BiNGO的GO分析】的更多相关文章

GO富集分析对老师们来说想必都不陌生,几乎在任何项目中都会出现.今天就给大家介绍一款简单易学又好用的富集分析小软件---BiNGO.它是Cytoscape软件中很出色的一个插件.它提供的结果中除了文本格式的富集分析结果外,还会将结果以网络图的形式展现,非常美观. 第一, 安装BiNGO插件. 打开Cytoscape软件,点击选项栏“Apps”-“AppManager”,选择“BinGO”,点击“Install”,就可以下载了.可能会稍微有一点慢,请耐心等待一下. 下载完成后,在“Apps”的下拉…
在 STL 源码中,到处可见 Traits 的身影,其实 Traits 不是一种语法,更确切地说是一种技术. STL库中,有一个函数叫做 advance, 用来将某个迭代器(具有指针行为的一种 class)移动 某个给定的距离.声明如下: template <typename IterT, typename DistT>  // 将迭代器向前移动 d 单位 void advance(IterT& iter,  DistT d);                  // 如果 d <…
两个连在一起的序列 [first, middle) 和 [middle, last) 都已经排序, 归并排序最核心的算法就是 将 [first, middle) 和 [middle, last) 在 O(N)时间内合并成一个有序数组. 但是合并的过程中一般需要  m + n 的额外辅助空间.其中, m . n 是数组的左右半边的长度. 现在假如, 1〉 辅助空间 bufSize < m + n 呢, 但是比 min(m, n) 大.也就是说能够容纳序列1 或者 序列 2. 2〉 bufSize…
这次研究了一下intset.研究的过程中,一度看不下过去,可是还是咬牙挺过来了.看懂了也就是那么回事.静下心来,切莫浮躁 Redis为了追求高效,在存储下做了非常多的优化,像intset就是作者为了节约内存定制的数据结构,包含后面将要阅读的压缩列表. intset是一个有序的整数集,提供了添加,删除,查找的接口,针对uint16_t uint32_t uint64_t,提供了不同编码的转换(严格的说仅仅是类型的提升) 首先.看一下它的结构定义: typedef struct intset { u…
转:http://tivan.iteye.com/blog/1487855 前言 在平时开发.测试过程中.甚至是生产环境中,有时会遇到OutOfMemoryError,Java堆溢出了,这表明程序有严重的问题.我们需要找造成OutOfMemoryError原因.一般有两种情况: 1.内存泄露,对象已经死了,无法通过垃圾收集器进行自动回收,通过找出泄露的代码位置和原因,才好确定解决方案:2.内存溢出,内存中的对象都还必须存活着,这说明Java堆分配空间不足,检查堆设置大小(-Xmx与-Xms),检…
前言 在平时开发.测试过程中.甚至是生产环境中,有时会遇到OutOfMemoryError,Java堆溢出了,这表明程序有严重的问题.我们需要找造成OutOfMemoryError原因.一般有两种情况: 1.内存泄露,对象已经死了,无法通过垃圾收集器进行自动回收,通过找出泄露的代码位置和原因,才好确定解决方案:2.内存溢出,内存中的对象都还必须存活着,这说明Java堆分配空间不足,检查堆设置大小(-Xmx与-Xms),检查代码是否存在对象生命周期太长.持有状态时间过长的情况.以上是处理Java堆…
非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实…
GO的主要用途之一是对基因组进行富集分析.例如,给定一组在特定条件下上调的基因,富集分析将使用该基因组的注释发现哪些GO术语被过度表示(或未充分表示). 富集分析工具    用户可以直接从GOC网站的主页进行浓缩分析.此服务连接到PANTHER分类系统的分析工具,该分类系统使用GO注释进行最新维护.PANTHER分类系统在Mi H等人,PMID:23868073中有详细说明.支持基因ID的列表可以从PANTHER网站获得. 使用GO富集分析工具 1.粘贴或键入要分析的基因的名称,每行一个或用逗号…
一次使用Eclipse Memory Analyzer分析Tomcat内存溢出 前言 在平时开发.测试过程中.甚至是生产环境中,有时会遇到OutOfMemoryError,Java堆溢出了,这表明程序有严重的问题.我们需要找造成OutOfMemoryError原因.一般有两种情况: 1.内存泄露,对象已经死了,无法通过垃圾收集器进行自动回收,通过找出泄露的代码位置和原因,才好确定解决方案:2.内存溢出,内存中的对象都还必须存活着,这说明Java堆分配空间不足,检查堆设置大小(-Xmx与-Xms)…
https://blog.csdn.net/weixin_39655765/article/details/80058644#jump1 make smdkc100_defconfig     以被默认支持的smdkc100单板为背景分析u-boot v2018.01 参考图1可知uboot code链接顺序: 图1 u-boot.lds                       一.sections.c (arch\arm\lib) 第24行: char __image_copy_start…