下载pubmed数据】的更多相关文章

1 import requests 2 import json 3 4 search_url = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&mindate=1800/01/01&maxdate=2016/12/31&usehistory=y&retmode=json" 5 search_r = requests.post(search_url) 6 sear…
最近用Ubunt也遇到这个问题,搜到这个答案 参考原文链接: http://forum.ubuntu.org.cn/viewtopic.php?t=387865 2.移除“下载额外数据不成功”的恼人提示通知,方法:$cd /usr/share/package-data-downloads/$sudo rm * -rf$cd /var/lib/update-notifier/package-data-downloads/$sudo rm * -rf$cd /var/lib/update-notif…
网络下载拉取数据中,json数据是一种格式化的xml数据,非常轻量方便,效率高,体验好等优点,下面就android中如何从给定的url下载json数据给予解析: 主要使用http请求方法,并用到HttpGet和HttpResponse等对象来获取数据.直接上实例代码吧:. (1)从网络URL上读取json字符串的实现 public String readJSONFeed(String url){ StringBuilder stringBuilder = new StringBuilder();…
参考自经过几天的摸索,终于得出安装flashplugin-installer的方法 移除"下载额外数据不成功"的恼人提示通知,方法: $cd /usr/share/package-data-downloads/ $sudo rm * -rf $cd /var/lib/update-notifier/package-data-downloads/ $sudo rm * -rf $cd /var/lib/update-notifier/user.d/ $sudo rm data-downl…
同事用java开发了一个系统,其中有一个功能是下载大约10万笔数据到Excel中.当上线后,很多用户反映下载数据量大的时候就不能成功,但有时可以,所以结论就是系统不稳定,这个问题拖了很久没有解决. 在与这个系统的开发人员看了下代码后,知道下载excel用的是apache中的POI组件.原来的代码逻辑是将要下载的数据整个从数据库捞出来,然后循环一笔笔地调用POI的API生成cell, row,全部完成了,再输出到客户端的流中.监控发现,一旦下载时,java虚机所占用的内存直线上升,且很久都不会降下…
  今天要上NCBI下载sra数据发现没有下载的链接,网上查发现都是老的方法,NCBI页面已经变更,于是看了NCBI的help,并且记录下来新版的sra数据下载方法,要用NCBI的工具SRA Toolkit.另外咨询师兄,总结得到新的wget下载的方法. 方法1 NCBI告知的方法(中断不能继续下载) 下载SRA Tookit https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software:点击software,选择需要的sra t…
解决Ubuntu“下载额外数据文件失败 ttf-mscorefonts-installer”的问题 发表于 2017-09-15 | 更新于 2018-04-29 | 分类于 Linux | 评论数: 0 | 阅读次数: 最近开机总是遇到一段提示,内容大概是这样: 下载额外数据文件失败以下软件包要求安装后下载附加数据,但其数据无法下载或无法处理.ttf-mscorefonts-installer稍后系统将自动重试下载,您也可以手工立即重试.执行此命令需要有活动的网络连接. 开始也挺烦恼,总是解决…
最近需要下载一大批GEO上的数据,问题是我要下载的Methylation数据根本就没有sra文件,换言之不能使用Aspera之类的数据进行下载.但是后来我发现了GEOquery这个不错的R包,不知道是网络问题还是怎么,GEOquery有时候运行也不太稳定,但是总体来说,很好地解决了我的问题. 首先假设我们想要下载的数据是GSE77445,这是一批DNA甲基化数据,我们可以在R语言中安装GEOquery之后,载入R包,然后直接输入: Data <- getGEO("GSE77445"…
最近有在做 stream 下载,并且边下载 stream 边处理功能.解析二进制的功能.最初参考了 flv.js 的 flv stream 下载处理功能,发现他并没有使用的 XMLHttpRequest 的 responseType = 'arraybuffer' 这个功能,而是使用的fetch api 里面的 body.getReader API.(fetch 支持一边下载二进制数据一边处理) 后来查询了资料发现, XMLHttpRequest 里不支持下载 stream 的同时边处理的 st…
这段时间做了一些利用地理信息进行定位导航的系列工作,其中很重要的一部分是如何获取到地图数据,比如道路的矢量图.某一区域的栅格图,我用到的主要工具是QGIS.QGIS是一个跨平台的免费应用,其中集成了对矢量图.栅格图处理的很多功能,同时也集成了很多开放地图数据网站的接口,比如OpenStreetMap等,因此,在获取数据,并处理成我们需要的格式方面非常便利.本篇博文主要介绍如何使用QGIS下载数据,并处理成特定的格式. 一. 指定区域指定地物矢量图获取 我们经常会遇到这样一种需求:获取某一区域的指…