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基本运算符号  1.基本数学计算  +.-.*./.^.%%(求模).%/%(整除)  注意:求模运算两边若为小数,则整数和小数部分分别求模.例:5.6%%2.2  2.比较运算  >.<.>=.<=.==.!=  3.&.|.!.&&.||.xor  注意:运算符"逻辑与"和"逻辑或"存在两种形式,"&"和"|"作用在对象中的每一个元素上并且返回和比较次数相等长度的逻辑…
R语言系列:生成数据 (2014-05-04 17:41:57) 转载▼ 标签: r语言 教育 分类: 生物信息 生成规则数据1.使用“:“,如x=1:10,注意该方法既可以递增也可以递减,如y=10:12.seq,有两种用法:①seq(起点,终点,步长); ②seq(length=9, from=1, to=5)    seq还有一种简写:seq(x)    #相当于1:length(x),但当length(x)为0时,返回integer(0)3.c(1,2,8)4.使用scan(),可以等待…
数据探索 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到程序: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程[Vim编辑器](http://www.shiyanlou.com/courses/2)3. R:在命令行输入‘R’  进入R语言…
R语言分析朝阳医院数据 本次实践通过分析朝阳医院2016年销售数据,得出“月均消费次数”.“月均消费金额”.“客单价”.“消费趋势”等结果,并据此作出可视化图形. 一.读取数据: library(openxlsx) #1.读取目标数据 salesData <-read.xlsx("D:/test/朝阳医院2016年销售数据.xlsx,sheet=1") 二.对数据进行预处理: 1.列名重命名:打开excel表格发现列名都是中文名称,所以这里要对列名进行修改. names(sale…
R语言实现金融数据的时间序列分析及建模 一 移动平均    移动平均能消除数据中的季节变动和不规则变动.若序列中存在周期变动,则通常以周期为移动平均项数.移动平均法可以通过数据显示出数据长期趋势的变动规律.   R可用filter()函数做移动平均.用法:filter(data,filter,sides) 1.简单移动平均   简单移动平均就是将n个观测值的平均数作为第(n 1)/2个的拟合值.当n为偶数时,需进行二次移动平均.简单移动平均假设序列长期趋势的斜率不变.    以我国1992到20…
R语言处理Web数据 许多网站提供的数据,以供其用户的消费.例如,世界卫生组织(WHO)提供的CSV,TXT和XML文件的形式的健康和医疗信息报告.基于R程序,我们可以通过编程提取这些网站的具体数据.R中一些程序包,用来提取网络数据形式- "RCurl",XML", 和"stringr". 它们被用于连接到的URL,确定所需链接的文件,并将它们下载到本地环境. 安装R程序包 下面的软件包都需要处理的URL和链接文件.如果它们没有R环境中,可以使用下面的命令…
上周在中国R语言大会北京会场上,给大家分享了如何利用R语言交互数据可视化.现场同学对这块内容颇有兴趣,故今天把一些常用的交互可视化的R包搬出来与大家分享. rCharts包 说起R语言的交互包,第一个想到的应该就是rCharts包.该包直接在R中生成基于D3的Web界面. rCharts包的安装 require(devtools) install_github('rCharts', 'ramnathv') rCharts函数就像lattice函数一样,通过formula.data指定数据源和绘图…
在数据挖掘的过程中,数据预处理占到了整个过程的60% 脏数据:指一般不符合要求,以及不能直接进行相应分析的数据 脏数据包括:缺失值.异常值.不一致的值.重复数据及含有特殊符号(如#.¥.*)的数据 数据清洗:删除原始数据集中的无关数据.重复数据.平滑噪声数据.处理缺失值.异常值等 缺失值处理:删除记录.数据插补和不处理 主要用到VIM和mice包 install.packages(c("VIM","mice")) 1.处理缺失值的步骤 步骤: (1)识别缺失数据:…
时间序列与数据挖掘 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程Vim编辑器3. R:在命令行输入‘R’进入交互式环境,下面的代码都是在交互式环境运行4. 数据:在命令行终端输入以下命令:…
异常值检测 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到程序: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程[Vim编辑器](http://www.shiyanlou.com/courses/2)3. R:在命令行输入‘R’进入交互式环…
介绍 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到程序: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程[Vim编辑器](http://www.shiyanlou.com/courses/2)3. R:在命令行输入‘R’进入交互式环境,下…
数据解析 XML是一种可扩展标记语言,它被设计用来传输和存储数据.XML是各种应用程序之间进行数据传输的最常用的工具.它与Access,Oracle和SQL Server等数据库不同,数据库提供了更强有力的数据存储和分析能力,例如:数据索引.排序.查找.相关一致性等,它仅仅是存储数据.事实上它与其他数据表现形式最大的不同是:它极其简单,这是一个看上去有点琐细的优点,但正是这点使它与众不同. 针对XML格式数据,R语言XML包可以对其进行数据导入与处理,详见下面的案例说明. 案例1 直接输入一段标…
Data Frame一般被翻译为数据框,感觉就像是R中的表,由行和列组成,与Matrix不同的是,每个列可以是不同的数据类型,而Matrix是必须相同的. Data Frame每一列有列名,每一行也可以指定行名.如果不指定行名,那么就是从1开始自增的Sequence来标识每一行. 初始化 使用data.frame函数就可以初始化一个Data Frame.比如我们要初始化一个student的Data Frame其中包含ID和Name还有Gender以及Birthdate,那么代码为: studen…
#安装R语言R3.3版本会出现各种so不存在的问题,退回去到R3.1版本时候就顺利安装.在安装R环境之前,先安装好中文(如果没有的话图表中显示汉字成框框了)和tcl/tk包(少了这个没法安装sqldf)sudo yum install fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel -y安装中文字体后重新加载 service xfs reload (不过在有台机器上总是失败,后来重启机器OK)sudo service xfs reload有些包会需要rg…
1.读文本文件数据 (1)先设置工作目录,把文本文件放于该目录下 备注:在记事本里写完数据后,按一下回车,负责在R语言中出现错误 (2)读剪贴板 文本或EXCEL的数据均可通过剪贴板操作 (3)读excel文件数据 方法1:先把excel另存为空格分隔符的prn文件格式再读     方法2:安装RODBC包,再通过ODBC读…
假设有如下数据,我们使用plot函数作图 月龄 体重 月龄 体重  1 4.4 9 7.3 3 5.3 3 6.0 5 7.2 9 10.4 2 5.2 12 10.2 11 8.5 3 6.1 R语言中默认函数 abs   绝对值 sqrt   平方根 exp  e^x次方 log   自然对数 log2 log10  其他对数 sin  cos tan 三角函数 sinh cosh tanh  双曲函数 poly  正交多项式 polyroot  多项式求根 assign   赋值操作 等同…
一.R是什么 R语言是由新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和Robert Gentleman两个人共同发明. 其词法和语法分别源自Schema和S语言. R定义:一个能够自由幼小的用于统计计算和绘图的语言和环境,它提供了广泛的统计分析和绘图技术. 二.R的优势 国际上R语言已然是专业数据分析领域的标准. 1.R是免费的开源软件. 2.全面的统计研究平台,提供了各种各样的数据分析技术. 3.R是一个程序设计语言,所以他的能力可以很容易地通过使用用户定义的函数扩展. 4.R拥有顶尖水准的制图功能…
数据对象 创建向量相关的方法 R语言的向量用法非常像python, 就比如这个seq(0,10,2), 从0到10, 步长为2, 涉及到的元素作为向量里的内容进行创建. 这里的用法非常像Matlab, 可以直接对向量进行科学计算. (我记得在python里类似这样的乘法是"重复"的作用, 也就是(1,2,3)会变成(1,2,3,1,2,3,1,2,3)) rep方法, 例子如下, 创建一个向量, 连续5个100, 然后是连续2个200, 然后是连续3个300 runif方法会取n个随机…
Twitter开源的时序数据突变检测(BreakoutDetection),基于无参的E-Divisive with Medians (EDM)算法,比传统的E-Divisive算法快3.5倍以上,并且具有鲁棒统计性,就是你加入一些离群点或异常点,并不影响该算法的检测效果,不过最关键的还是无参特性,有时候调参真是件摸着石头过河的事. 它认为突变有两种方式: 1.Mean Shift:突然跳变,比如CPU从40%一跃跳变为60%,像佛教里讲的“顿宗” 2.Ramp Up:缓慢从一个平稳状态渐变到另…
Data Frame一般被翻译为数据框,感觉就像是R中的表,由行和列组成,与Matrix不同的是,每个列可以是不同的数据类型,而Matrix是必须相同的. Data Frame每一列有列名,每一行也可以指定行名.如果不指定行名,那么就是从1开始自增的Sequence来标识每一行. 初始化 使用data.frame函数就可以初始化一个Data Frame.比如我们要初始化一个student的Data Frame其中包含ID和Name还有Gender以及Birthdate,那么代码为: studen…
回归 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到程序: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程Vim编辑器3. R:在命令行输入‘R’进入交互式环境,下面的代码都是在交互式环境运行. 3. 环境使用 使用R语言交互式环境输入实验…
决策树和随机森林 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到程序: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程Vim编辑器.3. R:在命令行终端输入‘R’,进入R的交互式环境,下面的代码都是在交互式环境运行. 3. 环境使用 使用…
介绍 一.实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录,系统用户名shiyanlou,密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境,实验中会用到程序: 1. LX终端(LXTerminal): Linux命令行终端,打开后会进入Bash环境,可以使用Linux命令2. GVim:非常好用的编辑器,最简单的用法可以参考课程Vim编辑器3. R:在命令行输入‘R’即可进入交互式环境,下面的代码都是在交互式环境运行. 3. 环境使用 使用R语言交互式环境输入…
在用R语言做各种事物时,用户自定义函数是不可或缺的.这期来讲讲如何自定义R的function.首先要介绍的是function的基本框架: myfunction <- function(arg1, arg2, ... ){ statements return(object) } 1 2 3 4 函数名称为myfunction arg1,arg2 为参数 statements 为函数语句 return(object)返回结果 两个例子 例子一:随机数产生,画图 function1 <- funct…
向量 euro    #欧元汇率,长度为11,每个元素都有命名 landmasses    #48个陆地的面积,每个都有命名 precip    #长度为70的命名向量 rivers    #北美141条河流长度 state.abb    #美国50个州的双字母缩写 state.area    #美国50个州的面积 state.name    #美国50个州的全称 因子 state.division    #美国50个州的分类,9个类别 state.region    #美国50个州的地理分类…
在生成序列时,“:”的优先级最高 (1)从1到20的整数序列: > 1:20 [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 (2)用函数seq生成实数等差序列:(两种表示方法) seq(start,end,d)     start表示起点,end表示终点,d表示步长. > seq(1,20,2) [1] 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19> seq(1,20,3)[1] 1 4 7 10 13 16 19 &g…
R通过RJDBC包连接Hive 目前Hive集群是可以通过跳板机来访问 HiveServer, 将Hive 中的批量数据读入R环境,并进行后续的模型和算法运算. 1. 登录跳板机后需要首先在Linux下进行配置 从root权限切换到bzsys用户,才能够通过验证读取Hive.首先需要配置Hadoop的临时环境变量CLASSPATH路径 su bzsys export CLASSPATH=$CLASSPATH:/etc/hadoop/conf 2. 下载并安装RJDBC包 Linux下直接运行R的…
主要学习如何把几种常用的数据格式导入到R中进行处理,并简单介绍如何把R中的数据保存为R数据格式和csv文件. 1.保存和加载R的数据(与R.data的交互:save()函数和load()函数)a <- 1:10save(a, file = "data/dumData.Rdata") # data文件为当前工作目录下的文件,必须存在rm(a)load("data/dumData.Rdata")print(a) 2.导入和加载.csv文件(write.csv()函…
1.R中安装RODBC包 install.packages("RODBC") 2.在Windows系统下安装MySQL的ODBC驱动 注意区分32位和64位版本: http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc 3.ODBC的系统配置 在Windows操作系统下:控制面板->管理工具->数据源(ODBC)->双击->添加->选中mysql ODBC driver一项 填写:data source name 一项填…
1.键盘输入数据(适合小数据集) #创建一个指定模式但不含数据的变量 mydata<-data.frame(age=numeric(0),gender=character(0),weight=numeric(0)) #键盘输入变量 mydata<-edit(mydata) #另一种键盘输入模式 fix(mydata) 2.读取不同格式的数据 (1)TXT文件 read.table()函数从带分隔符的文本文件中导入数据,此函数读入一个表格格式的文件并将其保存为一个数据框 (2)CSV文件 rea…