系综的实现方式(nve、nvt、npt)】的更多相关文章

一.NVE系综 更新位置和速度,v和e恒定. 二.NVT系综 几种实现的方式: 如: fix 1 all nve #更新位置和速度,e和V保持不变.若只有这个命令,就只nve系综,如果和控温命令一起,就是nvt系综.fix 2 all langevin 298.0 298.0 1000 699411 #控温,fix ID group-ID langevin Tstart Tstop damp seed keyword values 这里温度不变,恒温298k.1000表示摩擦系数. 三.NPT系…
这是mdp文件系列的第二篇,介绍nvt平衡中要使用的mdp文件. 先上代码,nvt.mdp 1 title = OPLS Lysozyme NVT equilibration 2 define = -DPOSRES 3 ; Run parameters 4 integrator = md 5 nsteps = 50000 6 dt = 0.002 7 ; Output control 8 nstxout = 500 9 nstvout = 500 10 nstenergy = 500 11 ns…
1.收敛性测试 (1)由不同尺寸模型(不同的原子数)和E的关系曲线,再确定尺寸n*n*n: 2.优化结构(nve-nvt-npt) 系综的实现方式(相关命令):https://www.cnblogs.com/sysu/p/10808805.html: 三种系综都要设置,依次进行(nve-nvt-npt): 判断是否已经优化的两种方式: (1)步数和E的关系曲线: (2)结构(原子有没有乱动,没有,则说明优化较好): 3.in设置并提交计算——数据处理 根据自己的需要设定模拟条件,run.....…
总括: 一帧视频数据可以编码成多个H264的NALU, 每个NALU的开头为00 00 00 01: 一个RTP包可以传送 部分.一个或多个 NALU,看NALU的大小而定. 之前写过一篇文章,分析了h264使用rtp进行封包的格式介绍:RTP封装h264 (见下面).但里面好像没有把拆分以及一些需要注意的情况说清楚,因此这里做补充,也作为自己的备忘(自己记性好像不太好). 关于时间戳,需要注意的是h264的采样率为90000HZ(被标准固定死的,为了方便转换成npt时间,见维基百科:https…
转自huan.gu专栏:http://blog.csdn.net/gh320/article/details/17174769 EBS中使用JAVA方式发送HTML格式邮件 一.开发工具:JDeveloper 需要添加的Library:activation.jar和javax.mail.jar(自行下载) 二.注意事项: 1.设置项目的编码格式为UTF-8 2.使用Rebuiled或者run生成.class文件 3.将.class文件上传到服务器中的$JAVA_TOP目录相应的文件夹下 三.开发…
原理: jQuery的ajax请求:complete函数一般无论服务器有无数据返回都会显示(成功或者失败都显示数据): return result…
@echo off rem  通过adb方式截图rem  需要安装adb ,一般安装了android sdk 默认带了adb ,路径为sdk目录的android-sdk\platform-toolsrem  @author  lujian rem  文件保存名称Set FileSaveName=%Date:~0,4%-%Date:~5,2%-%Date:~8,2%_%time:~0,2%%time:~3,2%%time:~6,2% rem  文件保存在个人电脑地址,固定目录rem Set Fil…
配置好权限文件 [root@test bin]# cd $JAVA_HOME/bin [root@test bin]# vim jstatd.all.policy grant codebase "file:${java.home}/../lib/tools.jar" { permission java.security.AllPermission; }; 执行命令启动 jstatd -J-Djava.security.policy=jstatd.all.policy 查看1099端口是…
在WPF中使用依赖注入的方式创建视图 0x00 问题的产生 互联网时代桌面开发真是越来越少了,很多应用都转到了浏览器端和移动智能终端,相应的软件开发上的新技术应用到桌面开发的文章也很少.我之前主要做WPF,今年开始学习Web应用开发,于是就接触到了.NET Core,其中的很多概念很值得在桌面开发中借鉴.例如在.NET Core MVC中,Controller的依赖是通过构造函数注入的,注入的过程由框架实现,我们在写Controller时只要在构造函数参数中罗列出要依赖的服务即可,进一步的,把服…
UWP中新加的数据绑定方式x:Bind分析总结 0x00 UWP中的x:Bind 由之前有过WPF开发经验,所以在学习UWP的时候直接省略了XAML.数据绑定等几个看着十分眼熟的主题.学习过程中倒是也没遇到麻烦.直到在园子里看到了这篇文章: http://www.cnblogs.com/gaoshang212/p/4534138.html 原来UWP的绑定中新加了个x:Bind,从文章中可以看到x:Bind的效率是很高的.找到MSDN(数据绑定)看了一下(完整的学习目录可参见: http://w…