洛谷P1140 相似基因 题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,…

传送门 https://www.cnblogs.com/violet-acmer/p/9852294.html 参考资料: [1]:https://www.cnblogs.com/real-l/p/9712029.html [2]:https://www.luogu.org/problemnew/solution/P1140 题解: 方法一:枚举所有可能(记忆型DP) 相关变量解释: m,n...................................................分别…

题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140 题意: 给定两串基因串(只包含ATCG),在其中插入任意个‘-’使得他们匹配.(所以一共是5种字符) 这5种字符两两之间有一个匹配数值,要求使这两个字符串的匹配值之和最大. 思路: dp[i][j]表示匹配了s1中前i个字符和s2中前j个字符的最大匹配值. 完成s1[i]与s2[j]的匹配只有三种可能. 1.s1[i]之前已经匹配好,s2[j]配‘-’.即dp[i][j] = dp[i][j-1]+sc…

题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140 分析: 本题一看就知道是一道动归,其实和字串距离非常的像,只不过多了题目规定的匹配相似度罢了. 匹配的相似度我们之间用一个二维数组读入即可 int shuzu[6][6]={{0,0,0,0,0,0},{0,5,-1,-2,-1,-3},{0,-1,5,-3,-2,-4},{0,-2,-3,5,-2,-2},{0,-1,-2,-2,5,-1},{0,-3,-4,-2,-1,0}}; PS:换行效果更佳.…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,…

每日一题 day23 打卡 Analysis dp[i][j]表示序列A中前i个与序列B中前j个匹配的相似度最大值 所以,dp方程很容易想到: 1.让a[i]与b[j]匹配 2.让a[i]与B序列中一个空位匹配 3.让b[j]与A序列中一个空位匹配 dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j-1]+form[a[i]][b[j]],dp[i-1][j]+form[a[i]][5],dp[i][j-1]+form[5][b[j]]); 对于初始化,就是分别让每个a[i]和每个b…

题意 : 题目链接 分析 :  可以观察到给出的配对代价表中对角线部分是正数 其余的都是负数,也就是说让相同字母的匹配的越多越好 即找出 LCS 但是这里 DP 的过程需要记录一下代价 有关 LCS 的一篇博客 ==> Click here 如果不是计算长度而是计算配对的价值,那么初始化的时候 记得将每一个串的字母作为结尾与空串配对的价值初始化一下 即 dp[i][0] 与 dp[0][i] #include<bits/stdc++.h> using namespace std; con…

分析 f[i][j] 表示 1数组的第i位和2数组的第j位匹配的最大值 f[1][1]=-2 f[2][1]=-2+5=3 f[3][1]=-2+5+5=8 三个决策: 1.由f[i-1][j-1]直接推得 2.a[i]位匹配'-' f[i][j]=Max(f[i-1][j]+v[4][a]); 3.b[j]位匹配'-' f[i][j]=Max(f) f[i][j]=f[i-1][j-1]+v[a[i]][b[j]] AC代码 // luogu-judger-enable-o2 #include…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以…

P4303 [AHOI2006]基因匹配 标签(空格分隔): 考试题 nt题 LCS优化 [题目] 卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球,这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成(地球上只有4种),而更奇怪的是,组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次!这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成,那么它的长度一定是5N. 卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦,而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题,于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序. 为了…