Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print ">"$0}' a.fasta|sed '/^$/d'>b.fasta (2)将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中: awk '/^>/{f=++d".fasta"} {print > f…

一.文件拆分 1.将一个文件按照规定的大小进行分割成多个文件并将被分割详细信息保存至配置信息中 Properties 类表示了一个持久的属性集.Properties 可保存在流中或从流中加载,属性列表中每个键及其对应值都是一个字符串. package ioDemo; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; im…

[root@tdh55 mnt]# cd /opt/[root@tdh55 opt]# ll -h-rw-r--r--. 1 root root 7.5G May 12 11:19 TDH-Image-Registry-Transwarp-5.1.2-final.tar.gz[root@tdh55 opt]# lsTDH-Image-Registry-Transwarp-5.1.2-final.tar.gz[root@tdh55 opt]# md5sum TDH-Image-Registry-T…

格式转换: use awk :awk 'BEGIN{P=1}{if(P==1||P==2){gsub(/^[@]/,">");print}; if(P==4)P=0; P++}' input.fastq > output.fasta FASTA文件拆分: 1. 从a.fasta中提取第10至第20个序列存到b.fasta中 - awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=20{print ">&…

C#文件的拆分与合并操作示例代码. 全局变量定义 ;//文件大小 //拆分.合并的文件数 int count; FileInfo splitFile; string splitFliePath; FileStream splitFileStream; FileInfo joinFile; string joinFliePath; FileStream joinFileStream; 拆分文件操作 private void CheckSplit_Click(object sender, Event…

文件的拆分与合并在开发中经常会用到,上传或是下载的时候都有这样的运用 文件拆分的思路 将文件大小拆分为n个文件 那么,每个文件的大小就是等大小的 如果文件大小被n除不尽,那么就使用n+1个文件来拆分 最后一个文件的大小就是整除不尽的那一部分数据 文件合并的思路 将拆分出来的全部文件胺顺序读取 挨个数据写入到指定文件中 所有文件数据写入完毕 那么合并就完成了 代码实现 布局文件(activity_main.xml) <LinearLayout xmlns:android="http://sc…

1.引用iTextSharp,用于拆分和合并pdf文件 using iTextSharp.text; using iTextSharp.text.pdf; 2.合并pdf //outMergeFile是pdf文件合并后的输出路径 //lstFile里存放要进行合并的pdf文件的路径 public static void mergePDFFiles(string outMergeFile, List<string> lstFile) { if (!Sql.IsEmptyString(outMer…

文件分割与合并是一个常见需求,比如:上传大文件时,可以先分割成小块,传到服务器后,再进行合并.很多高大上的分布式文件系统(比如:google的GFS.taobao的TFS)里,也是按block为单位,对文件进行分割或合并. 看下基本思路: 如果有一个大文件,指定分割大小后(比如:按1M切割) step 1: 先根据原始文件大小.分割大小,算出最终分割的小文件数N step 2: 在磁盘上创建这N个小文件 step 3: 开多个线程(线程数=分割文件数),每个线程里,利用RandomAccessF…

Goldengate的拆分与合并分类: ORACLE GoldenGate 2013-10-10 15:22 721人阅读 评论(0) 收藏 举报在使用Goldengate作为复制解决方案时,随着负载的增加,replicat组件常常是最先出现性能瓶颈的.为了适应不断增加的负载,就需要拆分replicat来实现并行复制,本文介绍Goldengate拆分的具体实施步骤.同时,作为拆分的逆向操作,介绍如何将拆分的多个replicat合并回一个replicat. 拆分的方式一般分为两种:一种是用gold…

文件分割与合并是一个常见需求,比如:上传大文件时,可以先分割成小块,传到服务器后,再进行合并.很多高大上的分布式文件系统(比如:google的GFS.taobao的TFS)里,也是按block为单位,对文件进行分割或合并. 看下基本思路: 如果有一个大文件,指定分割大小后(比如:按1M切割) step 1: 先根据原始文件大小.分割大小,算出最终分割的小文件数N step 2: 在磁盘上创建这N个小文件 step 3: 开多个线程(线程数=分割文件数),每个线程里,利用RandomAccessF…

引子 大文件拆分问题涉及到io处理.并发编程.生产者/消费者模式的理解,是一个很好的综合应用场景,为此,花点时间做一些实践,对相关的知识做一次梳理和集成,总结一些共性的处理方案和思路,以供后续工作中借鉴. 本文将尝试由浅入深的方式表述大文件拆分的问题及不同解决方案,给出的方案不一定是最优解,也并非线上环境论证过的靠谱方式,目的只是在于通过该问题融会贯通io.多线程等基础知识理论.生产环境请慎用. 本文不会逐行讲解代码实现,而注重在方案设计及思路探讨上,但会在文末附上源码demo git地址. 问…

引子 大文件拆分问题涉及到io处理.并发编程.生产者/消费者模式的理解,是一个很好的综合应用场景,为此,花点时间做一些实践,对相关的知识做一次梳理和集成,总结一些共性的处理方案和思路,以供后续工作中借鉴. 本文将尝试由浅入深的方式表述大文件拆分的问题及不同解决方案,给出的方案不一定是最优解,也并非线上环境论证过的靠谱方式,目的只是在于通过该问题融会贯通io.多线程等基础知识理论.生产环境请慎用. 本文不会逐行讲解代码实现,而注重在方案设计及思路探讨上,但会在文末附上源码demo git地址. 问…

spss-数据抽取-拆分与合并 数据抽取也成为数据拆分,是指保留.抽取原数据表中某些字段.记录的部分信息,形成一个新字段.新纪录.分为:字段拆分和随机抽样两种方法. 一:字段拆分 如何提取"身份证号码"字段.身份证号码里面包含了许多信息,例如省份.城市.出生日期.性别等等.我们将它抽取出来,就可以得到相应的字段.也就可以做相应的分析了.如用户的省份分布.出生日期.性别等. 大家都知道在excel中使用字符函数(right.mid.left)就可以将这些信息提取出来.那么在spss中该如…

目标如题,有多个fasta文件和一个文件名列表,将文件名列表中包含的文件匹配出来并提取第一条序列合并成一个fa文件. 这个采用perl实现,用法和代码如下: 1 #!/usr/bin/perl -w 2 use strict; 3 4 sub usage{ 5 die "usage:perl $0 <fa.list> <Fasta_Dir> <merged.fa>\n",unless(@ARGV==3); 6 } 7 usage(); 8 9 ope…

PDF文件介绍 PDF(Portable Document Format )文件源于20世纪90年代初期,如今早已成为了一种最流行的的文件格式之一.因为PDF文件有很多优点: 支持跨平台和跨设备共享 可以通过密码保护方式来阻止复制和编辑 将各种文本文档.图片.音频.三维地图等合并为一个PDF文件时,依然可以完好的保存所有的源文件信息等 因此,有些时候为了方便共享文件,你可能需要把其他格式的文件如Word,Excel以及 PowerPoint文件转换为PDF格式.本文将向你介绍如何使用Spire.…

今天在发布web网站的时候 使用了“将各个文件夹输出合并到其自己的程序集”的选项,如图: 开始在 程序集前缀(可选)处,没有填写内容. 发布到IIS后出现未加载到程序集xxxx的错误. 经过各种调试,才发现是我的一个文件夹起名叫System,使用了关键字,结果生成了System.dll,与framework中的System.dll冲突了. 加上了一个前缀就解决了.生成的dll名称为FY.System.dll 以上,备忘.…

最近遇到一个问题,剧情动画文件大了复杂了之后,每次修改输出很麻烦,导出fbx就需要20分钟. 所以我想到了一个比较好的解决方法,在unity这边解决.把动画文件拆分成若干份,然后赋予不同的层并行播放 当要修改某个角色或者某几个角色的动画只要输出一小部分就可以了 为了测试可行性,我使用了一个跑动的模型动画进行测试,一共复制了20份,分别用多层动画(20层)和单个动画来播放,测试性能 即一个动画剪辑控制20个人跑动,和20个人由20个动画剪辑控制跑动 单个动画测试结果:(每帧耗时2.5毫秒左右) 多…

(Sql Server)数据的拆分和合并 背景: 今天遇到了数据合并和拆分的问题,尝试了几种写法.但大致可分为两类:一.原始写法.二.Sql Server 2005之后支持的写法.第一种写法复杂而且效率低下,不推荐.所以下面具体讲一下第二种写法. 数据的拆分: 再讲拆分前,首先先介绍两个函数:cross apply和outer apply.这两个函数作用是交叉连接.这两个函数是在sql server 2005之后才有的,在2000与之相似的功能是cross join.虽然相似,但是cross j…

结合最近Disruptor的学习,和之前一直思考解决的大文件拆分问题,想到是否可以使用Disruptor作为生产者/消费者传递数据的通道呢?借助其高效的传递,理论上应当可以提升性能.此文便是此想法的落地实现. 问题描述 将大文件按照指定大小拆分为若干小文件.具体可参考:大文件拆分方案的java实践(附源码). 方案设计 设计简图 如下: 核心组件 FileReadTask —— Disruptor的生产者线程,负责读取源文件,: Disruptor —— FileReadTask和FileLin…

时间飞逝,马上就要到2018年了,今天我们将要学习的是IO流学习的最后一节,即总结回顾前面所学,并学习一个案例用于前面所学的实际操作,下面我们就开始本节的学习: 一.原理与概念 一.概念流:流动 .流向 从一端移动到另一端 源头与目的地程序 与 文件|数组|网络连接|数据库 ,以程序为中心 二.IO流分类1.流向: 输入流与输出流2.数据:字节流:二进制,可以一切文件 包括 纯文本 doc 音频.视频等等 字符流:文本文件,只能处理纯文本3.功能:节点:包裹源头 处理:增强功能,提供性能三.字符…

一.综述 c语言操作文件通过文件指针FILE*,每个要操作的文件必须打开然后才能读写. 注意事项: @1分割与合并文件最好使用二进制模式即"rb"或"wb",这样可以操作任何类型文件 @2FILE 指针一定要进行判空操作即看F == NULL成立不 @3文件用完必须关闭,释放系统资源,因为文件会分配缓冲区,占据内存 1.包含头文件 _CRT_SECURE_NO_WARNINGS表示关闭安全检查 #define _CRT_SECURE_NO_WARNINGS #inc…

读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT>chr2ATATATATATCGCGCGCGCG>chr3ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT>chr4ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG>chr5ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCG…

一个PDF文件有很多个PDF页面组成,有时候我们只需要单个页面的时候应该怎么做呢,这个时候就需要拆分PDF文件了,那么如何把 PDF文件拆分为多个文件呢,应该有很多的小伙伴都想知道吧,那就让我们一起来看看. 方法一:PDF编辑器http://bianji.xjpdf.com/   1.在网上搜索并下载一款PDF编辑器.之后安装编辑器在电脑中,软件安装完成之后打开运行迅捷PDF编辑器,之后在编辑器中打开PDF文档.   2.文档打开之后我们需要找到软件中的编辑工具.选择菜单栏的文档工具,可以看到文…

java大文件拆分工具(过滤掉表头) import java.io.BufferedReader; import java.io.BufferedWriter; import java.io.FileReader; import java.io.FileWriter; import java.io.IOException; public class SplitTools { public static void main(String[] args) throws IOException { /…

  vim 将文件所有行合并到一行   在 Normal Mode下执行: ggvGJ gg 用于跳到行首 v 转换成 visual 模式 G 跳到最后一行 J 合并行…

文件排序 seq: 产生一系列的数字; man seq查看其具体使用.我们这使用seq产生下游分析所用到的输入文件. # 产生从1到10的数,步长为1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为1,用空格分割 $ seq -s ' ' 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为2 # 如果有3个数,中间的数为步长,最后一个始终为最大值 $ seq -s ' ' 1 2 10 1 3 5 7 9 $ cat…

流的使用分割与合并文件的函数 unit Unit1; interface uses Windows, Messages, SysUtils, Variants, Classes, Graphics, Controls, Forms, Dialogs, StdCtrls; type TForm1 = class(TForm) Button1: TButton; Button2: TButton; procedure Button1Click(Sender: TObject); procedure…

BIMFACE中矩形空间拆分与合并 应用场景 在BIM运维场景中,空间同设备一样,作为一种资产被纳入运维管理体系,典型的应用场景例如商铺.防火分区等,这就涉及到空间的拆分和合并,在bimface中,已经实现了空间的动态调整,但是距离自定义的,较为直观的空间拆分与合并,目前的处理方式还不能够满足业务场景的需求,于是自行完成了基于bimface的矩形空间的拆分与合并的实现过程. 空间拆分与合并拆分空间监听模型单击事件1清除原有空间点击计数根据两点绘制直线2任意两点决定直线走向计算直线在坐标系中的斜率…

用git合并分支时,如何保持某些文件不被合并_fkaking的专栏-CSDN博客_git 合并分支 https://blog.csdn.net/fkaking/article/details/44955663…

最近要对视频进行上传,由于涉及到的视频非常的大,因此采用的是分片上传的格式,下面是一个简单的例子: split.php <?php $i = 0; //分割的块编号 $fp = fopen("abc.wmv","rb"); //要分割的文件 $file = fopen("split_hash.txt","a"); //记录分割的信息的文本文件 while(!feof($fp)) { $handle = fopen(&qu…