如是用数字[1]形式引用还是用作者+年的形式)和参考文献目录格式(如作者姓名.期刊名称等显示格式).…

文献管理软件 Zotero 安装、配置与使用

简介 Zotero优缺点使用Zotero作为主力文献管理工具的原因: 软件本身完全免费并且开源,不存在盗版问题注册后本身只包括 300M 空间同步,但支持 WebDAV 同步,例如 Dropbox 和坚果云等官方的反馈论坛比较活跃,有问题可以快速得到反馈从网站和期刊文章等提取保存出版物数据检索拖入 PDF 的出版物数据准确率高可以和 Word,LibreOffice 集成,方便文献进一步的使用管理强大的第三方插件系统每个条目下可以添加任意数量和格式的附件使用一个工具首先要了解其上…

endnote设置文献第二行悬挂缩进办法

参考:http://blog.sina.com.cn/s/blog_62b13cf201014lfr.html 使用[endnote]插入文献后,如果文献稍长些,有第二行,第二行会顶格开始.并且这个第二行的缩进在”word-工具-endnote-format bibliography“的”hanging“里不管你怎么设置,即使设为10cm也不管用. 首先打开[endnote]软件,在”edit-output styles-edit(你所选择的文献格式名称)“对话框中点击”biblio…